New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5594119 | 29 (0.480) | 5 (0.110) | 5/210 | NT | 15.4% | intergenic (‑66/+79) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
? | NC_002947 | = 5594156 | 32 (0.680) | intergenic (‑103/+42) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
GATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTA > NC_002947/5594009‑5594302 | gATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCt < 6:214056‑M2/149‑2 (MQ=255) tGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGtgcttgcccg > 2:77929/1‑146 (MQ=255) tGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttc < 8:247565‑M2/149‑4 (MQ=255) tGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttc < 8:252768‑M2/149‑4 (MQ=255) ggATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcg > 3:85033‑M2/1‑143 (MQ=255) ggATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcg > 7:247565‑M2/1‑143 (MQ=255) ggATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcg > 7:252768‑M2/1‑143 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttcctccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 8:336530‑M1/78‑149 (MQ=255) aggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCgg > 4:355137‑M1/78‑149 (MQ=255) ggcatgcgtgagcaggccgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCggg > 6:343034‑M1/77‑149 (MQ=255) ttGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggc > 5:214056‑M2/1‑140 (MQ=255) aTGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGTAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagc > 1:234533‑M2/1‑136 (MQ=255) tCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttagcgggcaagcccgc < 1:232543‑M2/149‑18 (MQ=255) ggAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagcccgctcc < 6:149547‑M2/149‑21 (MQ=255) ggAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagcccgctcc < 6:159542‑M2/149‑21 (MQ=255) gagagaACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTTCCCGCGAACACCGGCAAATCCGGTGCCATTCCCCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagcccgctcc < 7:54158‑M2/148‑21 (MQ=255) gagagaACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttagcgggcaaccccgctcc < 1:326043‑M2/148‑21 (MQ=255) cgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGc < 7:337672‑M1/78‑1 (MQ=255) cgagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGc > 8:337672‑M1/60‑137 (MQ=255) caaCTGGCTGGGTTAGGACTTGTCCAGGCCCGCAGGAGGGATGTTAAGGGGCTTACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACCCCGCCAAACCCGGTGCCATGCACCGACGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAg < 8:272028/148‑1 (MQ=18) gagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGcc > 4:322295‑M1/59‑137 (MQ=255) gagcggttccgccaggaaggcagccagctgtaccacaaagtctaaaccgcagcaccttACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGcc < 3:322295‑M1/79‑1 (MQ=255) ccgatcttgggggatgtCTGGGTCATGTCCGCCGGTGTTATTTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGAAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCtgcgcgggcaagcccgctcccacag > 2:12151‑M2/8‑123 (MQ=255) gggTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagcccgctcccccag < 1:12151‑M2/140‑26 (MQ=255) gggTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCCAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTGCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGtg < 3:318133/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGtg < 2:254654/148‑1 (MQ=255) aTGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTTCCCGCGAACAACCGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCGTGCTTAGCCGGCAACCCCGCTCCCC‑CAGGGTAATGTgcggcg > 1:153349/1‑149 (MQ=37) gtcatggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCCCGAACCCCCGCAAAACCGGTGCCATGCACCACAGTGCATGCTTAGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTTCAGCGGt > 4:134927/1‑149 (MQ=25) tcatggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGtt < 1:61833/149‑1 (MQ=255) catggtcatgGCCGCAGGAGTCATGTTACGGGGCATACACCACCCGGGGGCAGCTGGCTTGCCCGCGAACACCGCCAACGCCGGTGCCCTGCACCGCAGTGCTGGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGttt < 7:96407/149‑1 (MQ=25) tggtcatgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCCCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCC‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAg > 5:84178/1‑149 (MQ=255) atgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCCCCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGGGTAGACttt > 3:275737/1‑149 (MQ=255) atgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGGAAGGTGCTGCGGTTTAGCCtgt > 3:280530/1‑147 (MQ=255) atgTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACttt > 1:12170/1‑149 (MQ=255) cGCCGGAGGGATGTTAAGCGCCATCCACCACCCGGTGGGCGCGGGCTTCCCCGCGAACACCGGCAACCCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTgg < 2:48096/148‑1 (MQ=25) tgtaaggTGCCATACACCACCGTGTGGGAGCGGGCTTCCCGGCTAACACCGGCAAAGCGGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAgctggctg < 3:134927/143‑1 (MQ=37) ttAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGGCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGGCCTGCACCGCCGTGCTTGCGTCGCGGGGCAGCCCGCTCCCC‑CAGGGGAAGGTGGGGGGGGTTTGACGTTGTGGGACAgctggcgggc > 4:271454/1‑145 (MQ=21) aaGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCt < 5:149547/148‑1 (MQ=255) cgTGGCATCCCCCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGCCAAAGCCGGGGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCtt < 3:74289/147‑1 (MQ=37) cATACACCACCCTGGGGGAGCGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGc < 2:11531/149‑1 (MQ=255) aTACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttagccggcaagcccgctcccacagggtggtgtatgccacttaacatcacaccggcggacatgaccaagacaacacc < 4:356022‑M2/149‑78 (MQ=255) ACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGc > 2:12170‑M1/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGCTTGGCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGGGCCATGCCCCGCAGGGGTTGCTTCGCGGGGAAGCCCGGGCGCC‑CAGGGTGAGGTGGGGGGGTTTTGGCTTTGTGGTAGCGCTGGCGGCCTTCCTGGCGGCGCCGCTc > 6:81441/1‑149 (MQ=16) CTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCg > 5:159542‑M1/1‑149 (MQ=255) CTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCA‑CAGGGTAAGGTGGGGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGGTGGCGGCCTTACTGGCGGAACCGCTCg < 2:75834‑M1/149‑1 (MQ=255) GGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCt < 2:8041‑M1/149‑1 (MQ=255) CGGGCTTGCCCGCTAACACCGGCAAAGCGGGTGCCTTGCACCGCAGTGATTGCTTGTCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCtct > 2:326043‑M1/1‑148 (MQ=255) GGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACg < 3:51633‑M1/149‑1 (MQ=255) GCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGc > 8:260431‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagcccgctcccacagggtggtgtatgccacttaacatcactcctgcggacatgaccatgacatcacccagccagttctctcccgaccatccaa > 3:356022‑M2/1‑46 (MQ=255) gCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagcccgctcccacagggtggtgtatgccacttaacatcactcctgcggacatgaccatgacatcacccagccagttctctcccgaccatccaa < 6:117689‑M2/149‑104 (MQ=255) cccGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagcccgctcccacagggtggtgtatgccacttaacatcactcctgcggacatgaccatgacatcacccagccagttctctc > 6:47142‑M2/1‑45 (MQ=255) cccGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCttcgcgggcaagcccgctcccacagggtggtgtatgccacttaacatcactcctgcggacatgaccatgacatcacccagccagttctctc < 5:47142‑M2/136‑92 (MQ=255) ccGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCGGCGCCTGTTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactccct < 7:134574‑M2/147‑94 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCt < 2:50424‑M1/149‑1 (MQ=255) CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCtt < 5:27939‑M1/149‑1 (MQ=255) CGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCtt < 5:22509‑M1/149‑1 (MQ=255) acCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTgg > 2:148885/1‑111 (MQ=255) acCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTgg < 1:148885/111‑1 (MQ=255) cGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCC‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGGTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCGCCCGCATGCCTTGc > 5:331920/1‑142 (MQ=255) cAAAGCCGGTGCCATGCACCGCGGCGCCTGTTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaag > 8:134574‑M2/1‑41 (MQ=255) aaaGCCGGTGCCATGCACCGCGGCGCCTG‑TTCGCGGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgactcgctaacgaataatgaatccctaagaacgctataaagc < 8:120605‑M2/148‑110 (MQ=255) cGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCa > 7:287853/1‑149 (MQ=255) ggTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCAGCAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTg > 1:269972/1‑132 (MQ=255) ggTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTg < 2:269972/131‑1 (MQ=255) gCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGa > 2:31358/1‑133 (MQ=255) gCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGa < 1:31358/133‑1 (MQ=255) ccATGCACCGCGGCGCCTG‑TTCGCGGGCAcgcccgctcccacagactgattgccattaagcgggcctatcgctacagtgacggcccgttttttgttgcctcgctaacgaatcatgactcccttagaacgctatcaagcagatctgaaa > 7:120605‑M2/1‑29 (MQ=255) aTGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTc < 5:81441/149‑1 (MQ=255) tGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCCCGGCCTc > 5:371286/1‑148 (MQ=255) ccgTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCC‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTgg < 4:275737/147‑1 (MQ=255) cAGTGCTTGCTTCGCGGTCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGTTGCTGCGGGTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTgg < 4:280530/149‑1 (MQ=255) aGTGCTGGCTGCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGGGCTGCGGTTTAGACTTTGTTGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGc < 7:63527/149‑1 (MQ=255) gTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCa < 6:371286/149‑1 (MQ=255) tgcttgctTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAg < 4:51633/149‑1 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGc < 2:232543/148‑1 (MQ=255) cttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCg > 6:68699/1‑149 (MQ=255) ttgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCg > 8:184118/1‑148 (MQ=255) tgcttCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTa > 5:347831/1‑149 (MQ=255) | GATGGGGATTGGATGGTCGGGAGAGAACTGGCTGGGTGATGTCATGGTCATGTCCGCAGGAGTGATGTTAAGTGGCATACACCACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAAAGCCGGTGCCATGCACCGCAGTGCTTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA‑CAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTA > NC_002947/5594009‑5594302 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |