Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,181,395 | C→A | 6.2% | P198T (CCG→ACG) | PP_2791 → | aminoglycoside phosphotransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,181,395 | 0 | C | A | 6.2% | 201.7 / 3.6 | 64 | P198T (CCG→ACG) | PP_2791 | aminoglycoside phosphotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/32); new base A (2/2); total (30/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.72e-01 |
TGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCTGTGCCTGTTGCACCGT > NC_002947/3181252‑3181541 | tgCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGa < 3:216454/148‑1 (MQ=255) tgCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGAc < 5:366106/149‑1 (MQ=255) gggTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGGAACGGACAgga < 1:61937/149‑3 (MQ=255) gcgcTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCg < 5:163459/149‑1 (MQ=255) gcTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCgg > 1:243735/1‑148 (MQ=255) gcTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCgg < 2:243735/148‑1 (MQ=255) gcTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCgg < 2:249072/148‑1 (MQ=255) gcTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGGCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCgg > 1:249072/1‑148 (MQ=255) gccggccgCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCt > 6:97535/1‑149 (MQ=255) cgggcggcGCGCTCTGAACGGGGGCGGGTCCTCTGGGCTGGGCCTAACCCACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCgg < 1:316187/146‑1 (MQ=255) cggccgCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTgg < 5:51500/149‑1 (MQ=255) ccgCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCC‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCGGTGCTTCATGTCAGTTCCGGACCGCTCGACGGCCCTGGCgc > 4:230648/1‑148 (MQ=255) cgcgcgCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGAc > 4:185261/1‑149 (MQ=255) cgcgcgCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGAc < 5:97535/149‑1 (MQ=255) gcgcTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCAt < 7:293038/149‑1 (MQ=255) cTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGcc < 3:129909/135‑1 (MQ=255) cTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGcc > 4:129909/1‑135 (MQ=255) cACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGcc > 1:205161/1‑148 (MQ=255) aCCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGGAACGGACAg < 2:309638/119‑1 (MQ=255) aCCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTCTGCTTCCTGTCCGGAACGGACAg > 1:309638/1‑119 (MQ=255) cGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACcgccgc > 5:90516/1‑148 (MQ=255) ggTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACACCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTa > 2:20639/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGATTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGACGTACGCCACGCTCTGCTTCCTGTCACTTCAGGACAGCTCGCACGCCCTGGCGAACATCGACGCCTACAGCCCCTACCTCGa > 2:32205/1‑149 (MQ=255) aGGGCCTGTCTCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGACCGGCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTTGCGACCTTCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGac < 1:32205/149‑1 (MQ=255) aGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCg < 3:129715/147‑1 (MQ=255) aGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGa > 3:287421/1‑148 (MQ=255) ggCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGacac > 2:305854/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGacac < 3:189320/149‑1 (MQ=255) a‑‑‑‑aCTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGCCACCCTCGCCGAt > 5:306387/1‑149 (MQ=255) gACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATc > 3:125114/1‑149 (MQ=255) cGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCg < 1:305854/149‑1 (MQ=255) gCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCt < 7:344754/123‑1 (MQ=255) gCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCt > 8:344754/1‑123 (MQ=255) gCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCgg > 7:137069/1‑149 (MQ=255) aGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTg < 2:322179/149‑1 (MQ=255) ggCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTg < 6:23083/147‑1 (MQ=255) gcgcCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGaa > 8:157782/1‑149 (MQ=255) gcCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATg > 3:358717/1‑149 (MQ=255) aCCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGc < 2:205161/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGc < 3:185261/149‑1 (MQ=255) tCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGt < 1:20639/149‑1 (MQ=255) cATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGa < 4:287421/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAg > 6:150225/1‑149 (MQ=255) ggTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTg > 1:244434/1‑148 (MQ=255) tCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATggg > 6:369208/1‑126 (MQ=255) tCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATggg < 5:369208/126‑1 (MQ=255) ccgcccgcCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCt > 1:106388/1‑107 (MQ=255) ccgcccgcCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCt < 2:106388/107‑1 (MQ=255) cgcccgccGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCg < 3:9894/97‑1 (MQ=255) cgcccgccGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCg > 4:9894/1‑97 (MQ=255) cccgccGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATgcgc < 5:145992/149‑1 (MQ=255) cgcCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCgcagca < 8:137069/149‑1 (MQ=255) ccACGCTGTGCATCCTGTCCCTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTCGCGACCATCGACGCCTACAGCCCCTACCTATACACCCTCGCCGATCCCTATCCGGTGCGGGAATGGGGCCTGCGCTCGTGCGAGCTCCAAGAGCCGCgcagcaga > 4:55327/1‑148 (MQ=255) ccACGCTGAGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCgcagca < 3:55327/147‑1 (MQ=255) cACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTg < 6:181603/120‑1 (MQ=255) cACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTg > 5:181603/1‑120 (MQ=255) cTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCt > 5:345362/1‑149 (MQ=255) gtgCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCtgt < 4:125114/149‑1 (MQ=255) gcTGTCCGGAACGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCTGTGCCTGt > 8:184833/2‑149 (MQ=255) cTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCTGTGCCTGtt < 5:150225/149‑1 (MQ=255) cTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCTGTGCCTGtt > 8:228984/1‑149 (MQ=255) cTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCTGTGCCTGt < 7:157782/148‑1 (MQ=255) tccggtccggACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCTCCGATGCCTAGCCGGGGCGGGACTGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCTGTGCCTGTTg < 3:230648/147‑1 (MQ=255) tCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCt < 5:271171/137‑1 (MQ=255) ttCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCTGTGCCTGTTGCACCGt > 3:184074/1‑149 (MQ=255) | TGCCGGGTAGCGCTGCCGGCCGCGCGCTCAGCACCGGCGCCGGTCCTCAGGGCCGGGCGCA‑‑‑‑ACTGGCGACGCAGCTTGGCGCCAACCTGGCGCGTCTGCATCAGGTCCGCCCGCCGTGCGCCACGCTGTGCTTCCTGTCCGTTCCGGACAGCTCGCCGGCCCTGGCGACCATCGACGCCTACCGCCGCTACCTCGACACCCTCGCCGATGCCTATCCGGTGCTGGAATGGGGCCTGCGCTGGTGCGAGCTGCATGCGCCGCGCAGCAGCACCCTGTGCCTGTTGCACCGT > NC_002947/3181252‑3181541 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |