Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 227,872 | G→A | 6.6% | R233H (CGC→CAC) | PP_0176 → | putative efflux transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 227,872 | 0 | G | A | 6.6% | 179.6 / 2.0 | 61 | R233H (CGC→CAC) | PP_0176 | putative efflux transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/30); new base A (2/2); total (29/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.88e-01 |
ACAGCGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGCACCG > NC_002947/227725‑228018 | aCAGCGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCGGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcgc > 4:35320/1‑149 (MQ=255) cAGCGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcg < 1:245424/147‑1 (MQ=255) gACACCTACCTGGCCCTCGATGCCAGCGCTGACATGGTCGGCTGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGTAGGTTCCGGCCGGCATACCCTGAAGAACGCGCGCGAAtt < 7:315504/149‑1 (MQ=255) cacCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGCCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGaa < 3:337469/145‑1 (MQ=255) cacCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGCCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGaa > 4:337469/1‑145 (MQ=255) acctacctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCg < 3:176653/149‑1 (MQ=255) cctGGCGCGCGTTGCCAGGGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcgc < 4:155315/136‑1 (MQ=255) cctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcgc < 4:149732/136‑1 (MQ=255) cctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcgc > 3:155315/1‑136 (MQ=255) cctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcgc > 3:149732/1‑136 (MQ=255) tGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCg > 3:116523/1‑148 (MQ=255) gCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGTCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCgg < 1:371186/147‑1 (MQ=255) ccGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGgatga > 6:378048/1‑149 (MQ=255) cgcgATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCACGCAATTCGCGGGCg > 1:352861/1‑143 (MQ=255) cgcgATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCACGCAATTCGCGGGCg < 2:352861/143‑1 (MQ=255) gcgATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATc < 6:65090/149‑1 (MQ=255) gcgATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATc < 4:116523/149‑1 (MQ=255) gcgATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGAAGACACAGAAGAAAGCCCCCGAAATTCGTGGGCGgctgat > 1:126556/1‑148 (MQ=255) tGCCAGCGCTGACAAGGGCGGCGGTATGCGCGTGGCGATGTTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCTCTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATc < 4:375422/149‑1 (MQ=255) cAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATctgc > 1:349922/1‑149 (MQ=255) tGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCCCGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCgg > 6:234408/1‑149 (MQ=255) tGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCgg > 6:239803/1‑149 (MQ=255) aCAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGt > 2:46549/1‑148 (MQ=255) tCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGAc < 2:349922/149‑1 (MQ=255) cggTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGccc < 2:281979/149‑1 (MQ=255) tATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTcg < 1:347052/149‑1 (MQ=255) gcgGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCTAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGa < 3:60385/132‑1 (MQ=255) gcgGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGa > 4:60385/1‑132 (MQ=255) gcgGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCgacgac > 5:57973/1‑149 (MQ=255) ggCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCAc < 5:378048/149‑1 (MQ=255) aTGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTgg > 3:187915/1‑148 (MQ=255) ggTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAg > 4:49952/1‑149 (MQ=255) gTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGgat > 5:88600/1‑101 (MQ=255) gTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGgat < 6:88600/101‑1 (MQ=255) aCTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCt < 1:33346/149‑1 (MQ=255) aCCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCt < 7:230961/146‑1 (MQ=255) aCCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCt > 8:230961/1‑146 (MQ=255) cTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAg > 4:320354/1‑149 (MQ=255) aaCTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGcc < 3:35320/148‑1 (MQ=255) aaCTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGcc < 7:297388/148‑1 (MQ=255) aCTCGCTGGAGCTGATGATCTGTCAGCTCGCCGACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCcgc < 1:239447/149‑1 (MQ=255) gCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGccc < 1:46549/149‑1 (MQ=255) gatCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTc < 2:126556/148‑1 (MQ=255) atCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCg < 6:253437/148‑1 (MQ=255) aGCTCGCCCACGAAGGTGCCAGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTcga < 1:218398/97‑1 (MQ=255) aGCTCGCCCACGAAGGTGCCAGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTcga > 2:218398/1‑97 (MQ=255) cGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAAc > 6:346390/1‑149 (MQ=255) gCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAAcc > 7:47182/1‑149 (MQ=255) cACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGt < 4:187915/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTgg > 7:180300/1‑148 (MQ=255) gCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGc < 3:49952/149‑1 (MQ=255) gCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGc < 2:335648/121‑1 (MQ=255) gCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGc > 1:335648/1‑121 (MQ=255) cccGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTc > 4:272108/1‑149 (MQ=255) cccGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTc < 5:239803/149‑1 (MQ=255) cccGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTc < 5:234408/149‑1 (MQ=255) cTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGaa > 1:29865/1‑132 (MQ=255) cTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGGGCTGGaa < 2:29865/132‑1 (MQ=255) gaagaaCGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTc > 7:68700/1‑148 (MQ=255) aagaaCGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCg > 6:251665/1‑137 (MQ=255) aagaaCGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCg < 5:251665/137‑1 (MQ=255) atccGCCCACGCAATTCGCGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGcc > 2:149645/4‑97 (MQ=255) atccGCCCACGCAATTCGCGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGcc < 1:149645/94‑1 (MQ=255) aCGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGc < 6:57973/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGCAc > 3:236590/1‑149 (MQ=255) cccGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGCAcc > 1:345549/1‑149 (MQ=255) ccGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGCAccg > 2:355937/1‑149 (MQ=255) | ACAGCGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGCACCG > NC_002947/227725‑228018 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |