New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2354301 | 49 (0.810) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 5.6% | coding (231/1278 nt) | PP_2068 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein |
? | NC_002947 | = 2354349 | 54 (0.940) | coding (183/1278 nt) | PP_2068 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein |
GCCACCCAGTCGGCGCGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGC > NC_002947/2354203‑2354495 | gCCACCCAGTCGGCGCGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCgg > 6:209515‑M2/1‑147 (MQ=255) cACCCAGTCGGCGCGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGTCCGGTGCTGAACAAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCggcc > 1:357494‑M2/1‑145 (MQ=255) ccAGTCGGCGCGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCt < 5:283272/149‑1 (MQ=255) aGTCGGCGCGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGt > 8:181359/1‑149 (MQ=255) gcgcGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCTGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGt > 1:32290/1‑149 (MQ=255) gcgcGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGt > 3:150604/1‑149 (MQ=255) gcgcGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGGGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTATTCAGt < 3:83262/149‑1 (MQ=255) gcgGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCa < 4:54379/145‑1 (MQ=255) gcgGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCa > 3:54379/1‑145 (MQ=255) ggCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGt < 7:347844/148‑1 (MQ=255) tcgtcgGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAggg > 4:147214/1‑149 (MQ=255) gtcgGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCTCTGGTCAGTGTCGGAGGGTGAgtggt > 4:261028/1‑145 (MQ=255) gtcgGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGt < 1:137605/148‑1 (MQ=255) gtcgGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGt < 1:304109/148‑1 (MQ=255) tcgGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCGGCTGTTCAGGTTCGGCGGGTGAGGGttt > 8:150938/1‑149 (MQ=255) ggtggtTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGt < 2:32290/149‑1 (MQ=255) tCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACgg > 6:329130/1‑148 (MQ=255) ccAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAgg > 3:317633/1‑135 (MQ=255) ccAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAgg < 4:317633/135‑1 (MQ=255) aGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCaa > 1:39673/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCAtg < 7:181359/149‑1 (MQ=255) gAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTc > 3:112408/1‑148 (MQ=255) ccAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAggg > 5:112110/1‑114 (MQ=255) ccAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAggg < 6:112110/114‑1 (MQ=255) cAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAAtc > 3:73098/1‑149 (MQ=255) cAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGAGGCCAGGCTGCCGCTGGAGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAAtc > 7:234700/1‑149 (MQ=255) gCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGaa > 7:234052/1‑149 (MQ=255) gTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACTGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAAtt < 2:80844/147‑1 (MQ=255) gTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAAtt < 2:315253/147‑1 (MQ=255) gTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTgg > 3:56961/1‑149 (MQ=255) gTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTgg > 1:365414/1‑149 (MQ=255) gTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTgg < 3:147214/149‑1 (MQ=255) gTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTg < 2:106250/148‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGActg > 4:295341/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCctgct > 3:55141/1‑149 (MQ=255) cagcagGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGTGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGTCctgctg < 4:150604/149‑1 (MQ=255) cagcagGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCctgctg < 7:216033/149‑1 (MQ=255) gggTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGt < 7:157704/149‑1 (MQ=255) ggTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCggccgcaatcaccctgctggccttcaccagctactggttcagcaccggccgctatctggaaaccaccgacgatgcctatgtccgcgcc < 6:300171‑M2/149‑89 (MQ=255) ggTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTc > 1:38248/1‑149 (MQ=255) gTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCg < 2:39673/149‑1 (MQ=255) ttGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCggccgcaatcaccctgctggccttcaccagctactggttcagcaccggccgctatctggaaaccaccgacgatgcctatgtccgcgccgactg < 6:327418‑M2/149‑94 (MQ=255) cGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCggccgcaatcaccctgctggccttcaccagctactggttcagcaccggccgctatctggaaaccaccgacgatgcctatgtccgcgccgactggg > 5:327418‑M2/1‑53 (MQ=255) cGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTg‑g < 4:112408/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCAGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTg‑g > 8:6816/1‑147 (MQ=255) gCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCAc < 8:234052/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑Ga < 1:31850/143‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑Ga > 2:31850/1‑143 (MQ=255) cTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGAGGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGGTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAAGCTCGAATTGGGCCTGCTGGCGGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTg < 6:354968/149‑1 (MQ=255) tGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGc > 5:144426/1‑114 (MQ=255) tGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGc < 6:144426/114‑1 (MQ=255) tGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCt > 8:146120/1‑148 (MQ=255) tGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCt > 2:132838/1‑148 (MQ=255) tGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCt > 3:320562/1‑148 (MQ=255) ccAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTaa < 5:329130/148‑1 (MQ=255) gcgACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGTGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTTGTTTCCAATCTCGATTTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGgc < 8:234700/149‑1 (MQ=255) gcgACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGgc < 4:56961/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCgt > 8:83008/1‑149 (MQ=255) aGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGTGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAg < 4:73098/148‑1 (MQ=255) aGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGtt < 1:182742/99‑1 (MQ=255) aGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGtt > 2:182742/1‑99 (MQ=255) cTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCAACTGTATTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGc > 7:170480/1‑149 (MQ=255) tCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGGTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGGCTGCTGGCTGTCGGTTGAGAGTAGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCgg > 1:121139/1‑149 (MQ=255) | GCCACCCAGTCGGCGCGGACATAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCT‑GGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGACTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTG‑G‑‑GAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGC > NC_002947/2354203‑2354495 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |