New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GTCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTGGAGGT > NC_002947/6141309‑6141601 | gTCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGcatcg‑ccat < 6:110795/149‑1 (MQ=255) tCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGcatcg‑ccat‑‑c > 7:75327/1‑149 (MQ=255) cTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATcg‑ccat‑‑cgccat < 7:15050/149‑1 (MQ=255) ggTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTg > 2:94030/1‑149 (MQ=255) gtgtgtGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCAAGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTgg > 7:27352/1‑149 (MQ=255) gtgtgtGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGATCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTATCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCAtttg > 1:359443/1‑147 (MQ=255) gccgccTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAAt > 8:112087/1‑149 (MQ=255) cgccTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCAtt > 4:141334/1‑139 (MQ=255) cgccTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCAtt < 3:141334/139‑1 (MQ=255) gccTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGt > 7:272237/1‑149 (MQ=255) ccTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTc > 1:268256‑M2/1‑148 (MQ=255) cTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcgatgc < 3:105053‑M2/149‑7 (MQ=255) cTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcgatg > 8:75327‑M2/1‑143 (MQ=255) 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cAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCgg > 8:261497/1‑148 (MQ=255) cAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCgg < 7:261497/148‑1 (MQ=255) catcatGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGACCGCCTGTTATCCTGGGCAGGTGCGCCGTGGTGACGAGCACTGGCGGGTCa > 8:164481/1‑149 (MQ=255) tcatGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATg < 7:2299/149‑1 (MQ=255) catGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGa > 5:224135/1‑149 (MQ=255) atGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGa > 4:242073/1‑148 (MQ=255) tctGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGc < 6:45532/116‑1 (MQ=255) tctGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGc > 5:45532/1‑116 (MQ=255) tctGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATg > 2:246503/1‑149 (MQ=255) tGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATg < 1:246503/147‑1 (MQ=255) tGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCACGTTATCCTGTGCAGGTTCTGAGTGGTGCCGAGAACTGGCGGGTCATGACAGATgcg > 8:307640/1‑149 (MQ=255) gggCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATgcgg > 3:199909/1‑149 (MQ=255) ggcggcATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgc < 1:189077‑M2/148‑117 (MQ=255) cggcATCGaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgccac < 4:191952‑M1/149‑142 (MQ=255) cggcATCGaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgc < 5:202026‑M1/124‑117 (MQ=255) cggcATCGaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgc > 6:202026‑M1/1‑8 (MQ=255) cggcATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgccac > 6:120770‑M2/1‑30 (MQ=255) cggcATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgcca < 5:40356‑M2/148‑119 (MQ=255) gcATCGaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgccacag < 3:105053‑M1/149‑144 (MQ=255) catcg‑ccat‑‑cgcCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTgg < 8:319221/149‑1 (MQ=255) cATCGaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgccacag > 8:75327‑M1/1‑5 (MQ=255) atcg‑ccat‑‑cgccATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTGGa < 3:107818/149‑1 (MQ=255) gaccattgcgccaatggcgatggcgatgccgcccagagacatgatgttggcgttgatgccctggtgccgcatgatgatgagcgcgatcagtactcccaccggcaatgacacgattgcaaccagcgacgagcgcaggtgccacaggaagg > 1:268256‑M1/1‑1 (MQ=255) g‑ccat‑‑cgccatTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTGGAGGt < 1:153578/149‑1 (MQ=255) | GTCGCACTGGTGTGTGCCGCCTTCCTGTGGCACCTGCGCTCGTCGCTGGTTGCAATCGTGTCATTGCCGGTGGGAGTACTGATCGCGCTCATCATCATGCGGCACCAGGGCATCAACGCCAACATCATGTCTCTGGGCGGCATCG‑CCAT‑‑CGCCATTGGCGCAATGGTCGATGCCGCTGTGGTGATGATCGAGAACGCGCATAAACGGGTTGAAGCTTGGCACGCCCGTTATCCTGGGCAGGTTCTGCGTGGTGCCGAGCACTGGCGGGTCATGACAGATGCGGCGGTGGAGGT > NC_002947/6141309‑6141601 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |