New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1436037 | 68 (1.130) | 4 (0.070) +TCAGGCGACCC |
4/244 | NT | 8.7% | intergenic (‑74/+79) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
? | NC_002947 | 4583522 = | 24 (0.400) | intergenic (‑95/+76) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
CTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGG > NC_002947/4583374‑4583664 | cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAg < 2:75446/149‑1 (MQ=255) gTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGACGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGt < 1:218028/148‑1 (MQ=255) tACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTg > 7:345278/1‑148 (MQ=255) cacaGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATg > 4:370670/1‑149 (MQ=255) gggTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCg < 6:159967/149‑1 (MQ=255) gATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGc < 6:335993/148‑1 (MQ=255) gATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGc < 5:167106/148‑1 (MQ=255) gATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGc < 3:370670/148‑1 (MQ=255) gCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTc < 6:102692/149‑1 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTcgcg < 2:43654/148‑1 (MQ=255) cgatcagcaggttgcctgtgaggggcatgtagcctccttggaaatctaatgcagatgcatgggggggattacgacccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaatcaggcgacccGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCgcgggt > 7:145066‑M2/114‑146 (MQ=255) ccgttcggcatctggcgcatcgaaaaaccccgttaacaaggttcacacggtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGc > 6:199151‑M1/59‑148 (MQ=255) ccgtgcggcatctggcgcatctaaaaaccccgttaacaaggttcatactttgccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCg > 6:326870‑M1/59‑147 (MQ=255) caggttgcctgtgaggggcatgtagcctccttggaaatctaatgcagatgcatgggggggattacgacccctgtaggagcgggttcacccgcgaatcaggcgacccGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCgg > 4:14109‑M2/107‑139 (MQ=255) caggttgcctgtgaggggcatgtagcctccttggaaatctaatgcagatgcatgggggggattacgacccctgtaggagcgggttcacccgcgaatcaggcgacccGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCgg < 3:14109‑M2/33‑1 (MQ=255) cTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACACGCTcc > 3:74282/1‑149 (MQ=255) ttccggatctggggcatcgaaaaaacccggtaacaagtgtccctcggggccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCt > 6:326039‑M1/56‑149 (MQ=255) cggcatgtggcgcatcgaaaaagcccgttaaaaaggttcagtctgtgccccccCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCt > 8:15825‑M1/54‑148 (MQ=255) gCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACg > 8:48124/1‑149 (MQ=255) tgtgaggggcatgtagcctccttggaaatctaatgcagatgcatgggggggattacgacccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaatcaggcgacccGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACagg < 8:145066‑M2/52‑1 (MQ=255) gtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCTGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACgggggg > 3:267753/1‑149 (MQ=255) cGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACggggggggg > 3:25712/1‑149 (MQ=255) gACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCAt > 4:170199/1‑97 (MQ=255) gACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCAt < 3:170199/97‑1 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAg > 1:348662/1‑149 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTAGCGGATAAACCAGCTCCTACGGGGGGGGGGGcgac > 3:250781/1‑145 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATgg < 8:62312/89‑1 (MQ=255) aaTTGCATGAACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATgg > 7:62312/1‑89 (MQ=255) cGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGGCTGAACCTTGGTAACGGGCttt > 6:81619/1‑149 (MQ=255) gAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCCCACGGTGAACGGTTGTAAGGGGCtttt > 4:102557/1‑149 (MQ=37) tCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGGTTTTTGGATgcg > 1:52832/1‑149 (MQ=255) CC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAAACTTTTTAACCGGCGTTTTAGATgcgccaaaaga < 6:284183‑M1/149‑6 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACCTTCTAAACATTGTTAACGGGCTTTTACAATGCGCAAGATGCCGAACg < 4:261169‑M1/149‑1 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTACATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGACAGGCGGCAACATGTTAACGGGCGTTTTGGAGGCCCCAAGAGCCGAACg < 8:14446‑M1/149‑1 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAggg > 7:16927/1‑149 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGCACAGGATGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAAATGCCGAACGCAAGGTGCCAggg > 8:202958/1‑149 (MQ=38) cgGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCAtt < 8:16927/149‑1 (MQ=255) gTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACTGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTgg < 7:202958/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCCCCGGCTGAACCGTGTTAACGGGc > 5:262869/1‑88 (MQ=21) | CTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGG > NC_002947/4583374‑4583664 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |