| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,223,620:1 | +C | 7.1% | coding (314/681 nt) | PP_2824 ← | TetR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,223,620 | 1 | . | C | 7.1% | 334.9 / 19.5 | 85 | coding (314/681 nt) | PP_2824 | TetR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (38/41); new base C (3/3); total (41/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTTGGTATAGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCATGGTGGCAC > NC_002947/3223475‑3223767 | gTTGGTATAGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GAt > 7:283614/1‑149 (MQ=255) ttGGTATAGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGTATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATc < 2:230225/149‑1 (MQ=255) tataGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCATCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAgg < 8:278116/149‑1 (MQ=255) aGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTc > 5:165045/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGAT‑CATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGac < 2:58334/149‑2 (MQ=255) cgcTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑AGGTCGac < 4:185913/149‑2 (MQ=255) cgcTGCTTGAAGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGAt < 7:147186/149‑1 (MQ=255) ctgctTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGt > 2:1566/1‑149 (MQ=255) ctTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTcc < 4:350465/148‑1 (MQ=255) ctTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTc > 6:252867/1‑147 (MQ=255) gatgaCACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCcag > 8:114293/1‑147 (MQ=255) tgaCACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATACATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGt > 3:209864/1‑149 (MQ=255) gaCACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTg > 6:3456/1‑149 (MQ=255) acacTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGc < 7:40120/149‑1 (MQ=255) acacTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGc < 5:318016/149‑1 (MQ=255) acacTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTAGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGc < 1:33485/149‑1 (MQ=255) cacTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑AGGTCGa > 4:173549/1‑135 (MQ=255) cacTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCTCGATC‑AGGTCGa < 3:173549/135‑1 (MQ=255) cacTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCg > 6:313174/1‑149 (MQ=255) cTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTc > 2:95792/1‑149 (MQ=255) cTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTc < 2:81096/149‑1 (MQ=255) tGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTc > 4:285614/1‑148 (MQ=255) gCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGa < 2:205617/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGTGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGaa > 2:190694/1‑148 (MQ=255) gTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAggg > 5:250636/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAgg < 7:114293/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAgg < 1:1566/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGGCATGGGGGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGTCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGTTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAgg < 4:174560/148‑1 (MQ=255) cGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGTGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTg < 1:190694/149‑1 (MQ=255) ggCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTgcg < 5:313174/149‑1 (MQ=255) gCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCcag > 6:241377/1‑116 (MQ=255) gCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCcag < 5:241377/116‑1 (MQ=255) aTGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCaa > 8:46533/1‑149 (MQ=255) ggTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACgg > 8:139792/1‑149 (MQ=255) gAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCAc > 7:346082/1‑149 (MQ=255) ttGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCa > 2:270140/1‑149 (MQ=255) aGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCAtctc < 7:283273/149‑1 (MQ=255) aGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATttc < 5:252867/149‑1 (MQ=255) gCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCAtt < 5:9249/146‑1 (MQ=255) gCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCAtt > 6:9249/1‑146 (MQ=255) cATGCAAGTCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCTTCGACTTTGt > 8:132422/1‑112 (MQ=255) cATGCAAGTCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCTTCGACTTTGt < 7:132422/112‑1 (MQ=255) tGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCt > 4:252125/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCGGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCtt > 3:266684/1‑149 (MQ=255) aGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCttgtt < 1:95792/149‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCttgttg > 6:59635/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTATGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCttgttg < 1:270140/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGACGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTgg > 2:346205/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGc > 1:184664/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAag < 2:184664/148‑1 (MQ=255) aGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACcgc < 3:285614/149‑1 (MQ=255) ggCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACcgcg < 4:126062/149‑1 (MQ=255) ggCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACcgcg > 3:126062/1‑149 (MQ=255) gCTGATCCATTGGTGCCTCTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCgcgc < 6:374865/149‑1 (MQ=255) gCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCcag < 3:309528/66‑1 (MQ=255) gCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCcag > 4:309528/1‑66 (MQ=255) tGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCt > 3:102230/1‑149 (MQ=255) aTCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCtg < 4:266684/148‑1 (MQ=255) tCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCttgttg < 5:264075/122‑1 (MQ=255) tCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCttgttg > 6:264075/1‑122 (MQ=255) ccATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGAAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAAAGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTgtgg > 4:273528/1‑149 (MQ=255) aTTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTgtggtg > 3:68076/1‑149 (MQ=255) gTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCAcc > 7:299767/1‑149 (MQ=255) cTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGtg < 4:209864/147‑1 (MQ=255) aaTAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGtgctgc < 3:252125/148‑1 (MQ=255) aaTAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGtgctgc < 4:362971/148‑1 (MQ=255) aaTAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGtgctg < 6:165045/147‑1 (MQ=255) aaTAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTgcg > 4:111104/1‑149 (MQ=255) aaTAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTgcg > 6:349570/1‑149 (MQ=255) aaTAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGACGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGtgctgc < 1:346205/148‑1 (MQ=255) aaGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCa > 1:13319/1‑149 (MQ=255) cGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCt > 8:45307/1‑149 (MQ=255) cTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTgtgg < 3:237083/122‑1 (MQ=255) cTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTgtgg > 4:237083/1‑122 (MQ=255) gATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTgcgc < 7:46533/148‑1 (MQ=255) aTGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTgtgg < 7:182077/118‑1 (MQ=255) aTGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTgtgg > 8:182077/1‑118 (MQ=255) catCGACCTCGATC‑AGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTgcgc < 6:359917/134‑1 (MQ=255) catCGACCTCGATC‑AGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTgcgc > 5:359917/3‑136 (MQ=255) atCGACCTCGATC‑AGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCAtgg > 3:67859/2‑149 (MQ=255) tCGACCT‑GATCGAGGTCTATGTCCAGCAGTGCGTCGAATTTGTCGAACAGGGGCTGGGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCTCCACCTTGCGCAtggt < 7:131060/149‑1 (MQ=255) tCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCAtggt < 6:250636/149‑1 (MQ=255) gACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCAtggtgg > 4:342324/1‑149 (MQ=255) ccT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCATGGTGGCa < 7:45307/149‑1 (MQ=255) cT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCATGGTGGCAc < 2:13319/149‑1 (MQ=255) | GTTGGTATAGCGCTGCTTGATGACACTGGCGAACGCGGGCTGGTGCCGGGCATGGGTGAGCAGTTGCAGCCATGCAAGCCAGTTGCCTGGCTCGTCAAGGCTGATCCATTGGTGCCACTGCTCAATAAGCGACTTGATGTCGACCT‑GATCGAGGTCGATGTCCAGCAGTGCGTCGACTTTGTCGAACAGGGTCTGCGCAACGGCACTGACCATTTCTTCCTTGTTGGCGAAGTAGTAGGTCACCGCGCCTGTGGTGCACCCGGCGTGCTGCGCCACCTTGCGCATGGTGGCAC > NC_002947/3223475‑3223767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |