| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,446,230 | C→A | 5.5% | A168A (GCC→GCA) | PP_2144 → | TetR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,446,230 | 0 | C | A | 5.5% | 234.8 / 3.5 | 72 | A168A (GCC→GCA) | PP_2144 | TetR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/35); new base A (2/2); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 | |||||||||||
CCAGAGCCAGGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCTGACAGCGGTGTGACCGACGAGGCGATG > NC_002947/2446083‑2446377 | ccagagccagGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCt > 5:224408/1‑149 (MQ=255)ccagagccagGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCt > 6:77695/1‑149 (MQ=255) cagagccagGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCtt < 1:176374/149‑1 (MQ=255) gagccagGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCa < 7:248474/149‑1 (MQ=255) gagccagGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCa < 2:34339/149‑1 (MQ=255) ccagGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCa < 1:154268/149‑1 (MQ=255) agGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATg > 1:202157/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCgg < 2:202157/148‑1 (MQ=255) aCCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTAAATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCgg > 1:278548/1‑148 (MQ=255) tGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTcc < 5:122428/143‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTcc > 6:122428/1‑143 (MQ=255) cggcgCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATc < 6:368131/147‑1 (MQ=255) tCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCt < 1:58272/147‑1 (MQ=255) ggAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCggg > 2:135142/1‑149 (MQ=255) gAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCggg < 5:77695/148‑1 (MQ=255) gAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGc > 1:291660/1‑149 (MQ=255) tGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGcc < 8:203538/149‑1 (MQ=255) gTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGAAGGCCGCGGCACCCAGCATgaag < 4:25884/121‑4 (MQ=38) gTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGAAGGCCGCGGCACCCAGCATgaag > 3:25884/1‑118 (MQ=38) ggTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACt > 1:339718/1‑149 (MQ=255) gtgtTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAg < 3:377282/104‑1 (MQ=255) gtgtTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAg > 4:377282/1‑104 (MQ=255) gtTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCACGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGAGCGACTTCg > 4:319757/1‑149 (MQ=255) ttCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCcgcg < 4:99770/125‑1 (MQ=255) ttCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCcgcg > 3:99770/1‑125 (MQ=255) ttCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCg < 2:75279/148‑1 (MQ=255) ttCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCg > 1:75279/1‑148 (MQ=255) tCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCgg > 3:46354/1‑148 (MQ=255) gccgcTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCAt > 2:116673/1‑148 (MQ=255) gccgcTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCAt > 3:15956/1‑148 (MQ=255) cTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTcc < 5:277720/100‑1 (MQ=255) cTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTcc > 6:277720/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCtc < 4:15956/149‑1 (MQ=255) tgctgcTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCtcg < 1:116673/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCtcgat > 7:310302/1‑149 (MQ=255) tgctgGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCga > 2:186392/1‑121 (MQ=255) gctgGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCtcgatc > 3:262796/1‑148 (MQ=255) ctgGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCtcgatc < 4:46354/147‑1 (MQ=255) ggTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAg > 5:369149/1‑148 (MQ=255) ggTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAg > 4:5722/1‑148 (MQ=255) gTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAg > 2:297677/1‑147 (MQ=255) gAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAgg > 5:143074/1‑149 (MQ=255) aaCGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGt < 2:81697/149‑1 (MQ=255) aaCGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGt < 2:339718/149‑1 (MQ=255) gAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGc < 8:233068/123‑1 (MQ=255) gAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGc > 7:233068/1‑123 (MQ=255) gAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGAt > 7:291802/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATgcg > 1:374724/1‑149 (MQ=255) gcCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGa < 2:291660/149‑1 (MQ=255) ccACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGAt > 8:216418/1‑149 (MQ=255) cACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCGAGGCCCTGCGGGCGATTGCCgaga > 2:91287/1‑102 (MQ=255) cACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCGAGGCCCTGCGGGCGATTGCCgaga < 1:91287/102‑1 (MQ=255) cACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGa > 4:236031/1‑106 (MQ=255) cACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGa < 3:236031/106‑1 (MQ=255) cACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATg < 1:297677/149‑1 (MQ=255) cGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTc < 2:278548/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCggcaggca < 6:369149/148‑1 (MQ=255) gCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATgcgcg > 6:314029/1‑149 (MQ=255) cGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATgcgcgc < 1:135142/149‑1 (MQ=255) cGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATgcgcgc < 3:139020/149‑1 (MQ=255) gtgtGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCt < 8:291802/149‑1 (MQ=255) gtgCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCTGa > 3:13826/1‑149 (MQ=255) tgCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCTGa < 3:5722/148‑1 (MQ=255) gCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCATGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCggcagg < 7:255348/135‑1 (MQ=255) gCACTTCATGCTGGGTGCAGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATAGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGAggcagg > 8:255348/1‑135 (MQ=255) aCTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGcc > 4:139860/1‑62 (MQ=255) aCTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGcc < 3:139860/62‑1 (MQ=255) gacATGCTGAAGGCCGCGGCACCCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATgcgcgc > 4:372710/3‑140 (MQ=255) gacATGCTGAAGGCCGCGGCACCCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATgcgcgc < 3:372710/138‑1 (MQ=255) cATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCTGACAGCGgt < 7:216418/148‑1 (MQ=255) cTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCTGACAGCGGTGTGa < 8:310302/148‑1 (MQ=255) gcgGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCTGACAGCGGTGTGACCGACGAGGc < 5:314029/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCTGACAGCGGTGTGACCGACGAGGCGATg < 6:143074/149‑1 (MQ=255) | CCAGAGCCAGGGTCACCTGCGGCGCTATCTGGAAGACATGTACGGCAAGGTGTTCCGCCGCTACATGCTGCTGGTGAACGAGGCTGCGCCACGCATTCCGCCACTGGAACTGTTCTGGCGTGTGCACTTCATGCTGGGTGCCGCGGCCTTCAGCATGTCCGGTATCAAGGCCCTGCGGGCGATTGCCGAGACCGACTTCGGCATCAACACCTCGATCGAGCAGGTGATGCGCCTGATGGTGCCGTTCCTGGCGGCAGGCATGCGCGCTGACAGCGGTGTGACCGACGAGGCGATG > NC_002947/2446083‑2446377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |