Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,136,991 | G→A | 10.3% | V65I (GTT→ATT) ‡ | PP_2753 → | ABC transporter ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,136,991 | 0 | G | A | 10.3% | 187.6 / 9.7 | 68 | V65I (GTT→ATT) ‡ | PP_2753 | ABC transporter ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/32); new base A (5/2); total (34/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.48e-01 |
GAGGACATCGAAGTGATCTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCACCTGACTATC > NC_002947/3136850‑3137134 | gaggaCATCGAAGTGATCTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGc > 5:311948/1‑149 (MQ=255) aCATCGTAGTGATCTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGTGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGAACCAGGCCgga < 6:151626/149‑3 (MQ=255) cATCGAAGTGATCTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTGGCCTTGCTATGCGCCTACGGTGGTGTCAATAGCACCACGCTCAAGT‑CTATTTCCTGCCTGGTTCAGGCCGAcc < 8:149354/149‑1 (MQ=255) gAAGTGATCTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGgc < 8:1194/149‑1 (MQ=255) aaGTGATCTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGgcg > 1:325162/1‑149 (MQ=255) tGATCTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCAt < 4:286112/149‑1 (MQ=255) tgtACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCTAGG‑CTATTTCGGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGt < 4:69937/146‑1 (MQ=255) cTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGAACCAGGCCgga > 4:139930/1‑134 (MQ=255) cTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGAACCAGGCCgga < 3:139930/136‑3 (MQ=255) ggCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTgg < 6:212414/149‑1 (MQ=255) gCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGc > 3:252209/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATcc > 2:133787/1‑149 (MQ=255) ttGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGc > 3:31488/1‑149 (MQ=255) tGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCt > 7:83977/1‑149 (MQ=255) gCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGGTCTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGc < 1:103954/148‑1 (MQ=255) gCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCAt > 6:76117/1‑126 (MQ=255) gCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCAt < 5:76117/126‑1 (MQ=255) tGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTGCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAg < 8:83977/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAggg < 6:311948/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAgggg < 8:281586/149‑1 (MQ=255) cGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGgc > 4:256152/1‑114 (MQ=255) cGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGgc < 3:256152/114‑1 (MQ=255) gtATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATGGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCatat < 7:352547/131‑1 (MQ=255) gtATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCatat > 8:352547/1‑131 (MQ=255) tCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGTTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGgcgc < 1:242915/109‑1 (MQ=255) tCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGTTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGgcgc > 2:242915/1‑109 (MQ=255) tCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCAGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGacac > 4:131209/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGt < 7:249489/111‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGt > 8:249489/1‑111 (MQ=255) ccTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACAccg > 1:6527/1‑149 (MQ=255) cTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACAccgc < 2:325162/149‑1 (MQ=255) gggTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCAGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGgt < 3:131209/149‑1 (MQ=255) gggCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGGCGGTGTcct < 3:215856/149‑3 (MQ=255) gggCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTcg < 8:18715/148‑1 (MQ=255) ggCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCaa > 2:318245/1‑149 (MQ=255) cGATATCGTCGCCTTGATAGGCGCAAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAAca > 3:161467/1‑148 (MQ=255) gtcgCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTgg > 5:241612/1‑148 (MQ=255) cTAGGCGCCAACGGTGCTGTCAAGAGCACCACGCTCAAGT‑GTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACGGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGGTTCCAGGGGCAGGAGACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAgg < 4:161467/148‑1 (MQ=255) gcCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGt > 1:106775/1‑149 (MQ=255) ccAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATc < 4:308738/146‑1 (MQ=255) ccAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATc > 3:308738/1‑146 (MQ=255) aCGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCAt < 1:133787/149‑1 (MQ=255) tGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCAt > 1:88101/1‑142 (MQ=255) tGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCAt < 2:88101/142‑1 (MQ=255) gCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGaa < 4:252209/149‑1 (MQ=255) gCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACgg < 1:318245/149‑1 (MQ=255) accacGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCa > 4:299572/1‑149 (MQ=255) cacGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCAtg > 8:82120/1‑149 (MQ=255) acGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCAtgt < 2:106775/149‑1 (MQ=255) cAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTtct > 6:390762/1‑149 (MQ=255) aaGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGa < 4:29071/135‑1 (MQ=255) aaGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGa > 3:29071/1‑135 (MQ=255) gg‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCAtgtg < 6:24311/142‑1 (MQ=255) gg‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCAtgtg > 5:24311/1‑142 (MQ=255) gg‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTccc < 3:299572/149‑1 (MQ=255) cTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCAc < 6:241612/149‑1 (MQ=255) tATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGa > 6:249857/1‑126 (MQ=255) tATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGa < 5:249857/126‑1 (MQ=255) ccggtcGGCCTGAACCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCACCt > 4:152668/6‑149 (MQ=255) ccggtcGGCCTGAACCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCACCt > 2:227470/6‑149 (MQ=255) tttCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCAcc < 5:390762/147‑1 (MQ=255) ggtcGGCCTGAACCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCACCTGa > 3:53745/4‑149 (MQ=255) gtcGGCCTGAACCAGGCCGGCCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCACCTGAc > 3:132251/3‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAgg > 7:4085/1‑102 (MQ=255) ccGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAgg < 8:4085/102‑1 (MQ=255) ggCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCACCTGACTAt > 3:262423/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCACCCACCTGACTAt > 3:125216/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCACCTGACTATc > 3:287329/1‑149 (MQ=255) | GAGGACATCGAAGTGATCTACGACGGCACGATCCTTGCCGTGGCCGGTGTATCCCTGCGGGTCGGGCAGGGCGATATCGTCGCCTTGCTAGGCGCCAACGGTGCTGGCAAGAGCACCACGCTCAAGG‑CTATTTCCGGCCTGGTTCAGGCCGACCGGGCGCATGTCAGTCGTGGCCATATCCGCTTCCAGGGGCAGGACACCGCCGGTGTCGCGGCCAACCTGCTGGCACGCCAGGGTATCGTCCATGTGTTGGAAGGACGGCATGTGTTCTCCCACCTGACTATC > NC_002947/3136850‑3137134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |