Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,274,413 | G→T | 9.6% | V124L (GTG→TTG) | glcD → | glycolate oxidase FAD‑linked subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,274,413 | 0 | G | T | 9.6% | 181.8 / 5.3 | 60 | V124L (GTG→TTG) | glcD | glycolate oxidase FAD‑linked subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/24); new base T (2/4); total (32/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.04e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCC > NC_002947/4274267‑4274551 | gCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGt < 5:237629/148‑1 (MQ=255) gCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGt < 2:271541/148‑1 (MQ=255) ccaccaGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTg > 7:217583/1‑148 (MQ=255) accaGGGCGGCGTACCGGTGGGTGCGCGTGGCGCCGGGACCGGCCTGGCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCaa < 4:231266/149‑1 (MQ=255) accaGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGGTTGCac > 2:191066/1‑148 (MQ=255) ggggttccGGGGGTTGCGCGGGGGGCGGGTACCGGCCTGTCTGGGGGGGCCTCCCGCCGCTGCCTAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGc < 1:120912/143‑1 (MQ=255) cgTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTAc < 3:356201/149‑1 (MQ=255) cgTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑‑TACGCCCGGTTGCACGCGGGCGTaac < 7:343113/149‑3 (MQ=255) gTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGGTTGCACGCGGGCGTaac < 2:257563/149‑3 (MQ=255) gTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGGTTGCACGCGGGCGTaac < 1:191066/149‑3 (MQ=255) gTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAACGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGGTTGCACGCGGGCGTaac < 2:56005/149‑3 (MQ=255) gtggtTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCg < 7:302455/139‑1 (MQ=255) gtggtTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCg > 8:302455/1‑139 (MQ=255) tggtTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTg < 7:268931/149‑1 (MQ=255) gtTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGc < 6:154001/149‑1 (MQ=255) gcgTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCAtct > 5:68543/1‑149 (MQ=255) gTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTcc < 8:110758/149‑1 (MQ=255) ggCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCTTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCAcc > 6:33982/1‑149 (MQ=255) cTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCCACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCa > 4:272080/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCAGGTGCCCAAGGGCGAAGAGTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACCCACCCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCAccc > 1:116741/1‑149 (MQ=255) gtggtgC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCACGCGTGCAACAGGAAGTACGCAACCTCGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATg > 6:155226/1‑149 (MQ=255) c‑‑ccTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATgg > 5:190485/1‑139 (MQ=255) c‑‑ccTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATgg < 6:190485/139‑1 (MQ=255) gCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGcc > 6:376165/1‑106 (MQ=255) gCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGcc < 5:376165/106‑1 (MQ=255) gCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGAccc < 6:68543/149‑1 (MQ=255) cAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCa < 7:154408/118‑1 (MQ=255) cAAGGGCATCCTGATGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCa > 8:154408/1‑118 (MQ=255) aaGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTc > 8:200755/1‑149 (MQ=255) aGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTcc < 2:72735/149‑1 (MQ=255) gCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCg > 7:199116/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGc > 3:160684/1‑148 (MQ=255) aTCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGAGAAACCGGGCCTACGCAACCAGGCCATATACCAAGCCCCCCCACCCCATGGTATTGACAACGCACCCGAACCATccaacc > 1:303795/1‑144 (MQ=255) tCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCa > 2:200833/1‑148 (MQ=255) ctgctgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACACCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAAt > 6:95403/1‑149 (MQ=255) ctgGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAAtt < 4:160684/147‑1 (MQ=255) tGATGTCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGTCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGc < 5:155226/149‑1 (MQ=255) cgcgcTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATc > 5:242589/1‑149 (MQ=255) gcTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGt < 6:242589/149‑1 (MQ=255) gcTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGt < 1:200833/149‑1 (MQ=255) ttCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTgg > 5:360550/1‑149 (MQ=255) aaCCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCaa > 8:192921/1‑149 (MQ=255) aaCCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACACCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCaa < 5:95403/149‑1 (MQ=255) tATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCg > 3:88877/1‑149 (MQ=255) cTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCg > 1:106106/1‑148 (MQ=255) cTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCg < 4:88877/148‑1 (MQ=255) tCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGa > 1:246182/1‑148 (MQ=255) tCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGACCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGa > 6:119105/1‑148 (MQ=255) gTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGc > 4:308791/1‑149 (MQ=255) tCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGcc > 5:99648/1‑149 (MQ=255) a‑aCCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCgg > 2:220949/1‑149 (MQ=255) a‑aCCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCgg > 2:271180/1‑149 (MQ=255) cccGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGa < 3:336911/119‑1 (MQ=255) cccGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGa > 4:336911/1‑119 (MQ=255) cGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCAc < 3:60028/87‑1 (MQ=255) cGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCAc > 4:60028/1‑87 (MQ=255) gCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCg > 8:334852/1‑149 (MQ=255) g‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGc > 5:184232/1‑149 (MQ=255) g‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATCGTATGTACTACGCTCCCGCCCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGc < 2:116741/149‑1 (MQ=255) ttACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGcc < 6:360550/149‑1 (MQ=255) | GCCACCAGCGCGGCGTACCGGTGGTTGCGCGTGGCGCCGGTACCGGCCTGTCTGGTGGTGC‑‑CCTGCCGCTGGCCAAGGGCATCCTGCTGGTGATGGCGCGCTTCAACCGTATCCTCGAGGTCA‑ACCCGCAGGGGCG‑‑‑‑TTACGCCCGCGTGCAACCGGGCGTACGCAACCTGGCCATCTCCCAGGCCGCCGCACCCCATGGTATGTACTACGCACCCGACCCTTCCTCGCAAATTGCCTGCTCGATCGGTGGCAACGTCGCCGAAAACGCCGGTGGCGTGCACTGCC > NC_002947/4274267‑4274551 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |