| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,641,804 | C→A | 5.6% | R23S (CGC→AGC) | PP_2312 → | lytic transglycosylase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,641,804 | 0 | C | A | 5.6% | 230.7 / 2.8 | 71 | R23S (CGC→AGC) | PP_2312 | lytic transglycosylase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/37); new base A (2/2); total (32/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.08e-01 | |||||||||||
TTGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGAGTA > NC_002947/2641657‑2641949 | ttGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACGCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGgcgc < 8:284979/148‑1 (MQ=255)ttGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGgcgc > 7:284979/1‑148 (MQ=255) ccGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGACTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTc > 1:291428/1‑149 (MQ=255) cGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTGTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGcgcg > 1:197243/1‑149 (MQ=255) ggTCTTTTACCGTCGCTTATCACTGCGCGGGGCAACCCATGGATCCCGCTCACCGACCACCGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCGGTGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCg < 8:187232/149‑1 (MQ=255) gTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCgg < 8:113336/149‑1 (MQ=255) gTCGTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCgg < 3:260643/149‑1 (MQ=255) tCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCggg < 6:337653/149‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCgggg < 1:346579/146‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGcc < 3:1890/148‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGc < 1:43092/147‑1 (MQ=255) ccGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCCGGCGAGCGCG‑‑‑‑CCTGGGcggga < 2:197243/148‑5 (MQ=255) ccGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCgcag < 3:301939/149‑1 (MQ=255) ccGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGACTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCgca < 2:291428/148‑1 (MQ=255) ccGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGGTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCgca < 6:248192/148‑1 (MQ=255) cgacgtTTATCACAACCCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACCGACACCTTTTCGCATGCAGCCATGCACGCACATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTATGCAGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCccag > 6:391583/4‑148 (MQ=255) tttATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCaaaa > 2:122380/1‑148 (MQ=255) aTCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACAt < 2:350537/148‑1 (MQ=255) gCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGc > 1:290248/1‑149 (MQ=255) tGCAACCCATGGATGCCGCTCCCCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCTGCAAAACATACCGCCTGCCAAg > 8:198544/1‑149 (MQ=255) aaCCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTg > 2:250253/1‑149 (MQ=255) tGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACAt < 5:340981/123‑1 (MQ=255) tGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACAt > 6:340981/1‑123 (MQ=255) ccGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGgc < 2:290248/148‑1 (MQ=255) aCCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCAGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGAtt > 5:62038/1‑149 (MQ=255) cGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCg > 7:152836/1‑149 (MQ=255) gACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGc < 3:100691/149‑1 (MQ=255) cGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAg < 1:250253/149‑1 (MQ=255) acacGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCa > 1:246483/1‑148 (MQ=255) cacGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGGTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCAc > 1:18555/1‑142 (MQ=255) cacGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCAc < 2:18555/142‑1 (MQ=255) gTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTa > 5:52864/1‑149 (MQ=255) tagCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTTACGCTTGTGTTGGCCTTTGCCGGTCGCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGTGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGTCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTg < 3:16515/146‑1 (MQ=255) cGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCaa < 5:84927/107‑1 (MQ=255) cGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCaa > 6:84927/1‑107 (MQ=255) cGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGc > 5:158865/1‑148 (MQ=255) cATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAg > 8:161018/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTg > 5:39984/1‑149 (MQ=255) agCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTTCGAGTg < 5:391583/148‑1 (MQ=255) aGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTc > 3:167356/1‑123 (MQ=255) aGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTc < 4:167356/123‑1 (MQ=255) aGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTg < 5:18096/149‑1 (MQ=255) aGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCGGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGAGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTg > 1:122984/1‑149 (MQ=255) tGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAAc > 7:200363/1‑147 (MQ=255) gCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCTAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCa > 3:34713/1‑147 (MQ=255) gCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCaga < 6:158865/149‑1 (MQ=255) gCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCaga < 6:39984/149‑1 (MQ=255) cTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGAt > 7:252904/1‑110 (MQ=255) cTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGAt < 8:252904/110‑1 (MQ=255) aTTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGc < 8:152836/147‑1 (MQ=255) ctgctgACGCTGGGGTTGTCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCGCCCTCCCCGGCCGTCCCCATACTTACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGc < 1:122380/148‑1 (MQ=255) ctgctgACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACa < 1:148203/148‑1 (MQ=255) ctgACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTc < 2:311972/149‑1 (MQ=255) cGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTggt < 3:264539/149‑1 (MQ=255) ggggTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTggtgagg > 8:306354/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAgg < 6:52864/148‑1 (MQ=255) ccTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGt > 4:347431/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGt > 7:234228/1‑148 (MQ=255) ttGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAg > 2:194779/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGGAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGa < 2:246483/147‑1 (MQ=255) tGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAg < 8:200363/148‑1 (MQ=255) tGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAg < 4:34713/148‑1 (MQ=255) tGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAg < 7:306354/148‑1 (MQ=255) ccGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGc > 2:363445/1‑147 (MQ=255) ggTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGt > 2:180814/1‑149 (MQ=255) ggTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGt > 5:216606/1‑149 (MQ=255) tCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCg < 3:347431/149‑1 (MQ=255) ccGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGc < 6:216606/149‑1 (MQ=255) ccGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGCCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGAGTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTCCTGGTCAACCCGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCgg > 4:159814/1‑148 (MQ=255) cGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCa > 7:279535/1‑149 (MQ=255) gCCCCGGCGAGCGCG‑‑‑‑CCTGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGt < 3:214958/135‑1 (MQ=255) gCCCCGGCGAGCGCG‑‑‑‑CCTGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGt > 4:214958/1‑135 (MQ=255) ggCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGAGt < 1:180814/149‑1 (MQ=255) gcgcgcTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGAGta < 7:357402/149‑1 (MQ=255) | TTGCCGTGGTCTTTTACCGTCGTTTATCACTTGGCGGTGCAACCCATGGATGCCGCTCACCGACCACGGACACGTTTTCGCATGCAGCGATGCTGGCTCATTTTTCTGCTGACGCTGGGGTTGGCCTTTGCCGGTCCCGCCCAGGCGCGCTCG‑‑‑‑CCGGGGCCGCAGCAAAACATACCGCCTGCCAAGGTGCGTGACCTGGCGCAGATTCGCACCAGCAAAGTACTGCGAGTGCTGGTCAACCAGAGCCGCAACAGTTCTGGTGAGGTGAAGGGTGAGCCAGTCGGCATCGAGTA > NC_002947/2641657‑2641949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |