New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1125996 | 68 (1.130) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 6.4% | coding (551/1377 nt) | tdcG‑II | L‑serine dehydratase |
? | NC_002947 | = 1126038 | 53 (0.920) | coding (509/1377 nt) | tdcG‑II | L‑serine dehydratase |
TCACCTGCCAGATGCGCAGCAGCCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGCCGTTGGGGTGGTA > NC_002947/1125892‑1126183 | tCACCTGCCAGATGCGCAGCAGCCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAgc < 3:129594‑M2/149‑3 (MQ=255) ccAGATGCGCAGCAGCCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCgt‑gg > 1:367060/1‑149 (MQ=255) ccAGATGCGCAGCAGCCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCgt‑g < 3:86909/148‑1 (MQ=255) cAGATGCGCAGCAGCCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCgt‑ggt < 7:71083/149‑1 (MQ=255) cagcagCCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTcga > 6:178489/1‑149 (MQ=255) agcagcCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGGTATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTcga < 1:3836/149‑1 (MQ=255) agcCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGAGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGAt < 7:69853/149‑1 (MQ=255) cccggcccggGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAgcaccg < 1:143093‑M2/131‑7 (MQ=255) cccggcccggGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAgcaccg > 2:143093‑M2/1‑125 (MQ=255) cggcccggGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCgg < 7:191635/149‑1 (MQ=255) gcccggGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTc < 6:334991/149‑1 (MQ=255) ccggGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCAt > 2:142143/1‑149 (MQ=255) ccggGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACCCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCAt > 8:139429/1‑149 (MQ=255) gggTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATgg > 7:259184/1‑149 (MQ=255) tttCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCg < 7:281417/149‑1 (MQ=255) ttCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCgg > 8:272214/1‑149 (MQ=255) tGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATgatcggg > 1:132939/1‑141 (MQ=255) gCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGc > 7:67410/1‑149 (MQ=255) cTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGc < 7:272214/148‑1 (MQ=255) ttCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCCCCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGt > 8:261312/1‑149 (MQ=255) ggCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCtc < 6:141874/148‑1 (MQ=255) aggaggACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCTCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGAc > 2:96380/1‑148 (MQ=255) gACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGTCGGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGa < 1:92571/149‑1 (MQ=255) cTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAac < 4:129594/149‑1 (MQ=255) tCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAac > 1:203141/1‑148 (MQ=255) aTTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAaccac > 1:184732/1‑149 (MQ=255) aTTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAaccac > 4:143838/1‑149 (MQ=255) aTTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAacca < 1:74063/148‑1 (MQ=255) tgcTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTa < 1:257995/147‑1 (MQ=255) ccTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTaa > 2:334614/1‑149 (MQ=255) cTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCtcgt < 2:190074/119‑1 (MQ=255) cTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCtcgt > 1:190074/1‑119 (MQ=255) cTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGAAGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTc > 1:83522/1‑149 (MQ=255) tCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACTAAACCACCGCCTACCGAGTAATACtag > 4:29558/1‑147 (MQ=255) tCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCCCCGCCTACCGAGTAATACTcg > 6:16829/1‑149 (MQ=255) tCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTcg > 5:337562/1‑149 (MQ=255) ccGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCgg > 1:64269/1‑149 (MQ=255) aGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCg > 7:183915/1‑149 (MQ=255) ggTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCgg < 6:367170/149‑1 (MQ=255) tCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGAt > 7:174167/1‑149 (MQ=255) aTGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAgcaccgcgcatgacctgtcggtgagccaggtgatgctggccaatgagtccgcctggcgcccagaagcagaaacccgggccgggctgc < 5:172024‑M2/140‑88 (MQ=255) aTGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAgcaccgcgcatgacctgtcggtgagccaggtgatgctggccaatgagtccgcctggcgcccagaagcagaaacccgggccgggctgc > 6:172024‑M2/1‑53 (MQ=255) cgcgGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGc < 2:184732/148‑1 (MQ=255) tGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAgcaccgcgcatgacctgtcggtgagccaggtgatgctggccaatgagtccgcctggcgcccagaagcagaaacccgggccgggctgctgcgcatctggcaggt < 8:222834‑M2/148‑104 (MQ=255) tGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGGGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGGAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGcgtc < 2:367060/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCCCCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGcgtcg > 5:283305/1‑149 (MQ=255) ccGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCgtcgtc < 3:149997/149‑1 (MQ=255) ccGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCgtcgtc < 6:337562/149‑1 (MQ=255) gaggagCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGtcgtcg > 2:13779/1‑148 (MQ=255) gaggagCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGtcgtcg > 2:19656/1‑148 (MQ=255) ggagCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCAGGAAACCATCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAAc < 1:96380/149‑1 (MQ=255) agCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCGAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAAcgc < 2:203141/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAAcgcg > 4:210877/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCgg < 5:178489/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCTGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCgg > 6:290656/1‑148 (MQ=255) gCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAgcaccgcgcatgacctgtcggtgagccaggtgatgctggccaatgagtccgcctggcgcccagaagcagaaacccgggccgggctgctgcgcatctggcaggtgatgcaagattgcgtcgcggcag > 7:222834‑M2/1‑22 (MQ=255) gTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCa > 4:269693/1‑73 (MQ=255) gTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCa < 3:269693/73‑1 (MQ=255) tCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATg < 3:143838/149‑1 (MQ=255) ttGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGcc > 6:47237/1‑149 (MQ=255) ttGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑CGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGAGGAAGATCATGcc > 7:53711/1‑149 (MQ=255) gAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGcc < 2:64269/147‑1 (MQ=255) g‑ATAGGCCAGCACCTT‑GGTGTCTTCGACGATGCTGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCCTCGACCACTAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGTATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGCCGTTgggg < 8:53711/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGCCGTTGGggtgg < 8:67410/148‑1 (MQ=255) gCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGCCGTTGGggtgg > 4:221701/1‑147 (MQ=255) gCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGCCGTTGGggtgg > 1:299939/1‑147 (MQ=255) gCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGCCGTTGGGGTGGTa < 2:132939/149‑1 (MQ=255) | TCACCTGCCAGATGCGCAGCAGCCCGGCCCGGGTTTCTGCTTCTGGGCGCCAGGCGGACTCATTGGCCAGCATCACCTGGCTCACCGACAGGTCATGCGCGGTGCAGTGGCCGAGGAGCGCCTTGGCGGTCTTGAACGG‑ATAGGCCAGCACCGT‑GGTGTCTTCGACGATGCGGTCATGGCCGGCAGCGTCCTCGTCGACCACGAAACCACCGCCTACCGAGTAATACTCGCGGCTTCGGATTTGCAGGCCTGCGTCGTCGAACGCGCGGAAGATCATGCCGTTGGGGTGGTA > NC_002947/1125892‑1126183 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |