Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,698,755 | A→G | 7.7% | E168G (GAA→GGA) ‡ | cheBC → | chemotaxis response regulator protein‑glutamate methylesterase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,698,755 | 0 | A | G | 7.7% | 182.9 / 5.3 | 65 | E168G (GAA→GGA) ‡ | cheBC | chemotaxis response regulator protein‑glutamate methylesterase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base G (2/3); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.48e-01 |
GCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAACC > NC_002947/1698609‑1698899 | gctgcGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGaa < 3:21699/148‑1 (MQ=255) gcAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGtgctg < 4:371729/149‑1 (MQ=255) cAAGATCCTAAATATCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGtgctgc > 6:229365/1‑149 (MQ=255) aaGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCGGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTTCGAGtgctgcc < 2:357440/149‑2 (MQ=255) aaGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTgctgct > 6:105084/1‑149 (MQ=255) aaTATCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGGTGGGGGTTGGGTGGGGAAAACGGGTCTACGGCGGGTGGCCCGCCAGCCGACGAAGTGGTGATCAAggg > 1:312054/1‑149 (MQ=255) atatCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGtgctgc > 6:350527/1‑138 (MQ=255) atatCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGtgctgc < 5:350527/138‑1 (MQ=255) atatCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGAT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTg > 7:261342/1‑149 (MQ=255) tatCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGc < 4:197526/149‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCcggcg > 6:258650/1‑149 (MQ=255) cagcGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCg > 6:108475/1‑129 (MQ=255) cagcGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCg < 5:108475/129‑1 (MQ=255) cGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGt < 4:231239/149‑1 (MQ=255) cGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGt < 2:87810/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAg < 4:177875/100‑1 (MQ=255) ccTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAg > 3:177875/1‑100 (MQ=255) cTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTc > 4:364245/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTc > 7:211629/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCAtg < 5:105084/149‑1 (MQ=255) aaGGGCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCAtg < 3:235226/149‑1 (MQ=255) tCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGCTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGa > 2:67520/1‑149 (MQ=255) ggTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGGTCAAGGGTTTGCCGGGAGCGTTTCGGGCGGCCTGGGTGCTGGTCCGGCATGTgggg > 8:313320/1‑146 (MQ=255) ggTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGAc < 6:290454/148‑1 (MQ=255) gCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGgt < 2:312054/149‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGgtg > 5:314421/1‑149 (MQ=255) cACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGgtgt < 3:364245/147‑1 (MQ=255) cACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGttt < 5:258650/149‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTg < 1:14786/149‑1 (MQ=255) cagcgcGAGGCTTCCCAGCGCCCCGGGTT‑GGT‑‑GGGAATCGGGTCTTAGGCGGGTGGCCCCGCAGCACACGAATTGCTGCTAAAGGGTTTTCCGGCACCGTATGCGGCCGCCCTCGTGCTGGTCCAGCCTGTGCACCACGTGTTTgaccc > 2:110371/3‑145 (MQ=255) cgcgAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCa < 1:23308/147‑1 (MQ=255) gcgAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAg < 6:144795/147‑1 (MQ=255) gcgAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAg > 5:144795/1‑147 (MQ=255) gCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGc < 8:211629/149‑1 (MQ=255) gCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGCGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGc > 7:39049/1‑149 (MQ=255) ctcgcgcAGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAAt < 6:174005/146‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAAt > 4:92200/1‑149 (MQ=255) ggTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCagcagc > 1:315005/1‑149 (MQ=255) gt‑‑ggCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAgcagcgcagc < 8:261342/149‑1 (MQ=255) t‑‑ggCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGttt < 4:329552/113‑1 (MQ=255) t‑‑ggCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGttt > 3:329552/1‑113 (MQ=255) aaTCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGcc > 4:259486/1‑149 (MQ=255) aaTCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGcc > 6:68606/1‑149 (MQ=255) ggTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCg > 2:185861/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGc < 5:375108/123‑1 (MQ=255) cTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGc > 6:375108/1‑123 (MQ=255) ttCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCAGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTgc > 1:281244/1‑149 (MQ=255) cggcggGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTTCCGGTg < 3:92200/146‑1 (MQ=255) cggcggGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTgc < 6:314421/147‑1 (MQ=255) gTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTgc < 4:340509/141‑1 (MQ=255) gTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTgc > 3:340509/1‑141 (MQ=255) gTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGcc > 8:13522/1‑149 (MQ=255) gTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGcc > 8:19069/1‑149 (MQ=255) ggCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCg > 1:228665/1‑149 (MQ=255) ttgagcagcaCTTCGAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAg < 1:191356/91‑1 (MQ=255) ttgagcagcaCTTCGAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAg > 2:191356/5‑95 (MQ=255) cccGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTg < 5:229365/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAgcagcgc < 5:126431/119‑1 (MQ=255) ccGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAgcagcgc > 6:126431/1‑119 (MQ=255) gagcagcaCTTCGAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTgcgc < 3:281556/135‑1 (MQ=255) gagcagcaCTTCGAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTgcgc > 4:281556/3‑137 (MQ=255) gcagcaCTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAgg < 3:259486/149‑1 (MQ=255) gcaCTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCg > 7:110848/1‑148 (MQ=255) cTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGccc < 1:157500/136‑1 (MQ=255) cTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGccc > 2:157500/1‑136 (MQ=255) cTCGAAGTGCTGCTCAAGGGGTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAAcc < 6:349029/149‑1 (MQ=255) | GCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGGCCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTT‑GGT‑‑GGCAATCGGGTCTTCGGCGGGTGGCCCGGCAGCACTCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATGTGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAACC > NC_002947/1698609‑1698899 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |