New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4513057 = | 52 (0.860) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 7.7% | coding (1935/2505 nt) | ftsK | DNA translocase FtsK |
? | NC_002947 | 4513085 = | 47 (0.830) | coding (1907/2505 nt) | ftsK | DNA translocase FtsK |
GTTCGGCACCGCCCTGGTCGATGATGGTACGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATCGTCCATGCTCTCACGGCGA > NC_002947/4512909‑4513204 | gTTCGGCACCGCCCTGGTCGATGATGGTACGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGTCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGgcc < 7:538/149‑1 (MQ=255) gaagttatccatgacccgctgtatcgccgtgagagcatggacgatgagccgcctgcgctgaaaaccctgccgaccatcgtggtggtggtggacgaattcgccgacatgatgatgatcgtcggcaagaaggtcgaagagctgatCGCCCg > 8:13299‑M1/144‑149 (MQ=255) ccTGGTCGATGATGGTACGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTc > 2:224522/1‑149 (MQ=255) gTCGATGATGGTACGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTgc < 1:351773/148‑1 (MQ=255) tCGATGATGGTACGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTgcgc < 3:235402/149‑1 (MQ=255) gatgatGGTACGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGa < 1:213895/149‑1 (MQ=255) gTACGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACggg < 4:212572/148‑1 (MQ=255) aCGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGa > 4:251758/1‑149 (MQ=255) gAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGTCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAg > 8:209248/1‑149 (MQ=255) aGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGc < 4:142058/149‑1 (MQ=255) agagcatggacgatgagccgcctgcgctgaaaaccctgccgaccatcgtggtggtggtggacgaattcgccgacatgatgatgatcgtcggcaagaaggtcgaagagctgatCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGctc > 3:227182‑M1/113‑148 (MQ=255) aTCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTc > 3:361345/1‑149 (MQ=255) aTCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTc > 3:32101/1‑149 (MQ=255) tCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTc > 2:326209/1‑148 (MQ=255) aggcaccatcagccgcctgcgcttaaaaccctcccgcccaccgtgggggtggtgccctaattcgccgacatcatgatgatcgtcggcaagaaggtcgaagagctgagCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCTATCAGCTCTTCGAc > 8:226‑M1/108‑149 (MQ=255) gCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCg < 1:224522/145‑1 (MQ=255) gCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACct > 4:271513/1‑149 (MQ=255) tCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACcttc > 4:267779/1‑149 (MQ=255) tCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACcttc > 1:225867/1‑149 (MQ=255) gACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACcttc < 5:286279/147‑1 (MQ=255) cTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGAc > 5:60815/1‑138 (MQ=255) cTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGAc < 6:60815/138‑1 (MQ=255) cTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCcga > 5:206629/1‑149 (MQ=255) gAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCcgac < 3:251758/147‑1 (MQ=255) aTACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGatcatcat < 4:330006/149‑1 (MQ=255) aCGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGAtcatcatca > 7:278876/1‑149 (MQ=255) gggATGTTGGCCTTGATC‑AGGCAGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGc > 4:110081/1‑149 (MQ=255) ggATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCCCGTCCCCCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCCGCTCTTCGCCCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGc > 5:331473/1‑148 (MQ=255) ggATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCTGCTCTTCGACCTTCTTGCAGACGATCATCATCATGTCGGc > 5:325424/1‑148 (MQ=255) aTGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGaa < 4:32101/149‑1 (MQ=255) tGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAAt < 1:296708/149‑1 (MQ=255) tGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAAt < 8:278876/149‑1 (MQ=255) ttGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTc < 3:267779/149‑1 (MQ=255) cggcctGATCAAGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCg > 6:182148/6‑149 (MQ=255) gCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTc < 4:361345/149‑1 (MQ=255) ccTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTc > 3:234276/1‑148 (MQ=255) cTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGc < 2:137147/116‑1 (MQ=255) cTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTcca > 4:153522/1‑149 (MQ=255) ttGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCTAGGATCAGGTGAATACCGGCCGACCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGAACATCATCATGTAGGCGAATTCGTccac > 6:321144/1‑149 (MQ=255) tC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTccaccacc < 3:271513/149‑1 (MQ=255) cGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGCCCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCcaccaccaccac > 3:25072/1‑148 (MQ=255) tGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATg < 2:225867/149‑1 (MQ=255) tGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATg < 6:206629/149‑1 (MQ=255) ccACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAgg > 4:350665/1‑149 (MQ=255) gacatgatgatgatcgtcgcgcaagaaggtcgaagagctgatCGCCCGTGCCTTCTGCGCGAt > 1:72049‑M1/43‑63 (MQ=255) gacatgatgatgatcgtcggcaagaaggtcgaagagctgatCGCCCGTGCCTTCTGCGCGAt < 2:72049‑M1/21‑1 (MQ=255) ccGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACTATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGtt > 6:289794/1‑149 (MQ=255) cgcTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGAACTTCTTGCCGACGATCATCATCTTATCGGCGAATTCGTCAACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAgcg > 4:105986/1‑148 (MQ=255) cTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAg < 1:326209/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGTCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGATGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAggc < 5:158497/148‑1 (MQ=255) gTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAggcgg < 5:182148/149‑1 (MQ=255) aGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATc < 4:234276/149‑1 (MQ=255) tCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATCGTcc < 3:153522/149‑1 (MQ=255) aaGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTGCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATCGTCCa < 4:277613/148‑1 (MQ=255) aGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATCGTCCAt < 6:325424/149‑1 (MQ=255) ggTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGt > 1:304226/1‑81 (MQ=255) ggTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGt < 2:304226/81‑1 (MQ=255) tGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATCGTCCATGct > 8:236183/1‑149 (MQ=255) gccgccCGTTCCTTCTTGGCGATTCGGGCGTTGATCTCTTCGACCTTCATGCCGACGATGATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATCGTCCATGCTCTCACGGCg < 5:321144/149‑1 (MQ=255) ccgccCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATCGTCCATGCTCTCACGGCGa < 5:289794/149‑1 (MQ=255) | GTTCGGCACCGCCCTGGTCGATGATGGTACGCGAGTCGATCTTGCTCGACACCTGGAACGCCATACGAGTCGGGATGTTGGCCTTGATC‑AGGCCGGTGATCACGTCCACCGACGGGCGCTGGGTGGCGAGGATCAGGTGAATACCGGCCGCCCGTGCCTTCTGCGCGATACGGGCGATCAGCTCTTCGACCTTCTTGCCGACGATCATCATCATGTCGGCGAATTCGTCCACCACCACCACGATGGTCGGCAGGGTTTTCAGCGCAGGCGGCTCATCGTCCATGCTCTCACGGCGA > NC_002947/4512909‑4513204 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |