New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1846959 = | 71 (1.180) | 5 (0.120) +TTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCT |
5/186 | NT | 9.2% | coding (1250/1377 nt) | pfeS‑II | histidine kinase |
? | NC_002947 | 2435235 = | NA (NA) | intergenic (+82/‑222) | PP_2133/PP_2134 | hypothetical protein/transposase |
GAGGGTAGCTATTGGTGGTTGTGGCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTGAAGGGAGGAGGAGGG > NC_002947/1846817‑1847107 | ggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaagaggccggcacatgcaacggcaacctcatccacaagcgcaaCCCGc > 3:299338‑M1/145‑149 (MQ=255) gAGGGTAGCTATTGGTGGTTGTGGCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGTGGGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCg > 1:275199/1‑147 (MQ=255) gAGGGTAGCTATTGGTGGTTGTGGCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAg > 5:1444/1‑149 (MQ=255) gTAGCTATTGGTGGTTGTGGCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑Gc > 7:343281/1‑148 (MQ=255) ttGGTGGTTGTGGCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAgc > 6:58994/1‑149 (MQ=255) gtggtTGTGGCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAgcgc < 7:213653/148‑1 (MQ=255) ggCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGggcgg > 1:75736/1‑148 (MQ=255) gCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCa < 6:1444/149‑1 (MQ=255) ttGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCAcc > 6:27171/1‑149 (MQ=255) ttGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCAcc > 1:295516/1‑149 (MQ=255) ttGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCAcc > 5:18479/1‑149 (MQ=255) gAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCtt > 6:51795/1‑149 (MQ=255) aGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCtt < 5:47997/148‑1 (MQ=255) aGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGGGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCtt < 3:366859/148‑1 (MQ=255) gATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTtgtg > 3:276110/1‑149 (MQ=255) gATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTtgtg < 6:324156/149‑1 (MQ=255) aTGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGCCGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTgg < 7:349894/149‑1 (MQ=255) gggTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGgcgc < 5:27171/149‑1 (MQ=255) gggTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGgcg > 1:334592/1‑148 (MQ=255) tcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaagaggccggcacatgcaacggcaacctcatccacaagcgcaaCCCGCGTTTGCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGgcg < 6:298158‑M1/42‑1 (MQ=255) cGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATg < 1:368491/149‑1 (MQ=255) cTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAAcgc < 1:86612/149‑1 (MQ=255) atggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaagaggccggcacatgcaacggcaacctcatccacaagcgcaaCCCGCGTTTGCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCaaa > 5:298158‑M1/95‑148 (MQ=255) tGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAAcgcg > 6:150964/1‑149 (MQ=255) tGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAAcgcg > 2:43787/1‑149 (MQ=255) ggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaagaggccggcacatgcaacggcaacctcatccacaagcgcaaCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAAcgcg < 2:105705‑M1/57‑1 (MQ=255) aagaagACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAAcgc > 5:302535/1‑146 (MQ=255) aagaagACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAAcgc < 6:302535/146‑1 (MQ=255) ccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaagaggccggcacatgcaacggcaacctcatccacaagcgcaaCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCggg > 1:105705‑M1/91‑149 (MQ=255) agaagaCCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGt > 6:160608/1‑149 (MQ=255) agaCCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTgc < 5:150964/149‑1 (MQ=255) cTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCTGCCCGGGGATGGTCGCTTCGGCCTGCGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCtt > 5:307845/1‑149 (MQ=255) cTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCtt > 1:108933/1‑149 (MQ=255) cTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCtt > 2:274847/1‑149 (MQ=255) ctcccttcaagtcctaccatacaagcgggtttacccgcgaagaggccggcacatgcaacggcaacctcatccacaagcgcaaCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTgcgc > 8:298702‑M1/83‑147 (MQ=255) gAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTtgt < 2:334592/148‑1 (MQ=255) gAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTAGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTtgtg > 7:283289/1‑149 (MQ=255) aaCGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTtgtg > 5:249099/1‑148 (MQ=255) ttCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGCTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGCCGCCCCCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGtt > 2:128509/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTg > 7:35849/1‑149 (MQ=255) cgcgCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCATAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAg < 1:43787/144‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGc < 2:275199/148‑1 (MQ=255) gTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGc < 5:58994/149‑1 (MQ=255) ttttCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGCCCTGGGGATGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTCGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTAGTGGATGAGGTTGCCGTTGCa > 2:120133/1‑149 (MQ=255) ggTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCg < 5:51795/149‑1 (MQ=255) gTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCgg > 7:121065/1‑149 (MQ=255) aCGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAGTCAACGCCCCCATT‑GCAATCCAGCGCCAGGCCGGCACGTTGTGGGCGCATAATGGAAAACGCGGGTTGCGGTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGccac > 1:259988/1‑147 (MQ=255) aCGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCctct < 5:254528/149‑1 (MQ=255) cGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCtt > 1:180047/1‑149 (MQ=255) ggTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTc > 7:23183/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGCCCGGGGATTGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATACAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTTGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTcgc < 6:307845/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAACCGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTcgc < 6:72192/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTcgc < 2:75736/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTcgc < 7:184157/149‑1 (MQ=255) cgcgGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTcgcg < 2:370878/148‑1 (MQ=255) gcgGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCgg < 6:18479/148‑1 (MQ=255) gCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCATGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTa > 5:194337/1‑148 (MQ=255) ccGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 5:2154/1‑149 (MQ=255) ggggATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGGCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAgcc > 8:129921/1‑149 (MQ=255) gggATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 5:112735/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCtt < 2:295516/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCtt < 8:35849/149‑1 (MQ=255) tggtggCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTg > 1:295748/1‑149 (MQ=255) ggtggCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTg > 2:137175/1‑148 (MQ=255) ggtggCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGt > 3:81657/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATg < 2:295748/149‑1 (MQ=255) gCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATgg > 4:230866/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATgg < 2:180047/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATgg > 6:100145/1‑147 (MQ=255) cGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTa < 2:259988/147‑1 (MQ=255) cGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTa < 5:100145/147‑1 (MQ=255) cGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTAGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTa < 8:283289/147‑1 (MQ=255) ccTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACt > 4:23417/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGCCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACtt > 5:52161/1‑149 (MQ=255) gggCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTg < 3:23417/147‑1 (MQ=255) ggCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTGAAg < 3:230866/149‑1 (MQ=255) aG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGTCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTGAAGggag < 6:52161/148‑1 (MQ=255) g‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTGGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTGAAGggagga < 8:343281/149‑1 (MQ=255) cATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTGAAGggaggag < 4:276110/149‑1 (MQ=255) gCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTGAAGGGaggaggagg > 3:183992/1‑149 (MQ=255) cccGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 6:351653/1‑117 (MQ=255) cccGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 5:351653/117‑1 (MQ=255) cccGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTGAAGGGAGGAGGAggg > 1:206946/1‑149 (MQ=255) | GAGGGTAGCTATTGGTGGTTGTGGCTTGAGGATGAGGGTGGCGGGGT‑GGCTGAAGAAGACCTGGAACGGATCTTCGCGCCGTTTTCGCGGTTGGACGGTTCGCGGCCCGGGGATGGTGGCTTCGGCCTGGGGCTGAG‑CATCGCCCGCAGT‑GCCATCCAGCGCCAGGGCGGCACCTTGTGGGCGCAGAATGGCAAACGCGGGTTGCGCTTGTGGATGAGGTTGCCGTTGCATGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTGTATGGTAGGACTTGAAGGGAGGAGGAGGG > NC_002947/1846817‑1847107 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |