New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5186784 = | 56 (0.930) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 5.4% | coding (121/876 nt) | PP_4566 | drug/metabolite transporter |
? | NC_002947 | 5186839 = | 50 (0.860) | coding (176/876 nt) | PP_4566 | drug/metabolite transporter |
CTGACCCTTGCCGCCGTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCCACCACCCCGTTGATGGGC > NC_002947/5186691‑5186978 | gcagcacctgggccgccaccgagtagaaggtggcggggatgccggagttgatcatgcccagcaccaggcacgcgccgagcttgccctggaagtTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGaa > 1:79058‑M1/94‑149 (MQ=255) aCCCTTGCCGGCGTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCTCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGACCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACtt < 3:49341/149‑1 (MQ=255) cctgggccgccaccgagtagaaggtggcggggatgccggagttgatcatgcccagcaccaggcacgcgccgagcttgccctggaagtTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCa > 2:287157‑M1/88‑149 (MQ=255) ttGCCGCCGTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAg > 5:127771/1‑149 (MQ=255) gccgccGTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAggg > 4:18404/1‑149 (MQ=255) gccgccGTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAgg < 2:162875/148‑1 (MQ=255) gccgccGTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCAAGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAgg < 2:168364/148‑1 (MQ=255) cgccgTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCCCTGGAAGTTCCAGCGCa < 6:169473/149‑1 (MQ=255) gTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCt > 4:247953/1‑149 (MQ=255) ggggAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGgc > 8:349330/1‑149 (MQ=255) gggAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGgcg > 2:64599/1‑149 (MQ=255) gggAGCGAGTTTCATGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGTGAACGTTTCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGCCCCCCGCCCGTGTCCGCTGGAACTTACAGGGCAAGCTCgtca > 8:320909/1‑146 (MQ=255) tttCCTGTTCCTGCGCATCATCGCCCCGGACCTGGGCACGGTGCCGACCGCGTGCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTgg < 5:365463/149‑1 (MQ=255) tttCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTgg > 8:209389/1‑149 (MQ=255) tGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTg > 6:76549/1‑149 (MQ=255) ttCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTgg < 5:47810/148‑1 (MQ=255) ttCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTgg < 1:64599/148‑1 (MQ=255) ttCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGCGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCTCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTgg < 4:199549/148‑1 (MQ=255) aTGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCAt > 5:149823/1‑149 (MQ=255) gcgcATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCCGATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCAt > 1:102452/1‑148 (MQ=255) cgcATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGAt < 7:125459/149‑1 (MQ=255) gcATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATc < 1:101307/149‑1 (MQ=255) gcATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTGCTTCCGGGGCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATc < 7:283458/149‑1 (MQ=255) gCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCT‑GGCATGATCAACTCCGGc < 6:127771/149‑1 (MQ=255) cGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGAGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATcc > 4:264388/1‑149 (MQ=255) aaCTGGGCACGGTGCCGACCGCGTGCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGGGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATcccc < 7:269827/149‑1 (MQ=255) cgggCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTgg < 2:90140/122‑1 (MQ=255) ggCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTCATCGTGATACAGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCAc > 7:307263/1‑149 (MQ=255) ccGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTTTTCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGTAACTTCCAGGGCAATCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTc < 8:230898/149‑1 (MQ=255) gACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCa > 5:199524/1‑137 (MQ=255) gACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCa < 6:199524/137‑1 (MQ=255) gTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTggcgg < 7:349330/149‑1 (MQ=255) ttcAGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTCGGCCTGATCGTGATACTCGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTAAGGCATCCCCGCCACCTACTACTCGGTGGCGGcc > 4:94270/1‑147 (MQ=255) ccGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAg < 3:247953/148‑1 (MQ=255) tggaagttccagcgcacacgggcggcggccagtatcacgatcaggcccagacaggcgatggaACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAgg > 2:287157‑M2/63‑149 (MQ=255) gggTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGtg > 8:186908/1‑149 (MQ=255) ttccagcgcacacgggcggcggccagtatcacgatcaggcccagacaggcgatggaACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGtgctgc > 1:79058‑M2/57‑149 (MQ=255) ccagcgcacacgggcggcggccagtatcacgatcaggcccagacaggcgatggaACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTgcc < 1:287157‑M2/94‑1 (MQ=255) gCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTgccggccg < 5:76549/148‑1 (MQ=255) gggCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCgg > 4:68200/1‑149 (MQ=255) ggCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTc < 2:102452/146‑1 (MQ=255) ggCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCgg < 3:68200/148‑1 (MQ=255) ccTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTAGTCGGCGa > 8:329908/1‑149 (MQ=255) tGATACTGGCCGCCGGCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAAc < 7:320909/149‑1 (MQ=255) tGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCaa < 7:252634/148‑1 (MQ=255) tGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCaa > 8:252634/1‑148 (MQ=255) tGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGAGCTTCAAc > 5:163845/1‑149 (MQ=255) aCTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGcc < 6:15454/88‑1 (MQ=255) aCTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGcc > 5:15454/1‑88 (MQ=255) gccgccgccCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGtgct > 1:66639/1‑113 (MQ=255) gccgccgccCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGtgct < 2:66639/113‑1 (MQ=255) gccgccgccCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCcaccac < 7:34687/149‑1 (MQ=255) gccgccgccCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCcaccac > 2:210985/1‑149 (MQ=255) ccgccgccCGTGCGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCCaccacc < 6:27612/149‑1 (MQ=255) cgccCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCCACCACCCCGt < 1:210985/149‑1 (MQ=255) cgccCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCCACCACCCCGt > 5:18984/1‑149 (MQ=255) tgCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCCACCACCCCGTTGATggg < 7:186908/148‑1 (MQ=255) gcTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCCACCACCCCGTTGATGGGc > 4:244182/1‑146 (MQ=255) gcTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCCACCACCCCGTTGATGGGc < 3:244182/146‑1 (MQ=255) | CTGACCCTTGCCGCCGTCTGGGGAGCGAGTTTCCTGTTCATGCGCATCATCGCCCCCGAACTGGGCACGGTGCCGACCGCGTTCTTCCGGGTCTCC‑ATCGCCTGTCTGGGCCTGATCGTGATACTGGCCGCCGCCCGTGTGCGCTGGAACTTCCAGGGCAAGCTCGGCGCGTGCCTGGTGCTGGGCATGATCAACTCCGGCATCCCCGCCACCTTCTACTCGGTGGCGGCCCAGGTGCTGCCGGCCGGCTATTCGGCGATCTTCAACGCCACCACCCCGTTGATGGGC > NC_002947/5186691‑5186978 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |