New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 254395 = | 52 (0.860) | 5 (0.090) | 4/254 | NT | 10.2% | coding (722/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
? | NC_002947 | 254478 = | 38 (0.660) | coding (639/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
GTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGA > NC_002947/254331‑254623 | gTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGa > 2:336974/1‑149 (MQ=255) aaggtcacccttgtaggtgaccgcatgtacggtcgcggcaccgaggacgacaagaacggcatcGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGAt > 5:155973‑M1/64‑149 (MQ=255) aagctcacccttgtaggggaccgcatgtacggtcgcggcaccgaggacgacaagaacggcatcGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGAt > 4:133632‑M1/64‑149 (MQ=255) aaTCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCg > 7:152986/1‑149 (MQ=255) aTCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGt > 7:305985/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCt > 5:18697/1‑149 (MQ=255) gcgcTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCg < 1:251779/148‑1 (MQ=255) gcgcTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCg < 3:174476/148‑1 (MQ=255) cgcTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTCCTTGTCGTCCTCGGt > 5:106110/1‑149 (MQ=255) gcTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTg > 2:284386/1‑149 (MQ=255) cTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGc < 2:208438/149‑1 (MQ=255) gtagtaGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGAc < 1:336974/149‑1 (MQ=255) tGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTCCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCgg < 6:106110/149‑1 (MQ=255) cATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCa < 4:113470/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTAc < 7:113322/149‑1 (MQ=255) cTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGTGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCATCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAg < 5:122239/149‑1 (MQ=255) tttCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGt > 7:116317/1‑148 (MQ=255) ttcttcGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGa > 3:102422/1‑149 (MQ=255) ttcGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTc > 8:300580/1‑97 (MQ=255) ttcGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTc < 7:300580/97‑1 (MQ=255) ttcGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCt > 7:40449/1‑149 (MQ=255) atcgtggtggcgatgtacgcgctgaaagtggccaaggacgaaaacctgccgctcgcccggcagttcaagctgctgatcgacaccacGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCCCCTACAAGGGTGAGCtt > 4:133632‑M2/87‑149 (MQ=255) atcgtggtggcgatgtacgcgctgaaagtggccaaggacgaaaacctgccgctcgcccggcagttcaagctgctgatcgacaccacGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCtt > 5:155973‑M2/87‑149 (MQ=255) gtggtggcgatgtacgcgctgaaagtggccaaggacgaaaacctgccgctcgcccggcagttcaagctgctgatcgacaccacGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGaa > 6:148377‑M2/84‑149 (MQ=255) TGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTa > 1:73951‑M1/1‑132 (MQ=255) TGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTa < 2:73951‑M1/132‑1 (MQ=255) GTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCg > 4:274110‑M1/1‑120 (MQ=255) GTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCg < 3:274110‑M1/120‑1 (MQ=255) agcagcTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTGGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCTCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGGGACCGTACATGc < 1:219202/112‑1 (MQ=255) gcagcTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGgcgc < 1:284386/149‑1 (MQ=255) cagcTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGgc > 3:288771/1‑146 (MQ=255) cagcTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGgc < 4:288771/146‑1 (MQ=255) agcTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGt < 8:40449/149‑1 (MQ=255) gAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTAcc < 4:7712/147‑1 (MQ=255) ccGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCa < 7:153071/149‑1 (MQ=255) gggCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGAcc < 5:126732/88‑1 (MQ=255) gggCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGAcc > 6:126732/1‑88 (MQ=255) ccaaggacgaaaacctgccgctcgcccggcagttcaagctgctgatcgacaccacGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGc < 6:155973‑M2/94‑1 (MQ=255) ggCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTTCATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCt > 6:288944/1‑149 (MQ=255) gAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACATTGAACGGGTCCAGGCGCGTACAGTCGGCCAGCTTc > 4:213201/1‑148 (MQ=255) aGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCa < 4:5674/149‑1 (MQ=255) gCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCGAGtt < 6:122732/148‑1 (MQ=255) gCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGtt > 5:122732/1‑148 (MQ=255) ggTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTcc > 7:12218/1‑149 (MQ=255) gTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTAGa > 4:30629/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCg > 4:296963/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCg > 2:208608/1‑149 (MQ=255) ttcaagctgctgatcgacaccacGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTc < 5:148377‑M2/126‑1 (MQ=255) cAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCa < 8:116317/148‑1 (MQ=255) gTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTggg < 4:102422/149‑1 (MQ=255) aTCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGAACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATg < 6:18697/149‑1 (MQ=255) ccaccaCGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATg > 6:366232/1‑149 (MQ=255) cacGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGa > 3:137112‑M2/4‑149 (MQ=255) gATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCgg > 5:306152/1‑117 (MQ=255) gATGCCGCTCTTGGCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGGCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCgg < 6:306152/117‑1 (MQ=255) | GTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTGCCGGGCGAGCGGCAGGTTTTCGTCCTTGGCCACTTTCAGCGCGTACATCGCCACCACGATGCCGTTCTTGTCGTCCTCGGTGCCGCGACCGTACATGCGGTCACCTACAAGGGTGACCTTGAACGGGTCCAGGCGCGTACCGTCGGCCAGCTTCCAGTTGTCCGGGTTGACCGGCACGACGTCAGCGTGGGCATGGATGCCGA > NC_002947/254331‑254623 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |