New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 910210 = | 67 (1.110) | 5 (0.090) | 4/252 | NT | 7.3% | coding (718/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
? | NC_002947 | 910238 = | 64 (1.120) | coding (746/2853 nt) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
GTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAGCGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGC > NC_002947/910092‑910384 | gtggCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCtgt > 5:241661/1‑149 (MQ=255) acgacccgtgcgctgggccagtccgccggcacttcgccgcccagcacttccagcaccgcacggctgctggtggcttggtagagcacctgcccacggccttcgatcagcacttcgcacaGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCtgt > 1:153047‑M1/119‑149 (MQ=255) gCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGc < 2:154978/148‑1 (MQ=255) cacaGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGaa < 6:77672/147‑1 (MQ=255) caGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGc < 7:67406/149‑1 (MQ=255) agcgagcgCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCt > 3:177497/1‑149 (MQ=255) gcgagcgCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTg < 8:345738/149‑1 (MQ=255) cgagcgCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCCGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGGCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGa < 6:370995/149‑1 (MQ=255) tCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGt > 4:225503/1‑148 (MQ=255) tCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGt < 3:225503/148‑1 (MQ=255) gTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTggg < 7:337721/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTgg < 8:249396/148‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGATCAGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGCACCTGCACGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGCCCGTggg > 5:46439/1‑148 (MQ=255) aGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAg > 7:168523/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCACTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAg > 8:166229/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGt < 8:118098/149‑1 (MQ=255) ttcgccgcccagcacttccagcaccgcacggctgctggtggcttggtagagcacctgcccacggccttcgatcagcacttcgcacaGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCtgt < 5:346098‑M1/31‑1 (MQ=255) ttcgccgcccagcacttccagcaccgcacggctgctggtggcttggtagagcacctgcccacggccttcgatcagcacttcgcacaGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCtgt > 6:346098‑M1/87‑117 (MQ=255) tggcctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTAc > 6:337265/1‑149 (MQ=255) 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ttCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGc > 8:276689/1‑149 (MQ=255) ttCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGc > 8:73049/1‑149 (MQ=255) catcaCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGaa > 2:350757/1‑109 (MQ=255) catcaCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGaa < 1:350757/109‑1 (MQ=255) cttccagcaccgcacggctgctggtggcttggtagagcacctgcccacggccttcgatcagcagttcgcacaGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCtg > 6:171442‑M1/73‑102 (MQ=255) atcaCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGccac > 4:189954/1‑149 (MQ=255) atcaCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGccac > 6:127234/1‑149 (MQ=255) ggtaacGCAGCGGCTGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGccac > 1:135804/6‑147 (MQ=255) aCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACcag > 6:1629/1‑149 (MQ=255) gcagcaGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGccacca < 2:225886/143‑1 (MQ=255) gcagcaGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGccacca > 1:225886/1‑143 (MQ=255) ccGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGt > 5:141530/1‑149 (MQ=255) cGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTg < 4:117864/149‑1 (MQ=255) gCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGc > 3:312533/1‑149 (MQ=255) ctttACCTCGACCAGCGGCTAAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGTGGCTGCTCACGATTCCCTGCTCGAGGTTATTTGCGAAGTGCTGATCTAAGGTGGTGGGCATGTGGTCTATCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTg < 4:251993/145‑1 (MQ=255) cGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTgg > 2:230228/1‑148 (MQ=255) 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tCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTgg > 1:174601/1‑149 (MQ=255) tGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGGTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGcc > 4:198553/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGccc < 6:249666/148‑1 (MQ=255) gCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAgcg > 7:266101/1‑148 (MQ=255) cAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAGCGCAc > 8:219268/1‑149 (MQ=255) 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6:217671/132‑1 (MQ=255) tCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAGCGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTg > 5:293303/1‑149 (MQ=255) cGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAGCGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTg > 8:340766/1‑148 (MQ=255) gcggcTGTGCGAAGTGATGATCGAAGGCCCTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAGCGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATg > 4:334112‑M2/6‑149 (MQ=255) cggcTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAGCGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCACgc < 8:266101‑M2/145‑1 (MQ=255) gcTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAGCGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATgcgc < 6:46439‑M2/147‑1 (MQ=255) | GTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTGCGGTGCTGGAAGTGCTGGGCGGCGAAGTGCCGGCGGACTGGCCCAGCGCACGGGTCGTGCTGGCCAATCCACATGGCTTGCATGCGC > NC_002947/910092‑910384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |