New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3210516 | 45 (0.750) | 6 (0.110) | 5/252 | NT | 11.4% | coding (210/870 nt) | PP_2814 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3210571 | 51 (0.900) | coding (155/870 nt) | PP_2814 | hypothetical protein |
CGTGGTCAGCCACCAGTCACCGGACTCCGGGGCGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCTCAGCAGCGCAATCTCTT > NC_002947/3210369‑3210664 | cGTGGTCAGCCACCAGTCACCGGACTCCGGGGCGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGTAACTCg‑g < 1:370063/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCACCAGTCACCGGACTCCGGGGCGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GAt < 1:252807/149‑1 (MQ=255) ccaccaGTCACCGGACTCCGGGGCGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAgct > 8:39359/1‑149 (MQ=255) ccGGACTCCGGGGCGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGctcgtgctcgtg > 3:215456/1‑149 (MQ=255) cGGGGCGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGc > 6:119194/1‑149 (MQ=255) ggggCGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGcc < 7:39359/149‑1 (MQ=255) cGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCa > 2:214612/1‑149 (MQ=255) gTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCAt > 5:297207/1‑149 (MQ=255) gTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCAt > 3:204245/1‑149 (MQ=255) aCGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAgcgc > 4:234114/1‑149 (MQ=255) gTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCgg > 8:91911/1‑149 (MQ=255) ttCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGc < 4:204245/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAggg < 7:91911/149‑1 (MQ=255) aGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAgggg < 8:236757/149‑1 (MQ=255) aGTTCGTGGAAGAGGGCGTGATCGATGACTTCCACACGTAAGGTGTTGCTGT‑GGGTGAAGATGGTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGGCATGGAACTCGTGC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAggg < 1:87894/149‑1 (MQ=255) ttCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAgggggg > 2:139874/1‑149 (MQ=255) tGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTc > 3:283440‑M2/1‑148 (MQ=255) aaGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTcgag < 7:186471‑M2/149‑5 (MQ=255) tggcgtcAGCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCGGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCg < 3:31295/146‑1 (MQ=255) gtcgtcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCgt > 7:259880/1‑149 (MQ=255) tcgtcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCGacgcccccctggccgcgctcgatgccggctccaggcacgagcacgagctgatcgccgagttccat < 4:48597‑M1/149‑66 (MQ=255) tcgtcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCGacgcccccctggccgcgctcgatgccggctccaggcacgagcacgagctgatcgccgagttccat > 3:48597‑M1/1‑84 (MQ=255) tcgtcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCgtt < 3:234114/149‑1 (MQ=255) cgtcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGTAGGTTCACGAGTTTGTTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCAATGGAAATCG‑GC‑TATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGACCCGGCATCGCCCGCGGCAAGGGGGGCGACGAGTTCttt > 1:250478/1‑149 (MQ=255) cgtcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCgttg > 2:302752/1‑149 (MQ=255) gtcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCgttgt < 4:201427/149‑1 (MQ=255) gtcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCgttgt < 1:139874/149‑1 (MQ=255) tcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCgttgtt < 8:259880/149‑1 (MQ=255) gcATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCgttgtt < 7:214805/148‑1 (MQ=255) cATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCgttgtt > 2:298578/1‑148 (MQ=255) aTCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGa < 5:119194/149‑1 (MQ=255) gAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATcc < 4:215456/149‑1 (MQ=255) gAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATc < 1:214612/148‑1 (MQ=255) aCTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAggg < 4:208481/121‑1 (MQ=255) aCTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAggg > 3:208481/1‑121 (MQ=255) ccTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGa < 8:186471/147‑1 (MQ=255) tCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTg > 8:239714/1‑149 (MQ=255) tCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTg > 2:310662/1‑149 (MQ=255) aCGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCGacgcccccctggccgcgctcgatgccggctccaggcacgagcacgagctgatcgccgagttccat > 6:106248‑M1/1‑64 (MQ=255) aCGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCGacgcccccctggccgcgctcgatgccggctccaggcacgagcacgagctgatcgccgagttccat < 5:106248‑M1/129‑66 (MQ=255) aCGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGtt < 3:229929/149‑1 (MQ=255) gTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCTTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAgggg > 3:253096/1‑148 (MQ=255) cTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCa > 4:100614/1‑149 (MQ=255) tgtgt‑gGGTTTCGTTGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAAATCG‑GC‑GATCAGCTAGTGCTCGTGCGTGGAGCCGTCATCGAGGGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTGGTTGTTGATCCGT‑AGGACTTGTTCAGGGGTCa < 2:364687/144‑1 (MQ=255) ggTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGc < 7:101468/149‑1 (MQ=255) gTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCg < 3:100614/149‑1 (MQ=255) gACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GCGGATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCg > 1:265301/1‑148 (MQ=255) gAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCGacgcccccctggccgcgctcgatgccggctccaggcacgagcacgagctgattgccgagttcca < 3:22335‑M1/104‑65 (MQ=255) gAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCGacgcccccctggccgcgctcgatgccggctccaggcacgagcacgagctgattgccgagttcca > 4:22335‑M1/1‑40 (MQ=255) gttggttAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAgg > 3:365717/1‑126 (MQ=255) gttggttAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAgg < 4:365717/126‑1 (MQ=255) tttGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCTTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCtt < 4:253096/149‑1 (MQ=255) gTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTc < 1:310662/149‑1 (MQ=255) tGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCt > 5:100692/1‑149 (MQ=255) aTGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGTGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCTca < 7:239714/149‑1 (MQ=255) aTGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTcgagttccatggccatcagaccaaacggctaaccaacctcgtcacccacagcaagacctttcgtgaggaagtcctcgatgacga > 3:48597‑M2/1‑65 (MQ=255) aTGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTcgagttccatggccatcagaccaaacggctaaccaacctcgtcacccacagcaagacctttcgtgaggaagtcctcgatgacga < 4:48597‑M2/149‑85 (MQ=255) aTGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTcgagttccatggccatcagaccaaacggctaaccaacctcgtcacccacagcaagacctttcgt < 5:106248‑M2/129‑65 (MQ=255) aTGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTcgagttccatggccatcagaccaaacggctaaccaacctcgtcacccacagcaagacctttcgt > 6:106248‑M2/1‑65 (MQ=255) tGGAACTCG‑GC‑AATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTcgagttccatggccatcagaccaaacggctaaccaacctc < 3:22335‑M2/104‑41 (MQ=255) tGGAACTCG‑GC‑AATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTcgagttccatggccatcagaccaaacggctaaccaacctc > 4:22335‑M2/1‑64 (MQ=255) aCTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCTCAGCAGCGCAAtc > 1:57330/1‑149 (MQ=255) cTCGacgcccccctggccgcgctcgatgccggctccaggcacgagcacgagctgatcgccgagttccatggccatcagaccaaacggctaaccaacctcgtcacccacagcaagacctttcgtgaggaagtcctcgatgacgacctctt < 7:186471‑M1/149‑146 (MQ=255) cTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGTCTAGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCTCAGCAGCGCAAtc < 1:302752/149‑1 (MQ=255) tCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGTGGTCATGAAGTTTAGGATGATTTCCGCACCTGCTTGGTCGCGCAGCAGCGCAAtctc > 5:243404/1‑149 (MQ=255) tCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCTCAGCAGCGCAAtctc > 6:14842/1‑149 (MQ=255) gacgcccccctggccgcgctcgatgccggctccaggcacgagcacgagctgatcgccgagttccatggccatcagaccaaacggctaaccaacctcgtcacccacagcaagacctttcgtgaggaagtcctcgatgacgacctcttcca > 3:283440‑M1/1‑1 (MQ=255) g‑gC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCTCAGCAGCGCAATCTCtt < 6:208022/149‑1 (MQ=255) g‑gC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCTCAGCAGCGCAATCTCtt > 5:208022/1‑149 (MQ=255) | CGTGGTCAGCCACCAGTCACCGGACTCCGGGGCGTAAAGCACGTTCCCCAGTTCGTGGAAGAGGTCGTCATCGAGGACTTCCTCACGAAAGGTCTTGCTGT‑GGGTGACGAGGTTGGTTAGCCGTTTGGTCTGATGGCCATGGAACTCG‑GC‑GATCAGCTCGTGCTCGTGCCTGGAGCCGGCATCGAGCGCGGCCAGGGGGGCGTCGAGTTCGTTGTTGATCCGT‑ACGACTTGTTCAGGGGTCATGAAGTTGCGGATGATTACCGCACCTGCTTGGTCGCTCAGCAGCGCAATCTCTT > NC_002947/3210369‑3210664 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |