| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,901,761 | A→T | 9.8% | D771V (GAC→GTC) | PP_1703 → | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,901,761 | 0 | A | T | 9.8% | 228.7 / 13.0 | 89 | D771V (GAC→GTC) | PP_1703 | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/35); new base T (4/5); total (49/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.32e-01 | |||||||||||
GACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATGGCAT > NC_002947/1901613‑1901906 | gACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGa < 4:204430/149‑1 (MQ=255) aCGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGAc < 8:98372/149‑1 (MQ=255) cGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGAcc < 5:133869/149‑1 (MQ=255) cGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGAcc < 7:273818/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCa < 6:160494/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGCGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGAc > 2:157787/1‑147 (MQ=255) cccTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAg > 2:198243/1‑149 (MQ=255) cccTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAg < 1:46773/149‑1 (MQ=255) tGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGcc > 6:201152/1‑149 (MQ=255) aaCCCTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCAGGcccagca < 6:291287/146‑5 (MQ=255) cACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTAc < 1:32598/149‑1 (MQ=255) cACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGAGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTAc > 6:110177/1‑149 (MQ=255) aCTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCAGGcccagca < 4:257646/137‑5 (MQ=255) aCTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCAGGcccagca > 3:257646/1‑133 (MQ=255) agCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTg > 8:198011/1‑149 (MQ=255) ccTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCgtacga > 8:242976/1‑143 (MQ=255) cTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACACCGCCTGCCg > 7:196088/1‑149 (MQ=255) tGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCgg > 8:10202/1‑149 (MQ=255) gTCCGCAGCCCGACCGCCACCCGGGCCCGTCTGGTTGGGCTGCACACGTTGGCGGTTCCGGTGCTGGCCTAATA‑‑AGTGGGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCCGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGc < 2:369245/149‑1 (MQ=255) gCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAGTGGAGCGT‑AATTA‑CCGGCAAGGTTTCCTGCGGGGCCGGGACCCGGCCCCCCCCGCGGGCGTACCCCCCCTGCCGGCCCGTgc > 1:303428/1‑149 (MQ=255) cGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGcgccg > 7:97702/1‑149 (MQ=255) aCCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCAGGccc > 5:53591/1‑109 (MQ=255) aCCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGTCCAGGccc < 6:53591/109‑1 (MQ=255) ccGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCgctg < 8:97702/149‑1 (MQ=255) gCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGTACATTA‑CATCCAAGGTTTCATCATGGCCATGGACCAGGCCCCCCCCAAGGGGGTCCCCCGCATGCCGGCCATTGCGCCgctg > 1:303759/1‑148 (MQ=255) ccACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCgctggct > 8:45964/1‑149 (MQ=255) ccTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGc > 1:14548/1‑147 (MQ=255) tGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttg > 7:200310/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgt > 5:212553/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTGCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgt < 2:303428/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCGTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgttt < 3:229188/146‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGAcc < 5:164055/82‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGAcc > 6:164055/1‑82 (MQ=255) cTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgtt < 5:325272/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgt < 7:15927/148‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCACACCTTGCCGTTTCGGGTGCTGGCCGATGA‑‑ATAGCGT‑GATTA‑CCTGCATGGTTTCGTGTTGGGCGTGTTCCAGGCCCGCGCCGAGTGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgttt < 2:14548/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAgg < 2:31158/96‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAgg > 1:31158/1‑96 (MQ=255) ttGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgttt > 6:324246/1‑149 (MQ=255) ggCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgttt < 5:324246/147‑1 (MQ=255) ggCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCgtttgttt < 1:198243/147‑1 (MQ=255) gCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGCGCTGGCCGAAGA‑‑TGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCGTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTttgtttgt < 1:157787/148‑1 (MQ=255) cTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGa < 6:212553/149‑1 (MQ=255) tGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGAc > 6:135812/1‑149 (MQ=255) tGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGATTGTTTGTCGAc > 5:159323/1‑149 (MQ=255) cacaCCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTACCCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAg < 1:263666/88‑1 (MQ=255) cacaCCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAg > 2:263666/1‑87 (MQ=255) cacaCCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACgg > 2:104534/1‑149 (MQ=255) acCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTCCCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCtt > 2:117744/1‑149 (MQ=255) acCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCAGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCtt > 2:7946/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGc > 6:34413/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGc > 6:159419/1‑149 (MQ=255) cGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCAGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGcc > 1:344853/1‑149 (MQ=255) ctgTGCTGGCCGAAGA‑‑ATAGCTT‑CATTA‑CGTGCAAGGTTTCATGCTGGGCCTGTACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCt < 2:344853/146‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGTCTgc > 3:154190/1‑148 (MQ=255) tGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTc < 4:160054/149‑1 (MQ=255) tGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGcc > 8:283140/1‑149 (MQ=255) ggCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGccc < 5:201152/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGccc < 8:200310/148‑1 (MQ=255) gCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCa < 7:45964/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCa < 7:198011/149‑1 (MQ=255) cGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGc > 2:7583/1‑149 (MQ=255) 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ttA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGAGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCa < 5:110177/149‑1 (MQ=255) ccTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATcg < 5:34413/149‑1 (MQ=255) cTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATcgc > 7:235798/1‑149 (MQ=255) tGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATcgcg > 3:11134/1‑149 (MQ=255) tGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATcgcg > 2:152327/1‑149 (MQ=255) tGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTAACCCGCCTGCCGCCCAGTGAGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATcgcg > 6:313774/1‑149 (MQ=255) gCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCCCCCATCGCgg > 8:43191/1‑149 (MQ=255) cAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGGTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCgg < 7:10202/148‑1 (MQ=255) tttCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAgg < 1:7583/149‑1 (MQ=255) gcgcgggCCTGGTCCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCcgcg > 5:184397/5‑149 (MQ=255) gctgGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCggg < 7:267838/103‑1 (MQ=255) gctgGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCggg > 8:267838/1‑103 (MQ=255) gcgggCCTGGTCCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCgcgc > 8:194847/3‑148 (MQ=255) ctgGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCcgcg < 5:135812/147‑1 (MQ=255) gggCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTGGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCTCAGGCCGCGCCAt > 5:373342/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATg > 6:375381/1‑149 (MQ=255) ccTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCgg > 8:220579/1‑131 (MQ=255) ccTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCgg < 7:220579/131‑1 (MQ=255) ccTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATgg > 3:268757/1‑148 (MQ=255) ccTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATgg > 2:43592/1‑148 (MQ=255) cTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCcgtc < 4:216932/67‑1 (MQ=255) cTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCcgtc > 3:216932/1‑67 (MQ=255) tGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCAAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATGGCAt > 2:17079/1‑149 (MQ=255) | GACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGA‑‑AGAGCGT‑CATTA‑CCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTACCCCGCCTGCCGGCCAGTGCGCCGCTGGCTGCCAGCCGTCGTTTGTTTGTCGACGGCTTGCTGGCCGGGCTGTTCGCCCAGCCTGCAACTGCACCCATCGCGGCACAGGCCGCGCCATGGCAT > NC_002947/1901613‑1901906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |