| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,784,032 | C→G | 5.5% | Q15H (CAG→CAC) ‡ | glnD ← | uridylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,784,032 | 0 | C | G | 5.5% | 238.7 / 3.8 | 72 | Q15H (CAG→CAC) ‡ | glnD | uridylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/34); new base G (2/2); total (36/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
AGGATATTGTCGACGAGCCAGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGGC > NC_002947/1783886‑1784180 | aGGATATTGTCGACGAGCCAGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTg > 7:105699/1‑149 (MQ=255) ggATATTGTCGACGAGCCAGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTgg < 8:87088/149‑1 (MQ=255) tatTGTCGACGAGCCAGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAAGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAAc > 5:129781/1‑149 (MQ=255) ttGTCGACGAGCCAGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTg > 7:27067/1‑149 (MQ=255) gTCGACGAGCCAGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTgg < 4:134327/148‑1 (MQ=255) gaGCCAGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCTGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCAGGCGGAACTGGccctcaa < 7:315627/149‑6 (MQ=255) aGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAATACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGaa > 5:120990/1‑148 (MQ=255) aGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGaa > 2:254299/1‑148 (MQ=255) aGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCAGGCGGAACTGGcc < 4:30599/139‑1 (MQ=255) aGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCAGGCGGAACTGGcc > 3:30599/1‑139 (MQ=255) gcgcGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAg < 8:261899/149‑1 (MQ=255) gggCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCg < 8:27067/149‑1 (MQ=255) gCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGaa > 3:23129/1‑125 (MQ=255) gCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGaa < 4:23129/125‑1 (MQ=255) ccTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCgggg < 8:115089/149‑1 (MQ=255) gCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTgg < 3:364832/149‑1 (MQ=255) cGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTggg < 8:226405/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGCGCGAATACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACg < 6:120990/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACg > 4:336842/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGACTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGACACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTc > 6:284442/1‑149 (MQ=255) ggCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTcc < 5:194784/148‑1 (MQ=255) ggCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTcc > 6:194784/1‑148 (MQ=255) gcgAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTc > 1:88856/1‑149 (MQ=255) gAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGt > 6:96188/1‑149 (MQ=255) gAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGt > 4:356245/1‑149 (MQ=255) aaaaCGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTgg < 4:132098/94‑1 (MQ=255) aaaaCGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTgg < 4:126624/94‑1 (MQ=255) aaaaCGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTgg > 3:126624/1‑94 (MQ=255) aaaaCGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTgg > 3:132098/1‑94 (MQ=255) gTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTg > 7:271153/1‑149 (MQ=255) gTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTg > 7:171222/1‑149 (MQ=255) ttGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCTGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTc < 5:299399/134‑1 (MQ=255) ttGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTc > 6:299399/1‑134 (MQ=255) tggcgcgCACCTCGCCGGCGAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCGCGCCTTGAGGGACAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGGCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGc < 8:160920/142‑1 (MQ=255) tGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGc < 7:168614/148‑1 (MQ=255) gTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCt > 7:162112/1‑149 (MQ=255) aGCACCTCGCCGGCCAAGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCg < 6:129781/149‑1 (MQ=255) ccTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCg > 7:228271/1‑86 (MQ=255) ccTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCg < 8:228271/86‑1 (MQ=255) ccTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTgaccgcac > 8:3377/1‑142 (MQ=255) ccTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGt < 8:162112/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATCTGCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGt < 1:254299/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTg > 6:126763/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGc < 2:88856/147‑1 (MQ=255) gCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCgg > 7:347886/1‑149 (MQ=255) cAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGc < 4:172648/149‑1 (MQ=255) aGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGcc < 3:356245/149‑1 (MQ=255) gCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGTTGCGGTCAGGCCg > 5:65942/1‑148 (MQ=255) cGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGaa < 8:271153/149‑1 (MQ=255) aTGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTg > 8:145285/1‑149 (MQ=255) ggCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGt > 4:32349/1‑146 (MQ=255) ggCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGt < 3:32349/146‑1 (MQ=255) cTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGGCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGcgcg < 5:96188/149‑1 (MQ=255) tttCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCgg > 7:150581/1‑149 (MQ=255) gatggcggaGATGGGGCTCGCCTTTAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCTAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTTTCGTGGGGTGGCCTGTCGTGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATgg < 6:65942/145‑1 (MQ=255) gAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGaag < 8:347886/147‑3 (MQ=255) cggcgATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTgtcgt > 5:239378/1‑149 (MQ=255) cggcgATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGGGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTgtcgt < 5:126763/149‑1 (MQ=255) ggCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTgcg > 3:259890/1‑147 (MQ=255) tCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAggg > 2:283130/1‑149 (MQ=255) cTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGaa < 1:283130/149‑1 (MQ=255) ttGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGaa < 2:218436/113‑1 (MQ=255) ttGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGaa > 1:218436/1‑113 (MQ=255) gCCAGTTCCAGGCGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCg > 2:284258/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCg > 2:307391/1‑148 (MQ=255) aGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAg < 5:284442/149‑1 (MQ=255) gTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCgg < 8:155431/111‑1 (MQ=255) gTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCgg > 7:155431/1‑111 (MQ=255) ttCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGc > 4:167190/1‑148 (MQ=255) cGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCgg < 5:342774/107‑1 (MQ=255) cGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCgg > 6:342774/1‑107 (MQ=255) gCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTg < 7:145285/149‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCATAGCCAGTGGc > 5:36093/1‑149 (MQ=255) | AGGATATTGTCGACGAGCCAGGCGCGGGCCTCGATCAGCGGTCGGATGTCGCTGCCGGCGCGAAAACGTTTGTCGAGCACCTCGCCGGCCAGGCGGATGGCTTTCTTGAAGGCGGCGATGGGGCTCGCCTTGAGGGCCAGTTCCGCCTGGAACTGGCCACGGTCGAACAGCTCGGGGTCCACCTGGGGCATC‑GCGTCACGTTCCTGTCGTGGGGTGGCCTGTCGGGGTGCGGTCAGGCCGAAGTGCGCGGGATGGTGTCGTCCTTGCGCAGGGTGAAGATCTCGTAGCCAGTGGC > NC_002947/1783886‑1784180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |