New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 942696 = | 81 (1.350) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.0% | coding (2926/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | 942743 = | 74 (1.280) | coding (2879/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
TGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAGTGGTACATCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCG > NC_002947/942597‑942889 | tGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGcatca < 7:99958/149‑1 (MQ=37) accgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgctgatggcaccaccctcaccggtaccgcgccggctggcagccgtgtggaagtgcatgaTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGcatcat > 1:247556‑M1/96‑146 (MQ=255) accgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatgctgatggcaccaccctcaccggtaccgcgccggctggcagccgtgtggaagtgcatgaTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGcatcat < 2:247556‑M1/51‑1 (MQ=255) cGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTcc < 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gAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGCTGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGc > 5:385673/1‑148 (MQ=255) gAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTc < 7:272817/137‑1 (MQ=40) gAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTc > 8:272817/1‑137 (MQ=40) gAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGc > 5:77322/1‑148 (MQ=39) aaaCGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCa < 7:61838/149‑1 (MQ=39) gccgccGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCcac > 5:98324/1‑135 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cGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCATCCGGCGCGGTACCGTTGAGGGTGGTGCCATCAGCATCGATg < 6:77322/149‑1 (MQ=255) ttGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGggtggt < 8:312189/131‑1 (MQ=37) ttGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGggtggt > 7:312189/1‑131 (MQ=37) gCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGCATCGATGGCCa < 5:54505/148‑1 (MQ=37) ttGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGCATCGATGGCCAGAt > 1:353099/1‑149 (MQ=37) cGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGc > 5:204769/1‑77 (MQ=39) 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caacgccgatggcaTCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAGTGGTACATCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTg < 1:225352‑M2/135‑1 (MQ=255) cGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGGGCCATCAGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAGTGGTACATCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGc < 7:165798/149‑1 (MQ=38) tGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAGTGGTACATCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCg > 5:143669/1‑149 (MQ=39) cGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAGTGGTACATCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCtt < 7:134888/149‑1 (MQ=39) cGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAGTGGTACATCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCtt < 6:143669/149‑1 (MQ=39) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |