| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2360074 = | 68 (1.130) | 7 (0.120) | 7/256 | NT | 9.9% | coding (1083/1134 nt) | PP_2075 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | 2360114 = | 62 (1.070) | coding (1043/1134 nt) | PP_2075 | membrane protein | |||||
TGGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGGCGGTG > NC_002947/2359967‑2360260 | tgGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGt < 2:262974/148‑1 (MQ=255) ggATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCACTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTg > 6:195699/1‑149 (MQ=255) aTTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGc < 7:248283/149‑1 (MQ=255) tGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGa < 7:22184/148‑1 (MQ=255) cATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGATTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAg > 1:89526/1‑147 (MQ=255) aTCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAg > 5:237840/1‑149 (MQ=255) aTCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAg < 7:83064/149‑1 (MQ=255) aTCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAg > 4:179293/1‑149 (MQ=255) tCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAgg > 5:42216/1‑149 (MQ=255) tcatccgcgaggccggcctgcccggcaagccagtcccacccgtgacaaccctgagcgactaccctcccgcaatccaggcacgcctgctcgccaaC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAg > 4:23182‑M1/95‑145 (MQ=255) tcatccgcgaggccggcctgcccggcaagccagtcccacccgtgacaaccctgagcgactaccctcccgcaatccaggcacgcctgctcgccaaC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAg < 3:23182‑M1/51‑1 (MQ=255) gcAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCt > 7:281893/1‑149 (MQ=255) cTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCg < 3:277549/149‑1 (MQ=255) ccGATGAAGTGCGACGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCCGCGGTCGGTGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggt > 8:221823/1‑149 (MQ=255) gATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCAGTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggtgg > 4:345333/1‑149 (MQ=255) aTGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTGTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCgggtggg < 8:26427/149‑1 (MQ=255) tGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTACCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGt > 2:358803/1‑125 (MQ=255) tGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTACCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGt < 1:358803/125‑1 (MQ=255) cgcCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGc < 5:147124/148‑1 (MQ=255) cgcCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTAGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGc < 2:44448/148‑1 (MQ=255) ccGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCa < 7:256490/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCAGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCa < 7:228093/149‑1 (MQ=255) cGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAg < 6:237840/149‑1 (MQ=255) gggTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAgg < 5:329633/149‑1 (MQ=255) aGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGt < 5:235024/148‑1 (MQ=255) aGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGt > 6:235024/1‑148 (MQ=255) ttGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCAc < 3:179293/149‑1 (MQ=255) ttGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCAc > 4:3099/1‑149 (MQ=255) tCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTg < 5:337225/149‑1 (MQ=255) aGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGTTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTgg < 1:34031/148‑1 (MQ=255) gTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGa > 7:40259/1‑149 (MQ=255) tCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGACCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGAc > 7:326422/1‑149 (MQ=255) cACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACt > 5:374951/1‑149 (MQ=255) cTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GTCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTgg < 1:155822/149‑1 (MQ=255) tttCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGc > 6:168160/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGc > 4:72324/1‑149 (MQ=255) tttCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTATTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCATGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGc > 4:275683/1‑149 (MQ=255) tCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCTTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGTGACTGGc < 5:195699/147‑1 (MQ=255) cGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCtt < 4:327226/148‑1 (MQ=255) ttGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGcc > 1:1364/1‑149 (MQ=255) gTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAgg > 5:264991/1‑149 (MQ=255) gaggagTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggccg > 2:24715/1‑149 (MQ=255) aggagTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCCTGCCCGGCAagcca < 8:40259/148‑2 (MQ=255) gagTAGAGCGCTTTCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGGTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggccggc < 8:288971/148‑1 (MQ=255) gagTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTCAGCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggccggc > 1:193670/1‑149 (MQ=255) gagTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggccggcc > 5:296610/1‑149 (MQ=255) gTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTc < 3:345333/149‑1 (MQ=255) gagCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTcgcg > 7:97482/1‑149 (MQ=39) ttGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGAc > 2:295902/1‑149 (MQ=34) cGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggcc > 4:291253/1‑131 (MQ=34) cGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggcc < 3:291253/131‑1 (MQ=34) ctgctcgccaacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccggcgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGa > 4:23182‑M2/52‑145 (MQ=255) ctgctcgccaacgccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccggcgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGa < 3:23182‑M2/94‑1 (MQ=255) tGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCg < 3:72324/149‑1 (MQ=34) tGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCg > 8:122904/1‑149 (MQ=34) tGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCg < 7:122904/149‑1 (MQ=34) ggTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCgg < 3:3099/149‑1 (MQ=34) gTTTTTTG‑GCCGGCCGTGTGCCGGGGTTGCGGGGCCCGCGGTCGGCGTGGGCGCGCCGGCGTGCCGGGATTGCGGGGGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCCCGGGGGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGc < 8:233868/149‑1 (MQ=11) gTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCGCGCGGATGACCTTCGGc > 7:233868/1‑149 (MQ=18) gTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGGCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGc < 4:264615/149‑1 (MQ=18) tC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAgcgc > 7:284618/1‑149 (MQ=32) C‑GCCGGCCGCTGGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAgcgc > 6:264991‑M1/1‑148 (MQ=255) gccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggtcggcgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGAGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCgg > 6:229328‑M2/40‑149 (MQ=255) ccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccggcgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggccggc > 7:292114‑M2/39‑121 (MQ=255) ccgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccggcgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGGCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAggccggc < 8:292114‑M2/83‑1 (MQ=255) cgaccgctggcagctcaagcccggcaagcggccggcgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTc > 1:345438‑M2/38‑149 (MQ=255) CGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTc > 1:295902‑M1/1‑149 (MQ=255) ccgctggcagctcaagcccggcaagcggtcggcgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGc > 1:199677‑M2/35‑148 (MQ=255) gtGCCGGGCGGGAGCTGCCAGCGGGCGGGGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCACcagca < 7:221823/148‑1 (MQ=11) gcGGTCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATAGGGGGTGGGTCTTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGTCTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcacag < 8:326422/148‑1 (MQ=11) gcGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTTGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGTTACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGTCCAGCGCTTTCTCcagctca < 8:281893/147‑1 (MQ=11) ccGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcacag < 6:42216/149‑1 (MQ=32) cGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcacag > 1:340306/1‑148 (MQ=32) cGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCcagcacag > 4:187699/1‑148 (MQ=32) gCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGc > 3:61358/1‑149 (MQ=32) ccAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGc < 5:168160/148‑1 (MQ=32) cGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTg < 3:275683/149‑1 (MQ=32) cGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTg < 2:199677/149‑1 (MQ=32) gccggcgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTggg < 2:345438‑M2/142‑1 (MQ=255) cgTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTGGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGGCGGTg > 2:141553‑M2/3‑149 (MQ=255) gTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCAcagcagc < 1:149509‑M2/126‑1 (MQ=255) | TGGATTTGCATCGTGCTGCAACTGGCTGCCGATGAAGTGCGCCGGGTGCAGTTGGATCAGTCACTTTCGTTGGCCTGTTGAGGAGTAGAGCGCTTGCGTGGTTTTTTC‑GCCGGCCGCTTGCCGGGCTTGAGCTGCCAGCGGTCGGCGTTGGCGAGCAGGCGTGCCTGGATTGCGGGTGGGTAGTCGCTCAGGGTTGTCACGGGTGGGACTGGCTTGCCGGGCAGGCCGGCCTCGCGGATGACCTTCGGCCAGCGCGGTCGCCAGCACAGCAGCAGGCTGAGCCAGTGGGCGGTG > NC_002947/2359967‑2360260 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |