Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 670,841 | Δ1 bp | 6.0% | coding (2283/2355 nt) | pbpC → | peptidoglycan glycosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 670,841 | 0 | C | . | 6.0% | 200.6 / 6.7 | 67 | coding (2283/2355 nt) | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/33); new base . (2/2); total (31/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGGTGTGACCGGCTGGTGC > NC_002947/670694‑670975 | tCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCg > 4:236267/1‑149 (MQ=255) tGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCggg > 8:234957/1‑149 (MQ=255) cgccgcCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGGGGTGGGGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCggg < 8:146767/147‑1 (MQ=255) gccgccCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAg < 3:236267/149‑1 (MQ=255) cgccCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGc < 4:84211/149‑1 (MQ=255) cccGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTCTCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCg < 7:121052/149‑1 (MQ=255) ggCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGaa > 8:123191/1‑148 (MQ=255) ccaccaGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGCGCAGGCCGAACt > 8:307419/1‑148 (MQ=255) caGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAgcg > 6:224690/1‑149 (MQ=255) cACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGT‑‑GGCAGGCCGACCTCCGCGCGCTg > 4:325584/1‑149 (MQ=255) cACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCAACAGGT‑‑GGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTg > 4:330858/1‑149 (MQ=255) tGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTg > 6:66213/1‑148 (MQ=255) gAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGCTTGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTg > 1:274590/1‑148 (MQ=255) gTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGaaa < 7:234957/149‑1 (MQ=255) ttGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAg > 4:2008/1‑149 (MQ=255) gCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGc < 6:182781/148‑1 (MQ=255) cAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCgg > 1:249692/1‑149 (MQ=255) cAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCg < 5:305660/148‑1 (MQ=255) gCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCg < 3:191790/143‑1 (MQ=255) gCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCg > 4:191790/1‑143 (MQ=255) cAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGc > 6:220391/1‑116 (MQ=255) cAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGc < 5:220391/116‑1 (MQ=255) cAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGa < 2:249692/148‑1 (MQ=255) cAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGAc > 8:68004/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGGTGGTGGTGGGCGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGt > 7:49838/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTg < 5:338298/149‑1 (MQ=255) tggtggtggACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGATGGCGTTcc < 8:3580/149‑1 (MQ=255) ggtggtggACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCa < 1:69376/149‑1 (MQ=255) ggtggtggACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCa < 6:354640/149‑1 (MQ=255) gtggtggACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAg < 7:171455/149‑1 (MQ=255) ggtggACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGt > 5:173166/1‑149 (MQ=255) gACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGt < 5:66213/149‑1 (MQ=255) gACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGt < 2:79112/149‑1 (MQ=255) cGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGa < 6:293451/149‑1 (MQ=255) cgc‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTa < 7:68004/149‑1 (MQ=255) c‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAgg < 5:297842/149‑1 (MQ=255) tggtggTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGgt > 2:284113/1‑149 (MQ=255) gtTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTc < 7:123191/148‑1 (MQ=255) ttCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTcga < 7:280824/149‑1 (MQ=255) ccTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTcgac < 8:106940/148‑1 (MQ=255) aaCGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACa < 5:224690/148‑1 (MQ=255) cAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCgg > 4:52073/1‑147 (MQ=255) cAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCgg < 3:52073/147‑1 (MQ=255) aGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGcc > 7:326840/1‑149 (MQ=255) aGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGc > 3:328929/1‑148 (MQ=255) ccGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTATGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAg < 7:307419/149‑1 (MQ=255) ttGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCCGGTGGCGATCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGACGGGCCAGCAc > 2:105740/1‑149 (MQ=255) tGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACg > 6:23658/1‑149 (MQ=255) aaCCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCGACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCCCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCtt < 6:8196/149‑1 (MQ=255) aaCCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCtt < 6:13400/149‑1 (MQ=255) aCCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTg > 6:317190/1‑149 (MQ=255) cccAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGT‑‑GGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTTGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCaa < 3:330858/149‑1 (MQ=255) cccAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGG‑‑GGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCaa < 3:325584/149‑1 (MQ=255) ccAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGc > 5:45004/1‑148 (MQ=255) cAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCaa < 4:328929/149‑1 (MQ=255) cAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTTGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGt < 1:12794/88‑1 (MQ=255) cAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTTGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGt > 2:12794/1‑88 (MQ=255) aGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACgg < 6:137584/149‑1 (MQ=255) gACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGgt < 8:49838/149‑1 (MQ=255) gACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGgt > 1:258024/1‑149 (MQ=255) gttgCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGGTGTGACCgg > 5:47127/1‑149 (MQ=255) gctgcGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGGTGTGACCGGCTg > 6:221019/1‑149 (MQ=255) ctgcGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGGTGTGACCGGCTgg > 5:358868/1‑149 (MQ=255) ctgcGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGGTGTGACCGGCTg < 1:284113/148‑1 (MQ=255) tgcGTTTGCCTCAGGGCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCTGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGGTGTGACCGGCTGGt < 3:2008/149‑1 (MQ=255) cGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGGTGTGACCGGCTGGTGc > 5:28984/1‑149 (MQ=255) tCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGgt > 4:128764/1‑121 (MQ=255) | TCTGCGCCGCCCGGCCACCAGCACTGAGCCGTTGCAATTGCAGGTATCTGCCTTGGGTGGTGGTGGACGGCGC‑TGGTGGTTCCTCAACGGCCAGCCGTTGGGTGAAACCCAGGGGCAGGACAGCTTGTTGCTGCGTTTGCCACAGGTCGGGCAGGCCGAACTCAGCGCGCTGGACGAAAGCGGTCAGACGGCGCGGGTGGCGTTCCAGGTCAGTGAGTAGGTGTTCGACGACAGCCGGGCCAGCACCTACGCTTGCAAGTGACGGGTGTGACCGGCTGGTGC > NC_002947/670694‑670975 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |