| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,134,271 | A→C | 6.5% | intergenic (‑37/+32) | PP_1892 ← / ← fadE | hypothetical protein/medium‑long chain acyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,134,271 | 0 | A | C | 6.5% | 221.5 / 4.6 | 72 | intergenic (‑37/+32) | PP_1892/fadE | hypothetical protein/medium‑long chain acyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/31); new base C (3/2); total (39/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAACAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCA > NC_002947/2134124‑2134418 | gAACAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAg > 6:123857/1‑149 (MQ=255)gAACAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAg > 5:337270/1‑149 (MQ=255) aCAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGta > 3:271378/1‑149 (MQ=255) aCAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGta > 4:362186/1‑149 (MQ=255) gTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATAcgccg > 6:1067/1‑149 (MQ=255) cTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGcccc > 6:39714/1‑149 (MQ=255) tttCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGccccc > 4:55884/1‑149 (MQ=255) ttctGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGtt > 4:357101/1‑149 (MQ=255) ctGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGtt < 3:282931/147‑1 (MQ=255) tGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTtct > 6:1528/1‑149 (MQ=255) gCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTcg > 1:75064/1‑149 (MQ=255) ctgctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑aa < 3:357101/149‑1 (MQ=255) ctgctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑aa < 5:97714/149‑1 (MQ=255) ctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAgg < 5:123857/148‑1 (MQ=255) ctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAgg < 7:114765/148‑1 (MQ=255) tctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGt > 7:35830/1‑149 (MQ=255) ctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAg < 4:271378/148‑1 (MQ=255) ctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAg < 5:1067/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCt > 6:4970/1‑149 (MQ=255) caccaGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTg > 3:228434/1‑144 (MQ=255) caccaGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTg < 4:228434/144‑1 (MQ=255) ccaGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTa < 3:210965/149‑1 (MQ=255) gAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACgg < 3:362186/149‑1 (MQ=255) aaTGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGc < 5:1528/149‑1 (MQ=255) tGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGcc > 4:243100/1‑149 (MQ=255) tGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTg > 2:290332/1‑149 (MQ=255) tGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCACGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTg > 2:285497/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGcccc < 8:331833/87‑1 (MQ=255) cAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGcccc > 7:331833/1‑87 (MQ=255) aGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGCAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGaa < 1:94318/149‑1 (MQ=255) aGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAg < 6:337270/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAg > 7:10403/1‑128 (MQ=255) ttGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAg < 8:10403/128‑1 (MQ=255) ggTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AACGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACAGCGCCTTGTCGAAGGcatcga > 3:289785/1‑149 (MQ=255) gTGATATTCCCGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGACCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGcatcga > 8:344954/1‑148 (MQ=255) gTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGcc < 7:192033/132‑1 (MQ=255) gTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGcc > 8:192033/1‑132 (MQ=255) tGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAg > 4:254932/1‑121 (MQ=255) tGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAg < 3:254932/121‑1 (MQ=255) ttCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAAc > 1:149992/1‑120 (MQ=255) ttCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGAt < 6:271135/149‑1 (MQ=255) aGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGTGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCAcc < 3:36327/149‑1 (MQ=255) ccATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCt > 2:69507/1‑149 (MQ=255) cATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGA‑‑‑‑‑A‑CACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGc > 7:48395/1‑149 (MQ=38) cATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACCTCGATCACCTTGCGCCGAGCCTg > 5:266158/1‑149 (MQ=255) cATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTg > 2:100551/1‑149 (MQ=255) cATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTg > 5:270911/1‑149 (MQ=255) cATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTg > 3:331029/1‑149 (MQ=255) tGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCGCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGTAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGtt < 1:285497/149‑1 (MQ=255) tGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGtt < 1:290332/149‑1 (MQ=255) gAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTc < 1:69507/148‑1 (MQ=255) gAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCg < 7:344954/149‑1 (MQ=255) aTGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGc > 3:35278/1‑149 (MQ=255) ggTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTc < 8:35830/149‑1 (MQ=255) tCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGt > 7:293944/1‑149 (MQ=255) cTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGa > 5:251725/1‑131 (MQ=255) cTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGa < 6:251725/131‑1 (MQ=255) tGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCt > 8:352719/1‑149 (MQ=255) ggCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGa > 8:268879/1‑123 (MQ=255) ggCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGa < 7:268879/123‑1 (MQ=255) ggCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGc > 1:215301/1‑125 (MQ=255) ggCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGc < 2:215301/125‑1 (MQ=255) aaaCGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAt > 3:148940/1‑149 (MQ=255) ggggggCGGAGTTTACGCCGCCGCTCGTTTCTGGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACTTCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtcgtc < 6:266158/149‑1 (MQ=255) ggggggCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGa > 7:227769/1‑67 (MQ=255) ggggggCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGa < 8:227769/67‑1 (MQ=255) ggggggCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtcgtc < 6:270911/149‑1 (MQ=255) gggggCGGCGTATACTCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtcgtcg > 6:13743/1‑149 (MQ=255) ggggCGGCGTATACTCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGA‑‑‑‑‑A‑CACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTgca < 8:48395/149‑1 (MQ=255) gggCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCggg > 6:233596/1‑149 (MQ=255) ggcggcGTATACTCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGt < 5:13743/149‑1 (MQ=255) ggAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTgc < 2:75064/149‑1 (MQ=255) gAGTAGACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCT‑AAGGTTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTgca < 4:289785/149‑1 (MQ=255) | GAACAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCG‑AAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCA > NC_002947/2134124‑2134418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |