New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 957462 | 70 (1.160) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 5.8% | coding (782/1128 nt) | PP_0818 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 957520 | 63 (1.110) | coding (840/1128 nt) | PP_0818 | hypothetical protein |
CTGCGTGATCCCTTCGGTCGCCAAAGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCAGTAAGTCCTACACGGTAC > NC_002947/957373‑957662 | cTGCGTGATCCCTTCGGTCGCCAAAGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTg < 5:304822‑M2/149‑2 (MQ=255) ccTTCGGTCGCCAAAGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGttt < 1:8636/148‑1 (MQ=255) cTTCGGTCGCCAAAGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGc < 6:235757/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTCGCCAAAGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGc < 6:345417/149‑1 (MQ=255) ccAAAGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGc > 1:2004/1‑149 (MQ=255) cAAAGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCt > 1:63425/1‑149 (MQ=255) aGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTggg < 1:367163/149‑1 (MQ=255) aGAAACACGGATACGCGGTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTggg < 3:236916/149‑1 (MQ=255) gAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTgggg > 5:150789/1‑149 (MQ=255) acacGGATACGCGTTTACCAGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGt > 3:196876/1‑149 (MQ=255) cGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTg > 2:354607/1‑147 (MQ=255) ggATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAg > 1:342608/1‑149 (MQ=255) gcgTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGa > 5:69062/1‑148 (MQ=255) aCCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGt > 4:142435/1‑149 (MQ=255) ccGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCt > 7:88342/1‑149 (MQ=255) ccGATGCAGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCt > 5:109942/1‑149 (MQ=255) gATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTg‑‑g > 1:181328/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑Gc < 6:69062/149‑1 (MQ=255) tGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑Gcc > 1:75617/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCt > 7:352552/1‑149 (MQ=255) ccGGGCCGCCATGCCCCGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCtt < 1:128113/149‑1 (MQ=255) cGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCtt > 1:184949/1‑148 (MQ=255) gccgccATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGagc < 4:196876/149‑1 (MQ=255) cgccATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGagcag < 2:63425/149‑1 (MQ=255) cgccATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGagcag < 5:369879/149‑1 (MQ=255) ccATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGTGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCTGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGagcagca < 1:154310/149‑1 (MQ=255) ccATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGagcag > 4:314073/1‑147 (MQ=255) aTGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGagcagcagc > 1:334197/1‑149 (MQ=255) gCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGagcagcagc > 6:96347/1‑147 (MQ=255) cACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGCACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGt > 5:184382/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAg > 8:251798/1‑114 (MQ=255) aCGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAg < 7:251798/114‑1 (MQ=255) cGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTtg < 3:142435/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTtgat < 8:140081/149‑1 (MQ=255) gtggGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTtgatga < 8:88342/148‑1 (MQ=255) gtggGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGaa < 5:96347/149‑1 (MQ=255) cAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTgccgaggcgttgcccaccagcgtggcatggcggcccggcatcgggtaaacgcgtatccgtgtttctttggcgaccgaag < 4:34563‑M2/149‑80 (MQ=255) cAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTg > 7:218654/1‑106 (MQ=255) cAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTg < 8:218654/106‑1 (MQ=255) cAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATc < 4:275770/149‑1 (MQ=255) aaCGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTgccgaggcgttgcccaccagcgtggcatggcggcccggcatcgggtaaacgcgtatccgtgtttctttggcgaccgaagg < 6:143851‑M2/149‑81 (MQ=255) ccTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAg < 6:304822/149‑1 (MQ=255) cTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTgccgaggcgttgcccaccagcgtggcatggcggcccggcatcgggtaaacgcgtatccgtgtttctttggcgaccgaagggatca < 5:58124‑M2/149‑86 (MQ=255) gCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCAt < 2:75617/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATggcctga < 6:150789/149‑5 (MQ=255) cgcAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGACCCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCGGGACAAACGTCTG‑‑GCGGTGCGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTg > 4:199275/1‑149 (MQ=255) gcAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGt < 1:149235/127‑1 (MQ=255) gcAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGc < 2:2004/149‑1 (MQ=255) aGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCg < 6:109942/149‑1 (MQ=255) ggCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTgccgaggcgttgcccaccagcgtggcatggcggcccggcatcgggtaaacgcgtatccgtgtttctttggcgaccgaagggatcacgcaggcaaaaccttt > 3:34563‑M2/1‑48 (MQ=255) ggCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGTAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGa < 1:354607/149‑1 (MQ=255) gATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTGCTGGGAGTAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGa > 1:307791/1‑148 (MQ=255) gCAAGGCGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCa < 8:67555/148‑1 (MQ=255) cAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGAGCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGt < 7:281037/149‑1 (MQ=255) tGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAg < 3:314073/149‑1 (MQ=255) gACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGGCa > 2:226285/1‑149 (MQ=255) aCCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCa < 8:62259/148‑1 (MQ=255) aCCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCAt < 2:169975/149‑1 (MQ=255) ccGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATg > 8:164101/1‑149 (MQ=255) aCCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCa < 2:184949/149‑1 (MQ=255) tGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTCCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGCGCAGCAGCCAGTTGATGCAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGAAACAGGCCATGCGCAGt > 2:160087/1‑148 (MQ=255) ggCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGtt > 2:255089/1‑88 (MQ=255) ggCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGtt < 1:255089/88‑1 (MQ=255) gCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCa < 6:181048/126‑1 (MQ=255) gCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCa > 5:181048/1‑126 (MQ=255) gCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCAGTAAGt > 4:23848/1‑149 (MQ=255) tGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGATCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCAGTAAGTcc > 1:239291/1‑149 (MQ=255) aTCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCAGTAAGTCCTa < 2:342608/149‑1 (MQ=255) aTCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCAGTAAGTCCTa > 3:370027/1‑149 (MQ=255) ttCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCAGTAAGTCCTACACg > 1:25777/1‑149 (MQ=255) ccACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCAGTAAGTCCTACACGGTAc > 5:30163/1‑149 (MQ=255) | CTGCGTGATCCCTTCGGTCGCCAAAGAAACACGGATACGCGTTTACCCGATGCCGGGCCGCCATGCCACGCTGGTGGGCAACGCCTCGGCTGATGGCGCAGGCGATGGCAAGGTGCTGACCGAACCTGGGCTGATCGTTCGCCACTTTGCCGAGGTTTGCCTGACCCGCTGGGGCGTGCAGCTGGACAAACGTCTG‑‑GCCTTGAGCAGCAGCCAGTTGATGAAGTATCACCAGGTCATGGCGGCTGCCGACAGGCAGTATCAGGCCATGCGCAGTAAGTCCTACACGGTAC > NC_002947/957373‑957662 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |