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tt‑CCCTGGCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGCGCAAGGCGTTGGTGTTCTCGATGCTCTGCCTGTTCACCAGCCTGGGCGTGAAGTACCTGACCTGACCCATTGATAGGAGACAACGAATGAAAACCGCATTTGTAACCGGTGCtt < 1:20794/149‑1 (MQ=255) cccTGGCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGcgcaaggccaggggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaagcaccgatgtt < 1:259655‑M2/149‑118 (MQ=255) ccTGGCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGAGCAATGCGTTGGTGTTCTCGATGATATGCCTGTTCAACAGCCGGGGCGTGAAGTACCTGACCTGACCCATTGATAGGAGACAACTAATGAAAACAGCATTTGTAACCGGTGCTTcat > 4:74174/1‑147 (MQ=255) cTGGCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGcgcaaggccagggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaagcaccgatgttgga > 7:50932‑M2/1‑30 (MQ=255) cTGGCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGcgcaaggccagggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaagcaccgatgttgg < 8:50932‑M2/148‑119 (MQ=255) cTGGCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGcgcaaggccagggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaa > 8:70964‑M2/1‑30 (MQ=255) cTGGCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGcgcaaggccagggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaa < 7:70964‑M2/135‑106 (MQ=255) ccgtcttgcGcaccacgtcgttgcctttacgcaaggccagggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaagcaccgatgttggaa < 1:320597‑M1/145‑140 (MQ=255) ggCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGcgcaaggccagggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaagcaccgatgttggaag < 3:258090‑M2/149‑122 (MQ=255) gCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGCGCAAGGCGTTGGTGTTCTCGATGCTCTGCCTGTTGACCAGCCTGGGCGTGAAGTACCTGACCTGACGCATTGATAGGAGACATCGAATGAAAACCGCATTTGTAACCGGTGCTTCCTCa < 2:245504/147‑1 (MQ=255) gCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGCGCAAGGCGTTGGTGTTCTCGATGCTCTGCCTGTTCACCAGCCTGGGCGTGAAGTACCTGACCTGACCCATTGATAGGAGACAACGAATGAAAACCGCATTTGTAACCGGTGCTTCCTCAgg < 3:225287/149‑1 (MQ=255) cTTGCGcaccacgtcgttgcctttacgcaaggccagggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaagcaccgatgttggaagcg > 7:48950‑M1/1‑6 (MQ=255) gcgcaccacgtcgttgcctttacgcaaggccagggaactgcccaggtggttaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaagcaccgatgttggaagcgaa < 4:333019‑M1/147‑145 (MQ=255) gcgcaccacgtcgttgcctttacgcaaggccagggaactgcccaggtgggtaccgaggatgttgcaggccacaagtggcaatgccagcaggtagacgaccttgcctgcgctgacgaacgccaccaaagcaccgatgttggaagcgaa < 5:214823‑M1/147‑145 (MQ=255) gCGTAAAGGCAACGACGTGGTGCGCAAGGCGTTGGTGTTCTCGATGCTCTGCCTGTTCACCAGCCTGGGCGTGAAGTACCTGACCTGACCCATTGATAGGAGACAACGAATGAAAACCGCATTTGTAACCGGTGCTTCCTCAGGCttt < 5:230816/148‑1 (MQ=255) cGTAAAGGCAACGACGTGGTGCGCAAGGCGTTGGTGTTCTCGATGCTCTGCCTGTTCACCAGCCTGGGCGTGAAGTACCTGACCTGACCCATTGATAGGAGACAACGAATGAAAACCGCATTTGTGACCGGTGCTTCCTCAGGCTTTg < 6:214823/148‑1 (MQ=255) cGTAAAGGCAACGACGTGGTGCGCAAGGCGTTGGTGTTCTCGATGCTCTGCCTGTTCACCAGCCTGGGCGTGAAGTACCTGACCTGACCCATTGATAGGAGACAACGAATGAAAACCGCATTTGTAACCGGTGCTTCCTCAGGCTTTg < 8:269941/148‑1 (MQ=255) agTAAAGGCAACGACGTGGTTCTCAAGGCGTTGTTGTGATCTCTGCTCTGCCTGTTCACCAGCCTGGGAGTGAAGTACCAGACCTGACCCATTGATAGGAGACAACGAATGAAAACCGCATTTGTAACCGGTGCTTCCTCAGGCTTTgg < 8:327470/148‑1 (MQ=255) | GCCAACTCCAAAACCTTCAACTTCGCTTCCAACATCGGTGCTTTGGTGGCGTTCGTCAGCGCAGGCAAGGTCGTCTACCTGCTGGCATTGCCACTTGTGGCCTGCAACATCCTCGGTAACCACCTGGGCAGTT‑CCCTGGCCTTGCGTAAAGGCAACGACGTGGTGCGCAAGGCGTTGGTGTTCTCGATGCTCTGCCTGTTCACCAGCCTGGGCGTGAAGTACCTGACCTGACCCATTGATAGGAGACAACGAATGAAAACCGCATTTGTAACCGGTGCTTCCTCAGGCTTTGG > NC_002947/573803‑574095 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |