| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,964,954 | T→A | 7.7% | N558I (AAT→ATT) | PP_2595 ← | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,964,954 | 0 | T | A | 7.7% | 194.3 / 5.1 | 65 | N558I (AAT→ATT) | PP_2595 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/33); new base A (2/3); total (29/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
GAACGCCGACAGCCAGTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCTGTGCAGCGTCTGG > NC_002947/2964806‑2965097 | gAACGCCGACAGCCAGTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCAt > 5:333380/1‑149 (MQ=255)gAACGCCGACAGCCAGTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCAt > 1:231776/1‑149 (MQ=255) cGACAGCCAGTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGgcgc < 2:79055/149‑1 (MQ=255) aCAGCCAGTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGgcgcgc < 3:225649/149‑1 (MQ=255) aGCCAGTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAg > 5:130138/1‑149 (MQ=255) cAGTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAgtgt > 4:335895/1‑149 (MQ=255) gTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGTCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCGCGCCAATGGCGGGCactatgc < 5:112698/149‑7 (MQ=255) aGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCg < 2:231776/149‑1 (MQ=255) ggCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCgg > 8:95921/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCgg > 5:265816/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGgt < 2:217600/149‑1 (MQ=255) cgcgCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGgtgt < 7:95921/149‑1 (MQ=255) cgcgCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGgtgt < 7:161333/149‑1 (MQ=255) cgcACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGc < 3:313384/149‑1 (MQ=255) gcACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGcc < 8:64178/149‑1 (MQ=255) acaacaCCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCtt < 4:53981/149‑1 (MQ=255) aacaCCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCg < 8:262457/138‑1 (MQ=255) aacaCCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCg > 7:262457/1‑138 (MQ=255) acacCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATCGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGtt < 5:175258/149‑1 (MQ=255) cacCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTc > 4:179963/1‑149 (MQ=255) ccAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGa < 4:373084/149‑1 (MQ=255) cAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGa > 3:278072/1‑148 (MQ=255) aGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGAc > 6:57053/1‑148 (MQ=255) gAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAAc > 1:125061/1‑149 (MQ=255) gAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAAc < 3:152803/149‑1 (MQ=255) gATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGccc < 8:25790/149‑1 (MQ=255) gATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGccc > 7:25790/1‑149 (MQ=255) gATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGccc < 6:130138/149‑1 (MQ=255) gATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGccc > 2:350108/1‑149 (MQ=255) aGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGc < 6:265816/148‑1 (MQ=255) cctGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTcc < 5:349433/147‑1 (MQ=255) gCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGc > 8:246875/1‑149 (MQ=255) cAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGca > 1:69559/1‑149 (MQ=255) aaCACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGcac > 8:29091/1‑149 (MQ=255) acGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGcaccac < 3:179963/149‑1 (MQ=255) gCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGa < 3:335895/149‑1 (MQ=255) gTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGt > 1:173790/1‑149 (MQ=255) tgtTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGc > 2:307289/1‑149 (MQ=255) tgtTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAACCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCACGGCGTCCAGCAGCACGATATGGTCGGc < 4:79575/149‑1 (MQ=255) cACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATgg < 7:29091/149‑1 (MQ=255) cccTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGc > 4:230042/1‑148 (MQ=255) ggTGCCCCGATGCACCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACgg < 2:244573/148‑1 (MQ=255) gTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGG‑CACGGTGc < 6:333380/149‑1 (MQ=255) ccccGATGCGACAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCt < 7:246875/148‑1 (MQ=255) cGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGc < 1:350108/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGgt < 2:125061/148‑1 (MQ=255) ccAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGtgtg > 2:38081/1‑149 (MQ=255) gCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGa > 3:321300/1‑149 (MQ=255) ttGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGac < 5:57053/149‑1 (MQ=255) gcggcgTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGaccac < 6:205462/149‑1 (MQ=255) ggcgTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGaccacc > 6:202496/1‑148 (MQ=255) cgTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAg < 5:202496/149‑1 (MQ=255) tGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGAAACACGATATGGTCGGCCATGGCCACCGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACAAAGGTGCAACg > 5:294702/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGcc > 2:163879/1‑149 (MQ=255) aGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATg < 6:282258/99‑1 (MQ=255) aGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATg > 5:282258/1‑99 (MQ=255) gCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGgt < 2:297949/109‑1 (MQ=255) gCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGgt > 1:297949/1‑109 (MQ=255) gCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGaccacc < 2:165973/123‑1 (MQ=255) cATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCtttg > 3:117585/1‑148 (MQ=255) aTAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCtgtg > 3:90030/1‑147 (MQ=255) tGCGCGCCAATGGCGGGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCtgtg > 1:165123/1‑143 (MQ=255) tGCGCGCCAATGGCGGGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCtgtg > 1:105763/1‑143 (MQ=255) tGCGCGCCAATGGCGGGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCtgtg < 2:105763/143‑1 (MQ=255) tGCGCGCCAATGGCGGGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCtgtg < 2:165123/143‑1 (MQ=255) cGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCTGTGCAGCGTCTgg > 1:147606/1‑149 (MQ=255) cGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCATGCACCACGATATGGTCTGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCTATGACCACCTAGGTGCAACGCCCATGCAGGCTGTGCAGCGTCTgg < 3:54701/149‑1 (MQ=255) | GAACGCCGACAGCCAGTGAGGCCGCGCACAACACCAGGAACAGGATGAGGCATGCAACACGCATCAGTCGTGTTCCACCCTCGGTGCCCCGATGCGCCAGCCGTTGGCGGCGTGGCGCTGTTCGAGCATGCGTGCATAGTGCCCGCCATTGGCGCGCAGTGTGGCCGGTGTGCCTTGTTCGACAACCTGCCCGGCGTCCAGCACCACGATATGGTCGGCCATGGCCACGGTGCTGAGCTGGTGTGCGATGACCACCAAGGTGCAACGCCCATGCAGGCTGTGCAGCGTCTGG > NC_002947/2964806‑2965097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |