Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,447,895 | T→C | 5.5% | Q1063R (CAG→CGG) | PP_2146 ← | SNF2/RAD54 family helicase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,447,895 | 0 | T | C | 5.5% | 213.5 / 2.1 | 72 | Q1063R (CAG→CGG) | PP_2146 | SNF2/RAD54 family helicase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/40); new base C (2/2); total (30/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 |
GCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAGTGGATCACGGTGTCCGCCGCCGT > NC_002947/2447747‑2448043 | gCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACt < 3:345069/149‑1 (MQ=255) tATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGa > 5:311282/1‑148 (MQ=255) tCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGAtct > 1:171319/1‑149 (MQ=255) tCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGAtct > 2:210565/1‑149 (MQ=255) tCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGAtc < 1:187993/148‑1 (MQ=255) cccccTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGAtctt > 7:1263/1‑149 (MQ=255) ccccATTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACCGGGCCTCGATGTCTACATCGCCAAGCCGCCATTGCCCACCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATCCTGCGTATTCCTGCTGCAACAACTGGAtcttc > 5:322868/1‑149 (MQ=255) cTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGa < 2:37597/141‑1 (MQ=255) cTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGAtagatcg > 1:37597/1‑142 (MQ=255) tGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGAtcttctctt < 8:83338/147‑1 (MQ=255) gCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACCGGATCTTCTCTT‑CCAc > 8:249863/1‑149 (MQ=255) ccgcccgcGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCAAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACCACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTAc > 6:383313/1‑149 (MQ=255) cccgcGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTAcccc > 6:64028/1‑149 (MQ=255) ccgcGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCg < 1:107790/149‑1 (MQ=255) gcgcTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCggg < 4:318588/149‑1 (MQ=255) cGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCggg < 4:38331/141‑1 (MQ=255) cGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCggg > 3:38331/1‑141 (MQ=255) cGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGc < 8:1263/149‑1 (MQ=255) gggCAATGGCGCGTACAGGTCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGGCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTCTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCTCCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCt < 6:322868/149‑1 (MQ=255) gggCAATGGCGCGAACAGGGCGTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCt > 5:239618/1‑149 (MQ=255) gggCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACATCTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCt < 3:280633/149‑1 (MQ=255) ggCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCtt < 8:147177/149‑1 (MQ=255) ggCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCtt < 3:336072/149‑1 (MQ=255) ggCAAAGGCGCGAACCTGGCCGCCCTTTCATCCTCGCCCAGCCGCCATTGCCCACGCTGCCCGCCGTCCATCATGCGTGCGGCCAAATCTGCCTTTTCCTTGTGCAACCACTTGCTCTTCTCCT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCtt < 8:176903/149‑1 (MQ=255) aaTGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTgaa < 7:306728/149‑1 (MQ=255) aaTGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTgaa < 1:92239/149‑1 (MQ=255) gcgAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTgaacacgaa < 2:171319/149‑1 (MQ=255) aaCAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTgaacacgaacac > 1:350358/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTgaacacgaacac < 1:210565/149‑1 (MQ=255) gggCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGt < 1:366775/149‑1 (MQ=255) gggCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGt < 5:139661/149‑1 (MQ=255) ccTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTg > 2:9997/1‑149 (MQ=255) ccTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACAGGTTTg > 1:205957/1‑149 (MQ=255) aTTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTg < 6:311282/149‑1 (MQ=255) aTTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTg < 6:239618/149‑1 (MQ=255) tttCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTTCCCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTg < 1:274901/149‑1 (MQ=255) tcttcATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGc < 4:308176/148‑1 (MQ=255) cttcATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGcc < 5:64028/148‑1 (MQ=255) cAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACCGGATCTTCTCTT‑CCACCGTAcccc > 1:61980/1‑99 (MQ=255) cAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACCGGATCTTCTCTT‑CCACCGTAcccc < 2:61980/99‑1 (MQ=255) aaGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAgg > 1:214161/1‑149 (MQ=255) aGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCACGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAgg > 8:276073/1‑148 (MQ=255) cgccATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCCCCGTACCCCGCGAA‑AGGGGGCGAGAACACGCACACCGGGTTTTGCAGGGCGCTGGGGTAgggcc > 1:315809/1‑146 (MQ=255) cgccATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTACA‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAg < 1:269628/145‑1 (MQ=255) cgccATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAg > 2:269628/1‑144 (MQ=255) gccATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTa > 8:342110/1‑142 (MQ=255) gccATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTa < 7:342110/142‑1 (MQ=255) cATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAcggtc > 8:48585/1‑149 (MQ=255) aTTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTTGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAcggtcg < 2:205957/149‑1 (MQ=255) aTTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACCGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAcggtcg < 7:249863/149‑1 (MQ=255) ttGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAcggtcgg < 2:350358/149‑1 (MQ=255) cccAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGCTCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTa < 2:243999/148‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGc > 8:18934/1‑149 (MQ=255) cgccgTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTtcg < 7:18934/149‑1 (MQ=255) cgTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTtcgctc < 2:214161/149‑1 (MQ=255) ggcCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCggg < 4:21234/139‑1 (MQ=255) ggcCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCggg > 3:21234/1‑139 (MQ=255) gcCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAcggtcgg > 6:200138/1‑115 (MQ=255) gcCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCAcggtcgg < 5:200138/115‑1 (MQ=255) gcCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAggg < 1:9997/149‑1 (MQ=255) ccAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAgggg > 5:171607/1‑149 (MQ=255) cAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGt < 7:251184/149‑1 (MQ=255) aaTGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTc < 5:383313/149‑1 (MQ=255) tgcCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTc < 6:221580/133‑1 (MQ=255) tgcCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTc > 5:221580/1‑133 (MQ=255) ccTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAGt < 6:171607/147‑1 (MQ=255) ccTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCACCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAg < 5:174364/146‑1 (MQ=255) ccTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCACCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAg > 6:174364/1‑146 (MQ=255) ctgctgCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAGTGGATCACg < 7:48585/148‑1 (MQ=255) tcataaacTGGATCTTCTCTT‑CCAGCGTACCCCGTGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCTATGCGGTAGGCACTGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAGTGGATCACGGTGTcc < 4:260175/144‑1 (MQ=255) caacaaCTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGAGGTAGTCACGGTCGGTAGCCTGTTTTTCGCTAGCCTGGTTCCACCAGGGGTCGAAGTGGATCACCGTTTccg > 2:142803/1‑149 (MQ=255) aacaacTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAAAAACGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGAACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAGTGGATCACGGTGTccga > 3:260175/1‑148 (MQ=255) acaagTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTTGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAGTGGATCACGGTCTccgcc > 8:293775/1‑149 (MQ=255) tGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAGTGGATCACGGTGTCCGCCGCCGt > 4:107299/1‑149 (MQ=255) | GCTCTATCCCCCTTTGGCCTACCGCCCGCGCTTCCCGGGCAATGGCGCGAACAGGGCCTCGATTTCTTCATCGCCAAGCCGCCATTGCCCAGCCTGCCCGCCGTCCAGCAGGCTGGCGGCCAATGCTGCCTTTTCCTGCTGCAACAACTGGATCTTCTCTT‑CCACCGTACCCCGGGTA‑A‑TCAGCTTGAACACGAACACCGGTTTGTCCTGGCCGATGCGGTAGGCACGGTCGGTAGCCTGGTTTTCGCTCGCCGGGTTCCACCAGGGGTCGAAGTGGATCACGGTGTCCGCCGCCGT > NC_002947/2447747‑2448043 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |