| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,552,394 | Δ1 bp | 5.3% | coding (51/978 nt) | PP_3137 → | group 2 family glycosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,552,394 | 0 | C | . | 5.3% | 243.1 / 6.8 | 75 | coding (51/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/36); new base . (2/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 | |||||||||||
GCTGGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCAC > NC_002947/3552248‑3552542 | gCTGGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCt > 4:243665/1‑149 (MQ=255) cTGGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTc < 8:213024/149‑1 (MQ=255) tGGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCg > 5:370789/1‑149 (MQ=255) gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑g > 3:34394/1‑149 (MQ=255) gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑g > 7:12075/1‑149 (MQ=255) gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑g > 5:161539/1‑149 (MQ=255) gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGACCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑g > 1:280645/1‑149 (MQ=255) tAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGTCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCTGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑gc < 7:28499/149‑1 (MQ=255) aGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCAGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TAGGCCGCAATGAAGGACAGCGCCTCGA‑gcg > 6:274455/1‑149 (MQ=255) gCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCACGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTAGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCt > 4:236194/1‑149 (MQ=255) ccTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTTTGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCG‑CTCGAGGCGCTggcc < 6:286148/148‑4 (MQ=255) ccTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCtt < 7:9616/149‑1 (MQ=255) tGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGGCGCAATGAAGGACAGCGCCTCGC‑GCGCTGCCTTGt > 6:2392/1‑149 (MQ=255) gACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGtt > 2:110038/1‑149 (MQ=255) cAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTc < 3:243665/149‑1 (MQ=255) aCTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTgg < 7:48215/148‑1 (MQ=255) tGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAACTCGGCCGCAATGAAGG‑CAGCG‑CTCGAGGCGCTggcc < 1:249094/135‑4 (MQ=255) tGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGG‑CAGCG‑CTCGAGGCGCTggcc > 2:249094/1‑131 (MQ=255) gTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGa > 4:119906/1‑148 (MQ=255) gTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGAc < 8:12075/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACa < 4:124922/149‑1 (MQ=255) ggCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGGATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGt < 8:335741/149‑1 (MQ=255) gCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTc < 1:170586/149‑1 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt > 6:318498/1‑149 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGCCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt < 2:280645/149‑1 (MQ=255) tcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCGCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACg > 7:198106/1‑149 (MQ=255) aaGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGCCAAAGTCATGTACGTc > 7:247493/1‑149 (MQ=255) aaGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTc < 6:370789/149‑1 (MQ=255) aaGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTc < 5:318498/149‑1 (MQ=255) aaGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTc > 8:219667/1‑149 (MQ=255) ccGGCATCCGGCCGCCGTGACATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTc > 2:152257/1‑149 (MQ=255) cGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCg < 6:161539/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATCTACGTCGACTCGGGTTCCAc > 4:47622/1‑149 (MQ=255) gccgccGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAcc < 6:72580/149‑1 (MQ=255) ccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgg > 7:171992/1‑137 (MQ=255) ccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgg < 8:171992/137‑1 (MQ=255) ccgTGACATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATg < 1:152257/149‑1 (MQ=255) ggCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTc > 3:45642/1‑149 (MQ=255) aTCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCt > 8:59126/1‑149 (MQ=255) aTCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCt > 2:57616/1‑149 (MQ=255) tCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTg > 7:283643/1‑149 (MQ=255) tCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTg < 3:236194/149‑1 (MQ=255) ggTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGc < 4:34394/148‑1 (MQ=255) gAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTg > 3:41829/1‑149 (MQ=255) tGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgcc > 8:181337/1‑149 (MQ=255) cTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAAc > 4:11886/1‑149 (MQ=255) tATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAAcc > 4:330418/1‑149 (MQ=255) aTGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCt > 7:160292/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTgg < 4:45642/149‑1 (MQ=255) cAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgg > 2:373114/1‑108 (MQ=255) cAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgg < 1:373114/108‑1 (MQ=255) cAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGc < 2:284714/149‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTg < 8:283643/149‑1 (MQ=255) cGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTg > 1:346525/1‑149 (MQ=255) ggTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTgg < 1:57616/149‑1 (MQ=255) tGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCa < 3:11886/149‑1 (MQ=255) ggggTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTAc < 4:41829/148‑1 (MQ=255) gtggtggtAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGgc < 7:219667/149‑1 (MQ=255) gtggtggtAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGgc < 3:275618/149‑1 (MQ=255) gtAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGa > 2:207651/1‑149 (MQ=255) tAA‑TGGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTCGCGCACGGGGCCGACAAAGGCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGCTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGAc < 5:2392/149‑1 (MQ=255) aa‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACa > 1:171622/1‑149 (MQ=255) tCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATg < 8:198106/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 1:110038/148‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 7:59126/148‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 5:274455/148‑1 (MQ=255) cGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTAt < 3:330418/149‑1 (MQ=255) aaTGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATccc > 6:31536/1‑149 (MQ=255) aaGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTc < 2:171622/149‑1 (MQ=255) aaggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGGCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCa > 1:206618/5‑149 (MQ=255) ggCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAc > 8:256863/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATCTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAc < 3:47622/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAcc > 6:115869/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt > 3:192863/1‑130 (MQ=255) aGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt < 4:192863/130‑1 (MQ=255) cgcCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACcgccgc < 7:181337/149‑1 (MQ=255) ccTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCAc < 2:346525/149‑1 (MQ=255) | GCTGGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTAA‑TCGGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCTGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGCCGCAC > NC_002947/3552248‑3552542 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |