| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,351,597 | C→G | 5.1% | V33V (GTG→GTC) | PP_2066 ← | GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,351,597 | 0 | C | G | 5.1% | 251.3 / 2.6 | 79 | V33V (GTG→GTC) | PP_2066 | GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/38); new base G (2/2); total (39/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.71e-01 | |||||||||||
GGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGGCCGCCC > NC_002947/2351459‑2351742 | ggCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGc > 6:53687/1‑149 (MQ=255) ccTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCgg < 7:259169/149‑1 (MQ=255) ccTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCg < 5:37472/148‑1 (MQ=255) ccTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCAGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCg > 6:37472/1‑148 (MQ=255) tCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTGGGCAGCCTGCTGCCGACCGAGt < 6:79139/142‑1 (MQ=255) tCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTGGGCAGCCTGCTGCCGACCGAGt > 5:79139/1‑142 (MQ=255) ccGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTgg > 5:169863/1‑149 (MQ=255) ccACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCt > 8:71998/1‑149 (MQ=255) cACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCtt < 8:269457/149‑1 (MQ=255) cACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCtt > 7:298366/1‑149 (MQ=255) gcTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCAt > 2:181653/1‑148 (MQ=255) tGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAg > 5:163957/1‑149 (MQ=255) gccgcGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTcc > 6:129918/1‑149 (MQ=255) gcgACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCttt < 7:107675/149‑1 (MQ=255) gcgACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCttt < 3:231267/149‑1 (MQ=255) cacCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCa > 1:236936/1‑149 (MQ=255) taGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCtt > 2:375290/2‑128 (MQ=255) taGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCtt < 1:375290/127‑1 (MQ=255) cAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCggg > 8:131189/1‑106 (MQ=255) cAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCggg < 7:131189/106‑1 (MQ=255) cAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCAAAGCTCGAAA‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGACCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACgg > 7:225763/1‑149 (MQ=255) aGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGt > 4:90420/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTg < 5:129918/149‑1 (MQ=255) cccTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTgg < 8:298366/149‑1 (MQ=255) cTTGAGTGATCAACTGGTCGATATCGTCACGCACCGTGTGCAGGCTCACATTGTATAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGTGCGCTGGCAATCGCTTGAATCTAGTCCtt < 8:283293/136‑1 (MQ=255) cTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGACGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCAACGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGACCtt > 7:283293/1‑136 (MQ=255) ttGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCCCGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCACGTCCTTTGCCACGGTGGAg > 7:307059/1‑148 (MQ=255) gagtgagCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTa < 2:346510/148‑1 (MQ=255) gtgagCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAgcg > 6:240255/1‑149 (MQ=255) tgagCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAgcgc > 6:263231/1‑149 (MQ=255) gagCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCtt < 8:210810/129‑1 (MQ=255) gCAACTGGGCGATAGCGGCACGCACCGTGGGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGcgcggt < 8:307059/149‑3 (MQ=255) tGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGtt > 8:160667/1‑149 (MQ=255) tCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCAt < 5:240255/149‑1 (MQ=255) gATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATAc < 6:169863/149‑1 (MQ=255) aTAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCAt < 8:79252/107‑1 (MQ=255) aTAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCAt > 7:79252/1‑107 (MQ=255) tAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCt < 5:53687/149‑1 (MQ=255) cGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTg < 3:337362/89‑1 (MQ=255) cGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTg > 4:337362/1‑89 (MQ=255) cGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTg > 6:62811/1‑149 (MQ=255) gcacgcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAACGACGGTCGGCAGCAGCCTCCCAACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTCCATCAAGTCCTTTGCAACGGTGGAGTAGAGCGTTGGGTTCATACCTTTga > 1:279937/1‑148 (MQ=255) gcacgcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCt > 5:277511/1‑149 (MQ=255) gcacgcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCt > 5:182205/1‑149 (MQ=255) cacgcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTc < 5:263231/149‑1 (MQ=255) cgcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCgg < 2:236936/149‑1 (MQ=255) gcacCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCggg < 1:301970/149‑1 (MQ=255) cGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCg > 7:288702/1‑149 (MQ=255) tCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCtt > 2:253201/1‑126 (MQ=255) tCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCtt < 1:253201/126‑1 (MQ=255) tCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCa < 7:188158/147‑1 (MQ=255) tCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCa > 8:188158/1‑147 (MQ=255) acaTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGNTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCgg > 1:33093/1‑149 (MQ=255) acaTTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATc < 6:182205/147‑1 (MQ=255) ttGTAACGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGGCGGCAGCAGTCTGCCCACCGGGTAGCGTCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGTTGGAGTAGCTGGTTCTGTTCATACATTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGTTTg < 6:306492/149‑1 (MQ=255) aaaGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAg > 5:352813/1‑149 (MQ=255) aaaGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAg > 3:104350/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgtg < 3:90420/149‑1 (MQ=255) tCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTaa < 6:352813/149‑1 (MQ=255) tCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTaa < 4:369638/149‑1 (MQ=255) tCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTaa < 7:160667/149‑1 (MQ=255) gCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCgg < 8:74951/39‑1 (MQ=255) cTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGATGACAGTGTAACAGCGGcc > 1:364165/1‑149 (MQ=255) cGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGa > 3:347461/1‑149 (MQ=255) c‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgtg < 3:269777/132‑1 (MQ=255) c‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgtg > 4:269777/1‑132 (MQ=255) c‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGc < 4:104350/149‑1 (MQ=255) cggtgggCAGCCTGCTGCCGACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGcc > 1:194008/1‑148 (MQ=255) ggtcggCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGcc < 5:62811/147‑1 (MQ=255) gtaggCAGCAGGCTTCCCAGCGGGTAGCGGCCGCTTGCAATCTCTTGCATCAAGTCCTTTCCCACTGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCGATTTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGAGTCCTAATTCCGaa < 8:225763/146‑1 (MQ=255) cagcctgCTGCCGACCGAGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTc < 7:335632/143‑1 (MQ=255) cagcagGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTc < 2:33093/149‑1 (MQ=255) cagcagGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTc > 1:181265/1‑149 (MQ=255) agcagGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgtg < 8:124314/122‑1 (MQ=255) agcagGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAgtg > 7:124314/1‑122 (MQ=255) cagGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCAt < 3:211008/81‑1 (MQ=255) cagGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCAt > 4:211008/1‑81 (MQ=255) gCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCTCGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGgccg < 2:279937/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGgccg > 3:158038/1‑149 (MQ=255) cccACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGGCCGccc < 1:181653/148‑1 (MQ=255) | GGCCTCCACCCGGGTGCCCACGCGCTTGCGCCGCGACACCAGCCCTTGAGTGAGCAACTGGTCGATAGCGGCACGCACCGTGTGCCGGCTCACATTGTAAAGGTCGCACAGCTCGAAC‑TCGGTCGGCAGCAGGCTGCCCACCGGGTAGCGGCCGCTGGCAATCGCTTGCATCAAGTCCTTTGCCACGGTGGAGTAGCGCGTTGGGTTCATACCTTTGCTCGGGCTCGCCAATTTCATCGGTTGACAGTGTAACAGCGGCCGAATGCCGAACGCTCCGGCCGCCC > NC_002947/2351459‑2351742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |