New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1575567 = | 45 (0.750) | 3 (0.050) | 3/260 | NT | 5.5% | coding (914/1257 nt) | galP‑II | porin‑like protein |
? | NC_002947 | 1575613 = | 60 (1.020) | coding (868/1257 nt) | galP‑II | porin‑like protein |
GCGAAGTTGAAGTCATGGCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTCGCCCAGCGGCTGGCTGTGC > NC_002947/1575468‑1575761 | gCGAAGTTGAAGTCATGGCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGt > 3:90147/1‑148 (MQ=255) tcggcaaggaagatggcgccgaacgggccggcaagctggacaaccgcaccgcctccgccttgctttcggcgcgctaccaaggccacaccttttacgTTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTaaaa > 6:137477‑M1/97‑149 (MQ=255) aaGTTGAAGTCATGGCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTaaaa < 5:69437/149‑1 (MQ=255) aGTTGAAGTCATGGCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAg < 3:278159/149‑1 (MQ=255) gTTGAAGTCATGGCGAACCTGCCAGGAACGGTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAgg > 1:31197/1‑149 (MQ=255) gcaaggaagatggcgccgaacgggccggcaagctggacaaccgcaccgcctccgccttgctttcggcgcgctaccaaggccacaccttttacgTTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAAc < 8:126272‑M1/47‑1 (MQ=255) gcaaggaagatggcgccgaacgggccggcaagctggacaaccgcaccgcctccgccttgctttcggcgcgctaccaaggccacaccttttacgTTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAAc > 7:126272‑M1/94‑140 (MQ=255) gTCATGGCGCACCTGCCAGGAACGCTGCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTATCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCACCGTAAAAGGTGTGGc > 6:283543/1‑149 (MQ=255) tCATGGCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGcc > 3:165765/1‑149 (MQ=255) aTGGCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCtt < 6:115921/149‑1 (MQ=255) tGGCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTg < 5:97446/149‑1 (MQ=255) ggCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTGGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTgg > 4:63362/1‑149 (MQ=255) cGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTa < 6:373907/149‑1 (MQ=255) cTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAgcgcg > 3:128830/1‑149 (MQ=255) cGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCaa < 1:64222/149‑1 (MQ=255) tCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAaggc > 6:179896/1‑149 (MQ=255) aTTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAaggcggaggcgg > 4:593/1‑149 (MQ=255) tCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGgcggt‑gc < 3:177808/148‑1 (MQ=255) gAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGgcggt‑gcggt > 8:260586/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGgcggt‑gcgg < 3:189164/148‑1 (MQ=255) gAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAg > 4:305227/1‑149 (MQ=255) aTTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCGAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑t > 3:260810/1‑149 (MQ=255) tAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACACGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGcc > 5:131620/1‑149 (MQ=255) gCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCgg > 1:349219/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGtt > 2:240480/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGtt > 4:328780/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGgc < 4:90147/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCCTCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAACAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGgcg < 7:251166/149‑1 (MQ=255) cAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGgcgc > 8:171746/1‑149 (MQ=255) cAGGGAACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGCTGAGGCCTTGGTATCGCGCCGAAAGCAAGCCGGATGCTGT‑GCGGTTGTCAAGC‑TTGCCGGACCGTTCGgcg > 2:349459/1‑148 (MQ=255) gggTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGgc < 1:173337/145‑1 (MQ=255) gggTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGgc > 2:173337/1‑145 (MQ=255) ccTGGTGCCATTGACCCGCAGCCAGGCATCGGCGCCGCGGACCTTCTGCCGGCCACCGTAAACGGTGTGGCCGTGGTAGCGCGCCGCAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGc < 5:337886/148‑1 (MQ=255) tGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGcc > 2:246036/1‑148 (MQ=255) ttttacgttggcctgcagaaggtcagcggcgacgatgcctggatgcgggtcaaCGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGa > 6:137477‑M2/54‑149 (MQ=255) gTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGCATTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGa < 1:239015/149‑1 (MQ=255) gTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCg < 3:63362/147‑1 (MQ=255) gTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGGGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGAt < 4:128830/149‑1 (MQ=255) tGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGAt > 7:79623/1‑148 (MQ=255) cATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAg < 3:305227/149‑1 (MQ=255) cATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAg < 5:179896/149‑1 (MQ=255) gttggcctgcagaaggtcagcggcgacgatgcctggatgcgggtcaaCGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGc < 8:126272‑M2/93‑1 (MQ=255) gttggcctgcagaaggtcagcggcgacgatgcctggatgcgggtcaaCGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGc > 7:126272‑M2/48‑140 (MQ=255) GACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGc < 2:120157‑M1/149‑1 (MQ=255) ccGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGcc > 3:169249/1‑147 (MQ=255) ccGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGcc > 8:119742/1‑147 (MQ=255) ccGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGcc > 6:101011/1‑147 (MQ=255) ccGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGc < 3:173651/146‑1 (MQ=255) ccGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGc > 4:173651/1‑146 (MQ=255) gCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAgg > 4:272098/1‑149 (MQ=255) tcAGGCCTCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGGAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTgg < 1:358800/148‑1 (MQ=255) cAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGgc > 2:6657/1‑149 (MQ=255) aGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGccc < 8:200460/140‑1 (MQ=255) aGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGccc > 7:200460/1‑140 (MQ=255) aGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAg > 7:261621/1‑142 (MQ=255) aGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAg < 8:261621/142‑1 (MQ=255) aGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAACTAGCCCAGGTggg > 2:358800/1‑147 (MQ=255) gCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGcc > 7:342494/1‑149 (MQ=255) aTCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCa < 4:169249/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCa < 7:171746/149‑1 (MQ=255) gtcgCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCg > 2:164665/1‑149 (MQ=255) tcgCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGaa > 4:293879/1‑125 (MQ=255) tcgCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGaa < 3:293879/125‑1 (MQ=255) gccgcTGACCTTGTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCTGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCGATCTTCCTTGCCGATGATGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTc < 1:240480/148‑1 (MQ=255) cgcTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAg < 8:340281/149‑1 (MQ=255) cTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTc < 7:260586/149‑1 (MQ=255) gACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGGGGGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTCGc < 5:283543/149‑1 (MQ=255) ttCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGTGGGGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTCGcc > 1:298717/1‑147 (MQ=255) cAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTc < 4:166877/133‑1 (MQ=255) cAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTc > 3:166877/1‑133 (MQ=255) caaCGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTCGCCCAGCGgctggctg > 1:142052‑M2/4‑149 (MQ=255) aaCGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTCGCCCAGCGGCTGGCtgt > 2:194270‑M2/3‑149 (MQ=255) aaCGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTCGCCCAGCGGCTGGCtgt < 8:79623‑M2/147‑1 (MQ=255) cGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTCGCCCAGCGGCTGGCTGTGc < 5:137477/149‑1 (MQ=255) | GCGAAGTTGAAGTCATGGCGAACCTGCCAGGAACGCTCCTTGGCATTGTCGAAGCTTGAATTGTAGCTGTCGTTGGCCAGGGTACCGCCACTGGTGCCATTGACCCGCATCCAGGCATCGTCGCCGCTGACCTTCTGCAGGCCAACGTAAAAGGTGTGGCCTTGGTAGCGCGCCGAAAGCAAGGCGGAGGCGGT‑GCGGTTGTCCAGC‑TTGCCGGCCCGTTCGGCGCCATCTTCCTTGCCGATGAAGTAGCCCAGGTTGGCGCCCAGCGTCCAGTCGCCCAGCGGCTGGCTGTGC > NC_002947/1575468‑1575761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |