| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 838,007:1 | +C | 6.9% | intergenic (‑43/+37) | pth ← / ← rplY | peptidyl‑tRNA hydrolase/50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 838,007 | 1 | . | C | 6.9% | 398.5 / 23.8 | 101 | intergenic (‑43/+37) | pth/rplY | peptidyl‑tRNA hydrolase/50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (49/45); new base C (3/4); total (52/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.11e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTTC > NC_002947/837863‑838155 | gcTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGCGTTGATCGGGTTACAGTGCcgcgcgca < 3:307365/149‑3 (MQ=255) tGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTg > 3:130091/1‑149 (MQ=255) cAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTTGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTaa < 7:86107/149‑1 (MQ=255) cAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTaa < 7:304651/149‑1 (MQ=255) aaGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAAc > 2:343433/1‑149 (MQ=255) aaGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAAc > 1:283132/1‑149 (MQ=255) aaGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAAc < 4:239136/149‑1 (MQ=255) aGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAAcc < 3:77780/149‑1 (MQ=255) ggCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAAccc > 6:334046/1‑149 (MQ=255) ggCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAAccc > 2:261438/1‑149 (MQ=255) cgaagccAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAAcc < 6:112166/142‑1 (MQ=255) gCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCg < 8:201977/149‑1 (MQ=255) cGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGa < 1:343433/149‑1 (MQ=255) gTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGAt > 2:260022/1‑149 (MQ=255) aaCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAAc > 4:245957/1‑149 (MQ=255) aCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTaa > 6:13030/1‑138 (MQ=255) aCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTaa < 5:13030/138‑1 (MQ=255) cGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGc > 5:108419/1‑149 (MQ=255) gAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCACCGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGcc > 8:264915/1‑149 (MQ=255) aaaaGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCg > 7:178500/1‑149 (MQ=255) aaGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGc > 4:367493/1‑149 (MQ=255) ccccTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGc > 3:152537/1‑148 (MQ=255) ccTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAg > 8:276918/1‑149 (MQ=255) cTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGt < 4:130091/149‑1 (MQ=255) cTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGt < 4:152537/149‑1 (MQ=255) cGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTg < 3:245957/147‑1 (MQ=255) tATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTa > 4:140698/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACt > 7:97594/1‑149 (MQ=255) ggTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCgg > 8:335554/1‑147 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAgcgc < 3:21172/147‑1 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCct > 1:278988/1‑149 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCct < 5:365099/149‑1 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCct < 6:384126/149‑1 (MQ=255) cGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttc > 3:360568/1‑149 (MQ=255) gTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCg‑g > 7:124329/1‑95 (MQ=255) gTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttc < 1:261438/148‑1 (MQ=255) tATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctg > 2:157879/1‑149 (MQ=255) tCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctg‑ctt > 5:21628/1‑149 (MQ=255) cGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctg‑ctt < 7:276918/148‑1 (MQ=255) ttggCCTGGGTAACCCCGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCa > 6:137521/3‑134 (MQ=255) ttggCCTGGGTAACCCCGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCa < 5:137521/132‑1 (MQ=255) gggCCGGGGTTAGCGAGGCCAACGATCAACTGGATGGCCCTCACGTCAGGGGCTCTTCCTAGGAGGTGGT‑GGTTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctg‑cttctg < 2:92720/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctg‑cttctg > 7:296652/1‑148 (MQ=255) gCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGa < 5:222254/149‑1 (MQ=255) gTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAAcg > 1:142057/1‑149 (MQ=255) cccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGt < 3:140698/148‑1 (MQ=255) cccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTg < 5:334046/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTg < 7:335554/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTCACGCGATCAACGCCGGCGTGCGACTGGATTACAGGGCCGCGCCTTCTG‑AGTCGGGAGCACCGCGTg > 8:155450/1‑148 (MQ=255) ccAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTg > 5:233516/1‑148 (MQ=255) cAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGa < 6:233516/149‑1 (MQ=255) aGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGt < 8:284855/145‑1 (MQ=255) aGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGt > 7:284855/1‑145 (MQ=255) aGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAg < 3:357311/149‑1 (MQ=255) cAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGt > 4:150475/1‑148 (MQ=255) aCGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGaa < 8:296652/149‑1 (MQ=255) cGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAAc < 3:150475/149‑1 (MQ=255) gATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGGAACCCGATCACCGCCGGCGTGCGAGGGGATTACTCGGCAGCGGCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACg > 8:331363/1‑149 (MQ=255) tCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGtt < 2:283132/149‑1 (MQ=255) aaCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTgg < 2:278988/149‑1 (MQ=255) aaCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTg < 2:233581/148‑1 (MQ=255) aCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTgg > 7:217791/1‑148 (MQ=255) aTGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAg < 8:178500/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctg‑cttctg > 5:159322/1‑115 (MQ=255) tGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctg‑cttctg < 6:159322/115‑1 (MQ=255) ggTCACGTGAGGGGCTCTTCCTTGGTGTTGGT‑GGGTTAGAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCGTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTg < 7:80449/149‑1 (MQ=255) ggTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCttt < 1:260022/149‑1 (MQ=255) ggTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAAc < 1:166351/133‑1 (MQ=255) ggTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTg > 7:312880/1‑149 (MQ=255) gTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGa > 1:141413/1‑112 (MQ=255) gTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGa < 2:141413/112‑1 (MQ=255) cGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGtcatc < 6:57967/149‑1 (MQ=255) gTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGtcatca < 8:252803/149‑1 (MQ=255) gTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGtcatca > 4:105368/1‑149 (MQ=255) gggCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTg > 7:186392/1‑149 (MQ=255) gggCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTg > 8:177135/1‑149 (MQ=255) ggCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTgg < 7:264915/149‑1 (MQ=255) ggCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTgg < 2:142057/149‑1 (MQ=255) tctTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGc > 5:146699/1‑148 (MQ=255) ttCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGc > 5:29755/1‑146 (MQ=255) ttCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGc > 8:18431/1‑146 (MQ=255) ccTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCaga < 1:237554/148‑1 (MQ=255) cTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCTTCACCGTGGGCCAGAGc > 1:132513/1‑149 (MQ=255) ttGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGc > 1:339635/1‑148 (MQ=255) gAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGcgac < 3:105368/148‑1 (MQ=255) ttGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGaa < 8:312880/148‑1 (MQ=255) t‑ggGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTa > 5:5197/1‑149 (MQ=255) gggTTACAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTAc > 3:264155/1‑149 (MQ=255) ggTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTAc < 6:108419/148‑1 (MQ=255) gTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGc > 7:247465/1‑149 (MQ=255) gTTACAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAACCCAATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGc > 3:264038/1‑149 (MQ=255) aCAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTg < 3:18725/112‑1 (MQ=255) aCAGTG‑C‑CGCGCGCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTg > 4:18725/1‑112 (MQ=255) cAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGGCAGAGCGACGAACTCTACGCCttt < 8:20995/149‑1 (MQ=255) cAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCttt > 1:372792/1‑149 (MQ=255) aGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTc > 7:251271/1‑149 (MQ=255) gTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCg < 6:29755/149‑1 (MQ=255) cgctcg‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGTCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGa < 7:350397/148‑1 (MQ=255) cg‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCttt < 2:339635/149‑1 (MQ=255) g‑gCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTTc < 6:146699/149‑1 (MQ=255) | GCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGT‑GGGTTACAGTG‑CGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTG‑CTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTTC > NC_002947/837863‑838155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |