| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,623,383 | G→A | 5.9% | intergenic (‑27/+23) | PP_1422 ← / ← PP_1423 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,623,383 | 0 | G | A | 5.9% | 254.5 / 3.8 | 85 | intergenic (‑27/+23) | PP_1422/PP_1423 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/37); new base A (3/2); total (46/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
CCGCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACCGC > NC_002947/1623239‑1623528 | ccGCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCca > 1:193188/1‑148 (MQ=255) ccTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGt > 7:268018/1‑149 (MQ=255) cTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGGTTGTTCATGGGGATGTCGACCGCAGTGGTGGTGCGGCCGCGCGACCGGGGTg > 8:138384/1‑149 (MQ=255) ggATGCTCAACGCAACCTCGCGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGATTGAACCAACTCGGCCAGCTAGTTCATGGGCATGTCTAGCGCAGTGGAGGTGCGGCCCCGCCACAGGCGTgggg > 4:256863/1‑147 (MQ=255) gATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAg < 8:2079/149‑1 (MQ=255) cTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTg < 7:211237/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCATCTCGGCCAGCTTGTTCTTGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTgggg < 1:215540/141‑1 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTgggg > 2:215540/1‑141 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTgg > 1:349167/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTgg > 1:252485/1‑149 (MQ=255) aCCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCt < 7:167637/149‑1 (MQ=255) aCCTCGGGCAGGGCTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCt < 2:349167/149‑1 (MQ=255) cTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGc > 6:81417/1‑132 (MQ=255) cTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGc < 5:81417/132‑1 (MQ=255) cTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTg > 6:82647/1‑148 (MQ=255) aaGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTc‑‑‑c < 8:315786/148‑1 (MQ=255) aGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTc‑‑‑cc > 1:49026/1‑149 (MQ=255) gCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTAATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑cgcg > 3:53107/1‑149 (MQ=255) aGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGt > 6:233438/1‑149 (MQ=255) aGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGt < 1:184298/149‑1 (MQ=255) tctccttgTCATCCTTTTCTATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTTAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTAGCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGt < 8:177485/141‑1 (MQ=255) ggACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTc‑‑‑ccggt‑cccggt > 7:88623/1‑148 (MQ=255) cAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGAGGCCCCGCAACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTcaga > 7:177485/1‑145 (MQ=255) tCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGt < 2:252485/149‑1 (MQ=255) aTCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGt > 2:121868/1‑147 (MQ=255) aTCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTaa < 2:193188/149‑1 (MQ=255) tCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAg < 2:68601/149‑1 (MQ=255) ccTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAgg > 8:9211/1‑149 (MQ=255) cTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTgg > 7:206512/1‑119 (MQ=255) cTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTgg < 8:206512/119‑1 (MQ=255) ttttCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAgg > 5:243198/1‑147 (MQ=255) cGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGt > 4:242611/1‑149 (MQ=255) gATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGt < 5:30900/148‑1 (MQ=255) aTGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGt > 7:2585/1‑147 (MQ=255) gTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTgg < 8:171772/107‑1 (MQ=255) gTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTgg > 7:171772/1‑107 (MQ=255) tCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTCTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTaa < 1:330889/133‑1 (MQ=255) tCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTATTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTaa > 2:330889/1‑133 (MQ=255) gAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGc < 5:7973/149‑1 (MQ=255) aGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTg > 4:96753/1‑147 (MQ=255) aGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTg > 5:219781/1‑147 (MQ=255) gCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAg > 4:337242/1‑149 (MQ=255) gCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGAGGTCAAGTTCGTAAGGAAGGGTCAGCACCTGCAg > 8:241702/1‑149 (MQ=255) caTTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCACCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTc < 1:131416/135‑1 (MQ=255) aaTTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCACCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTc > 2:131416/1‑136 (MQ=255) tgCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCgg < 2:49026/148‑1 (MQ=255) aaCCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTc < 3:48829/148‑1 (MQ=255) aCCAACTTGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCg < 3:256863/148‑1 (MQ=255) aCCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTc > 6:369914/1‑147 (MQ=255) aCCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGa < 6:157437/149‑1 (MQ=255) ccAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAg < 7:241702/149‑1 (MQ=255) ccAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGCATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAg > 4:4255/1‑149 (MQ=255) cAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTc‑‑‑c < 8:355444/92‑1 (MQ=255) cAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTc‑‑‑c > 7:355444/1‑92 (MQ=255) aaCTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGc > 3:290795/1‑149 (MQ=255) aCTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCt > 4:56327/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCt > 1:168269/1‑123 (MQ=255) ggCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCt < 2:168269/123‑1 (MQ=255) gCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTc > 6:311943/1‑138 (MQ=255) gCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTc < 5:311943/138‑1 (MQ=255) ccAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCcag < 8:268018/149‑1 (MQ=255) aGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCcaggt < 5:82647/149‑1 (MQ=255) gTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCcaggtgcag < 6:219781/148‑1 (MQ=255) gTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCcaggtgcag < 5:233438/148‑1 (MQ=255) aTGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGc > 2:6486/1‑149 (MQ=255) gCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTc < 8:211903/80‑1 (MQ=255) gCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTc > 7:211903/1‑80 (MQ=255) gCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGcc < 7:219480/146‑1 (MQ=255) gCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGcc > 8:219480/1‑146 (MQ=255) cATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCt > 3:269443/1‑149 (MQ=255) tCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTcc < 7:9211/148‑1 (MQ=255) tACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCAcc > 2:160763/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTc < 3:4255/149‑1 (MQ=255) aGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCg < 3:337242/149‑1 (MQ=255) gtggtgCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGt < 2:17150/131‑1 (MQ=255) gtggtgCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGt > 1:17150/1‑131 (MQ=255) gtggtgCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGgcgc < 8:88623/149‑1 (MQ=255) ggtgCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGGAGGCGGGTCAGCGCTGGATTTCCTACCTGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGgcg < 1:121868/149‑1 (MQ=255) cGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGTACGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCCCCGCCTCGGCGCTGAGc > 1:284259/1‑149 (MQ=255) tgCCCCACCCCTGTGGCGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAg > 8:134308/2‑101 (MQ=255) tgCCCCACCCCTGTGGCGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAg < 7:134308/100‑1 (MQ=255) tgCCCCACCCCTGTGGCGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGGGCTGAGCAc > 7:111558/2‑149 (MQ=255) ggCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCAc > 1:83803/1‑149 (MQ=255) cccGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACcgc > 3:241068/1‑149 (MQ=255) ccGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACcgc > 5:365138/1‑148 (MQ=255) | CCGCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTGGATTTC‑‑‑CCGGT‑CGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACCGC > NC_002947/1623239‑1623528 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |