New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5676552 = | 72 (1.200) | 5 (0.090) | 5/256 | NT | 6.9% | coding (1453/1860 nt) | PP_4983 | amine oxidase |
? | NC_002947 | 5676621 = | 65 (1.120) | coding (1384/1860 nt) | PP_4983 | amine oxidase |
TGGCGCTTGCGCCCCGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCACGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTCCAGGGTGCCC > NC_002947/5676406‑5676700 | tGGCGCTTGCGCCCCGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGCCCCGCCGAACATATTGGAGAAGAAcc > 5:15724/1‑149 (MQ=255) gcgcctgtggtaacgtccggtgcagcgcatgacctttgccggtgagcacacggatgcactgtacccgggctccatggaaggcgccctgggcagtggcctgcgtgcggccagccaggcacagtacctgttggccggcaagtcgttcgAc > 4:23895‑M1/147‑148 (MQ=255) gcgcctgtgggaacgtccggtgcagcgcatgacctttgccggtgagcacacggatgccctgtacccgggcaccctggaaggcgccctgcgcagtggccagcgtgcggccagccaggcacaggacctgttggccggcaagtcgttcga > 7:108065‑M1/147‑147 (MQ=255) cgcctgtgggaacgtccggtgcagcgcatgacctttgccggtgagcacacggatgccctgtacccgggcaccctggaaggcgccctgcgcagtggccagcgtgcggccagccaggcacaggacctgttggccggcaagtcgttcgAccc > 6:58160‑M1/146‑149 (MQ=255) gcTTGCGCCCCGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGACCCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGcc > 3:253455/1‑149 (MQ=255) gcTTGCGCCCCGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGcc > 8:214056/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCCCCGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGccc < 2:268843/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCCAAACAGGAGCTTGATGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTGGGTCTGCTTGGGCTCAGCGTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCGCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTg < 4:306244/148‑1 (MQ=255) cgcCCCGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTg < 6:15724/148‑1 (MQ=255) gcCCCGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCGTCTGCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTAGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGCCGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGct > 7:216735/1‑149 (MQ=255) gcCCCGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGct > 4:335237/1‑149 (MQ=255) ccccGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGctc < 2:43018/149‑1 (MQ=255) ccccGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGctc < 7:214056/149‑1 (MQ=255) ccccGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGctc > 7:22243/1‑149 (MQ=255) cccGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGctct > 3:355870/1‑149 (MQ=255) cccGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGctc > 4:140234/1‑148 (MQ=255) ccGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCtctc > 3:245395/1‑149 (MQ=255) cGCCAAACAGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTcc > 4:227203/1‑149 (MQ=255) 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aGGCGCTTGAAGAAGCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTggcggc > 2:327353/1‑149 (MQ=255) agaagCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCt < 1:180779/149‑1 (MQ=255) agaagCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCt > 2:285335/1‑149 (MQ=255) agaagCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTCGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCt > 3:347404/1‑149 (MQ=255) gaagCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGGCGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTg > 5:158467/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTgccg > 1:223559/1‑149 (MQ=255) gCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTgccgccgcc < 4:355870/149‑1 (MQ=255) gCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTgccgccgcc > 3:84718/1‑149 (MQ=255) gCTTGTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTgccgccgc < 1:162426/148‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTCGGCGGCGGCAGGTGCGgccgccgccaa < 4:245395/147‑3 (MQ=255) gCTTGGCCTCTTCGGTCTGCTTGGGCTCAGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCtt > 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tCTGCTTGGGCTCAGCTTTAGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCggg < 1:205343/149‑1 (MQ=255) ctggtggggCTCTGCTTTGCCGGGCGCGTTGTCAGGTTTGTCGCCCTGGTCGGCCGACCCGCCGAACATATTGGTCAAGAACCGGCCCTTGCGGTCCTTGCCGGCGGCCGCCGCTGCCGCGGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGt < 4:347404/143‑1 (MQ=255) ggcaccctggaaggcgccctgcgcagtggccagcgtgcggccagccaggcacaggacctgttggccggcaagtcgttcgACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTc > 5:105994‑M1/80‑149 (MQ=255) attGGGCTCCGCTTTGGCCGGCGCCTTGTCACCTTTGTCGCCCTTGCCGGACGAACCGCCGAACATATTGCAGAAGAACCCTCCCTTCCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTc < 8:308110/146‑1 (MQ=255) accctggaaggcgccctgcgcagtggccagcgtgcggccagccaggcacaggacctgttggccggcaagtcgttcgACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCgg > 8:166311‑M1/77‑143 (MQ=255) accctggaaggcgccctgcgcagtggccagcgtgcggccagccaggcacaggacctgttggccggcaagtcgttcgACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCgg < 7:166311‑M1/67‑1 (MQ=255) cccgggaaggcgccctgcgcagtggcccgcgtgcggccagccagccaccggacctgttggccggcaagtcgttcgACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAAc > 4:89454‑M1/76‑149 (MQ=255) cTTTGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCg > 8:42418/1‑149 (MQ=255) tttGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCgg < 4:84718/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCgg < 8:48843/147‑1 (MQ=255) ccGGCGCCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCaa > 1:310204/1‑148 (MQ=255) ggCGCCTTGTCTGCTTTGTCGCCATTGTCGGACGAACCGCCTAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCTGCCAACAg < 6:189479/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAgg < 7:114304/149‑1 (MQ=255) cTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAAc < 8:178331/127‑1 (MQ=255) cTTGTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAAc > 7:178331/1‑127 (MQ=255) gTCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACCAACCGCCGAACATATTGCAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCtg < 2:243075/147‑1 (MQ=255) gTCAGCTTTGTCGCCCTTGGCGGACGAACCGCCGAACATATTGCAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCtg < 2:248332/147‑1 (MQ=255) tCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCgg < 8:332353/116‑1 (MQ=255) tCAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCgg > 7:332353/1‑116 (MQ=255) cAGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGcc > 7:118169/1‑149 (MQ=255) aGCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCct > 8:19044/1‑149 (MQ=255) gCTTTGTCGCCCTTGTCGGACGAACCGCCGAACATATTGGAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCctg > 5:124527/1‑149 (MQ=255) 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ggAGAAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCACGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTc > 4:329243/1‑147 (MQ=255) gagaAGAACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCCCGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTCCAg > 8:292889/1‑149 (MQ=255) gacaagaaCCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCCCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCACGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTCCa < 8:216735/145‑1 (MQ=255) agaagaACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCACGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTCCAgg < 6:295575/149‑1 (MQ=255) agaagaACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCACGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTCCAgg < 2:223559/149‑1 (MQ=255) gaagaaCCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCACGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTCCAggg < 1:327353/149‑1 (MQ=255) gaagaaCCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCACGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTCCAggg > 5:30985/1‑149 (MQ=255) gaaCCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGt < 6:20003/95‑1 (MQ=255) gaaCCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGt > 5:20003/1‑95 (MQ=255) ACCCGCCCTTGCTCTCCTTGGCGGCGGCCGCACCTGCCGCCGCCGCAACCGGCAGCGCCTTGGCCGGGTCGAACGACTTGCCGGCCAACAGGTCCTGTGCCTGGCTGGCCGCACGCTGGCCACTGCGCAGGGCGCCTTCCAGGGTGccc > 8:118169‑M1/1‑149 (MQ=255) | 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |