| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5227211 | 66 (1.100) | 4 (0.070) | 3/250 | NT | 5.8% | coding (1848/2391 nt) | PP_4606 | ferric siderophore receptor |
| ? | NC_002947 | = 5227226 | 68 (1.200) | coding (1833/2391 nt) | PP_4606 | ferric siderophore receptor | |||||
GCTCCAGCGCTCGCTGAGCTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCAT > NC_002947/5227064‑5227359 | gCTCCAGCGCTCGCTGAGCTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAggg > 7:344520/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCGCTCGCTGAGCTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGt < 3:4074/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGCTCGCTGAGCTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTg > 1:323530/1‑149 (MQ=255) gcgcTCGCTGAGCTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCtg < 6:306559/149‑1 (MQ=255) gctGAGCT‑GCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGCCCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCg > 8:353707/1‑149 (MQ=255) ctGAGCTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCg < 2:323530/149‑1 (MQ=255) tGAGCTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCgg > 2:277427/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGTGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGcctg > 7:322331‑M2/1‑145 (MQ=255) gCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGcctggc > 3:131166‑M2/1‑142 (MQ=255) ccGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGccgcatcacaggcaccctggcat < 6:363562‑M1/149‑24 (MQ=255) aCGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAg < 7:217290/149‑1 (MQ=255) aGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGgc < 8:344520/149‑1 (MQ=255) ccACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGcc < 4:166780/148‑1 (MQ=255) acacCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAg > 8:210688/1‑149 (MQ=255) acCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCt > 6:105780/1‑149 (MQ=255) ccGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTc > 7:346804/1‑149 (MQ=255) ccGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGCCGCATCACAGGCACcctggcattgttcgatatcaccaagcgca > 4:289639‑M2/1‑120 (MQ=255) cgcgTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTcc > 1:280728/1‑149 (MQ=255) gAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCGTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGc > 4:235498/1‑149 (MQ=255) aCTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCt < 1:277427/149‑1 (MQ=255) cTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCtt > 1:315252/1‑149 (MQ=255) tGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGACAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGAGATGCGGCCTGGCATCTCGAGCTTGGCGCCCAGCACCCACGCCTTg > 4:110347/1‑149 (MQ=255) ccTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGccgcatcacaggcaccctggcat > 1:329075‑M1/1‑92 (MQ=255) ccTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGccgcatcacaggcaccctggcat < 2:329075‑M1/115‑24 (MQ=255) cTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTACTAATTCGCTTGGTGATATAGAAAAATTCCAGGGTGCCTTTTAATCCGCCAGGCATGTAGATCTTGGCGCCCAGCTGCCACGCCGTGcc > 1:106926/1‑148 (MQ=255) cTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCcct > 2:110896/1‑149 (MQ=255) tCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCcctc > 8:6234/1‑149 (MQ=255) aCCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGAAAGGGTGCCTGTTATGCGGCCTGGCATGTCTAGCTTGGCGCCCCGCTCCCACGCCTTGCcctcct > 2:117612/1‑149 (MQ=255) cccGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCtt < 6:222126/140‑1 (MQ=255) cccGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCtt > 5:222126/1‑140 (MQ=255) cGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAg < 8:234476/149‑1 (MQ=255) gCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGAGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAgg > 2:156917/1‑149 (MQ=255) cATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGt > 6:309844/1‑149 (MQ=255) cTGTAGACCGTCTCGCTTATGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCAc > 5:86796/1‑149 (MQ=255) tGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTC‑GGTGGCAcct > 3:258223/1‑148 (MQ=255) tGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGACTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGCGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCAcc > 2:311140/1‑149 (MQ=255) gTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCAcc > 6:293882/1‑148 (MQ=255) tAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑ga < 7:353707/149‑1 (MQ=255) gACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gagg > 8:51078/1‑149 (MQ=255) gACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag > 1:249525/1‑148 (MQ=255) gACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag > 1:35522/1‑148 (MQ=255) aCCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gagga < 5:105780/149‑1 (MQ=255) cGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑t > 6:131442/1‑149 (MQ=255) cGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTC‑GGTGGCACCTgaggagg < 4:258223/149‑2 (MQ=255) tctcGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCATTAC‑ATTGCGCTTGTTGATATCTAACAATGCCATGGTGCCTGTGATGCGTCCTGTCATGTCTAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCg < 1:117612/149‑1 (MQ=255) tctcGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag < 2:17297/143‑1 (MQ=255) tctcGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑gag > 1:17297/1‑143 (MQ=255) tcGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAg > 3:138058/1‑149 (MQ=255) gCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCa < 7:51078/149‑1 (MQ=255) aCGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACAtt > 5:288929/1‑149 (MQ=255) ggCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGc < 1:110896/149‑1 (MQ=255) gTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCgg > 8:130727/1‑149 (MQ=255) aaaGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGt > 3:143586/1‑147 (MQ=255) aaaGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTc < 2:280728/148‑1 (MQ=255) ccAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATg < 4:138058/149‑1 (MQ=255) cAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATgg > 5:240923/1‑149 (MQ=255) ggaC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGCGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTc < 8:207976/147‑1 (MQ=255) gTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGCGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTc < 1:156917/149‑1 (MQ=255) tAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTc > 4:89844/1‑148 (MQ=255) ttGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGtt < 4:145150/149‑1 (MQ=255) tGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGgtgcctgtgatgcggcctggcattgttcgatatcaccaagcgcaatgtactggtctcgaactttgacgccgtcacaagcgagacggtctacagcaatgcgggtgaggtcagttcacgcgg > 4:289639‑M1/1‑29 (MQ=255) gcgcTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGGGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTg < 3:110347/148‑1 (MQ=255) gTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGaa < 6:348261/149‑1 (MQ=255) gTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGaa < 2:315252/149‑1 (MQ=255) tatCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGAc < 8:346804/149‑1 (MQ=255) tCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAGTTCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACt < 1:101729/149‑1 (MQ=255) tCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTc > 4:348764/1‑149 (MQ=255) cGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTg < 1:84477/134‑1 (MQ=255) cGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTg > 2:84477/1‑134 (MQ=255) gAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCt > 1:161528/1‑56 (MQ=255) gAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCt < 2:161528/56‑1 (MQ=255) gAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCg < 5:309844/148‑1 (MQ=255) aCAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTg < 2:35522/149‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGa < 4:330399/141‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGa > 3:330399/1‑141 (MQ=255) aTGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGcctggcattgttcgatatcaccaagcgcaatgtactggtctcgaactttgacgccgtcacaagcgagacggtctacagcaatgcgggtgaggtcagttcacgcggtgtggaactcgacgtgaccgg < 6:363562‑M2/149‑127 (MQ=255) aTGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGcctggcattgttcgatatcaccaagcgcaatgtactggtctcgaactttgacgccgtcacaagcgagacggtctacagcaatgcgggtgagg > 1:329075‑M2/1‑23 (MQ=255) aTGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGcctggcattgttcgatatcaccaagcgcaatgtactggtctcgaactttgacgccgtcacaagcgagacggtctacagcaatgcgggtgagg < 2:329075‑M2/115‑93 (MQ=255) aTGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAg < 2:106926/149‑1 (MQ=255) gCCAGGccgcatcacaggcaccctggcattgttcgatatcaccaagcgcaatgtactggtctcgaactttgacgccgtcacaagcgagacggtctacagcaatgcgggtgaggtcagttcacgcggtgtggaactcgacgtgaccggc > 3:131166‑M1/1‑6 (MQ=255) cAGGccgcatcacaggcaccctggcattgttcgatatcaccaagcacaatgtactggtctcgaactttgacgccgtcacaagcgagacggtctacagcaatgcgggtgaggtcagttcacgcggtgtggaactcgacgtgaccggccag > 7:322331‑M1/1‑4 (MQ=255) ggTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCAt < 3:348764/149‑1 (MQ=255) | GCTCCAGCGCTCGCTGAGCTGGCCGGTCACGTCGAGTTCCACACCGCGTGAACTGACCTCACCCGCATTGCTGTAGACCGTCTCGCTTGTGACGGCGTCAAAGTTCGAGACCAGTAC‑ATTGCGCTTGGTGATATCGAACAATGCCAGGGTGCCTGTGATGCGGCCTGGCATGTCGAGCTTGGCGCCCAGCTCCCACGCCTTGCCCTCCTCAGGTGCCACC‑GAGGAG‑TCGAGCACGACATTGCCGGTCAGCGGCGCGATGGTCGAGTTGGGCTTGAACGACTCGCTGTAGCTGCCAT > NC_002947/5227064‑5227359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |