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> 1:223891/1‑124 (MQ=255) gtAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAgtg < 2:223891/124‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCtgtg < 8:146707/149‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCtgt < 6:310579/148‑1 (MQ=255) gggCCTGGACCTGGAAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGa < 6:130529/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGACCTGGAAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTTGATGAGCGCGCTTCCAGTGCCCTGTGGAg < 6:218047/149‑1 (MQ=255) 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gacctggaAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAAc < 4:164742/147‑1 (MQ=255) acctggaAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGAc < 2:238384/149‑1 (MQ=255) cctggaAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACa < 6:3871/149‑1 (MQ=255) CTGGAAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAg < 6:286830‑M1/149‑1 (MQ=255) | AACGGTGTGCCGGTGTGGGAGAGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGCCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAG > NC_002947/990747‑991042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |