| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 239,167 | A→T | 5.7% | Q83L (CAG→CTG) | hemD → | uroporphyrinogen‑III synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 239,167 | 0 | A | T | 5.7% | 212.2 / 2.1 | 70 | Q83L (CAG→CTG) | hemD | uroporphyrinogen‑III synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/33); new base T (2/2); total (35/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 | |||||||||||
AGATTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCGGCACCGCGT > NC_002947/239026‑239315 | agaTTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGc < 2:241377/149‑1 (MQ=255) aTTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTg > 2:223832/1‑149 (MQ=255) aaCCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGtt > 5:100546/1‑148 (MQ=255) aTTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGt > 7:31231/1‑149 (MQ=255) aCCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCGCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTgg < 7:305358/148‑1 (MQ=255) gTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGa < 2:171058/149‑1 (MQ=255) cAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAgg > 1:332354/1‑148 (MQ=255) cAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTgga < 5:270918/133‑2 (MQ=255) cAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTgga > 6:270918/1‑132 (MQ=255) ccACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGc > 2:346381/1‑149 (MQ=255) acaGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTg < 1:171467/149‑1 (MQ=255) acaGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTg < 6:26753/149‑1 (MQ=255) tggggCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCCCGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTgg < 1:113070/146‑1 (MQ=255) aGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGt < 1:124013/134‑1 (MQ=255) aGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGt > 2:124013/1‑134 (MQ=255) aGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGgt < 8:31231/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGACGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACAAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTCGTGtgc > 1:375880/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTgg > 7:192365/1‑114 (MQ=255) tCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTgg < 8:192365/114‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg > 3:225571/1‑149 (MQ=255) tGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGt > 4:165845/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTg < 1:223832/148‑1 (MQ=255) gAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTg < 4:369576/148‑1 (MQ=255) gAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTg < 4:363715/148‑1 (MQ=255) aaGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCt < 8:3355/149‑1 (MQ=255) ttGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTg < 6:137737/127‑1 (MQ=255) ttGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTg > 5:137737/1‑127 (MQ=255) aTGTCTTCCTGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCGGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCTTCCAGCGTCCGCATC‑GTGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAg < 2:375880/149‑1 (MQ=255) gACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTgg > 1:64668/1‑106 (MQ=255) gACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTgg < 2:64668/106‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGttt < 3:12490/149‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTg > 8:217891/1‑149 (MQ=255) cAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGttt > 5:348983/1‑145 (MQ=255) cAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGttt < 6:348983/145‑1 (MQ=255) cAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCt < 1:346381/148‑1 (MQ=255) aGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTg < 5:30052/102‑1 (MQ=255) aGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTg > 6:30052/1‑102 (MQ=255) gCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg > 2:125222/1‑124 (MQ=255) gCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg < 1:125222/124‑1 (MQ=255) gCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTcc > 1:213893/1‑149 (MQ=255) tCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGAt < 6:100546/149‑1 (MQ=255) tCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGAt < 7:217891/149‑1 (MQ=255) tCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGAt > 7:158142/1‑149 (MQ=255) acaGCCGGGCGGCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGa > 3:334881/3‑147 (MQ=255) aaGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAg < 3:165845/149‑1 (MQ=255) aGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGc > 8:140984/1‑149 (MQ=255) gccCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCtt < 2:213893/149‑1 (MQ=255) gccCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCtt < 8:158142/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGc > 5:117545/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGc > 3:55879/1‑149 (MQ=255) ggCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTg < 4:225571/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTgg < 7:111626/149‑1 (MQ=255) gCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTg < 4:55879/148‑1 (MQ=255) ttGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCcgccgc > 8:111875/1‑114 (MQ=255) ttGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCcgccgc < 7:111875/114‑1 (MQ=255) ttGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCg > 7:350447/1‑149 (MQ=255) ttGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCg > 1:256626/1‑149 (MQ=255) ttGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCg > 1:51141/1‑149 (MQ=255) aT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTg > 6:147977/1‑149 (MQ=255) cAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGa > 4:358110/1‑42 (MQ=255) cAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGa < 3:358110/42‑1 (MQ=255) gCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTAcc > 5:119214/1‑149 (MQ=255) aaccAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTAc < 8:321369/144‑1 (MQ=255) aaccAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTAc > 7:321369/3‑146 (MQ=255) aGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTgc > 1:325808/1‑129 (MQ=255) aGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTgc < 2:325808/129‑1 (MQ=255) aGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCg > 3:134655/1‑149 (MQ=255) aGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCg < 7:140984/149‑1 (MQ=255) ccGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGc > 6:206247/1‑106 (MQ=255) ccGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGc > 6:201033/1‑106 (MQ=255) aGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCGGCACCGCgt > 5:179601/1‑149 (MQ=255) | AGATTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCAT‑CTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAAGGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCGGCACCGCGT > NC_002947/239026‑239315 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |