| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,341,850 | C→T | 5.5% | I161I (ATC→ATT) ‡ | PP_3815 → | polyamine ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,341,850 | 0 | C | T | 5.5% | 218.7 / 2.1 | 72 | I161I (ATC→ATT) ‡ | PP_3815 | polyamine ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/32); new base T (2/2); total (38/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.49e-01 | |||||||||||
CCTGGTGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATCTGTGGCGC > NC_002947/4341703‑4341996 | ccTGGTGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCatcatc > 3:110273/1‑148 (MQ=255)ccTGGTGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCatcatc > 5:175410/1‑148 (MQ=255)ccTGGAGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCatcatc > 2:262398/1‑148 (MQ=255) tGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGcc > 6:152519/1‑149 (MQ=255) cccAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGccc < 8:2576/148‑1 (MQ=255) ccAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCGATGATGcccat < 8:5693/149‑3 (MQ=255) ccAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGAt > 6:37842/1‑143 (MQ=255) ccAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGAt < 5:37842/143‑1 (MQ=255) ccAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCg > 5:93899/1‑149 (MQ=255) cAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGc > 2:136426/1‑149 (MQ=255) aaGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCGATGATGcccatgg < 3:57180/149‑5 (MQ=255) aaGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCt < 1:262398/149‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCt > 6:59521/1‑149 (MQ=255) aaGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCt < 3:61445/149‑1 (MQ=255) aaGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCt < 5:152519/149‑1 (MQ=255) gggCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTg > 3:35251/1‑148 (MQ=255) cGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGca > 7:78127/1‑149 (MQ=255) gTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGcac < 5:61113/149‑1 (MQ=255) gctgctGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGGGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGt > 5:268310/1‑141 (MQ=255) gctgctGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGGGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGt < 6:268310/141‑1 (MQ=255) tgctgAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTc < 4:35251/149‑1 (MQ=255) ctgAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCAc > 4:304789/1‑149 (MQ=255) aaCATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCgg > 1:198558/1‑149 (MQ=255) ctgctgTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTaa < 8:24969/148‑1 (MQ=255) ctgctgTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAAt < 4:110273/149‑1 (MQ=255) gctgTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCg > 8:53277/1‑149 (MQ=255) tgTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGc < 3:30695/149‑1 (MQ=255) tCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCCCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCAt > 4:204894/1‑149 (MQ=255) aTGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAg < 6:175410/149‑1 (MQ=255) gACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTAca > 7:148754/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTAcatca > 4:4554/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTAcatcat > 4:124428/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTCGGGGCGTGATCAAAAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCCCCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTAcatcat > 1:265436/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGa < 5:59521/149‑1 (MQ=255) gctgGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATcc > 8:34058/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGt > 1:322416/1‑149 (MQ=255) gcgcgcACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGtt < 3:4554/149‑1 (MQ=255) gcACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATc < 1:136426/149‑1 (MQ=255) aCCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGt > 4:25401/1‑149 (MQ=255) aCCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGt > 2:287047/1‑149 (MQ=255) aCCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCAGCTGGATATGGTGCGCAACCTCACCGGCGTGGTAATGGGCATGAGGTACGTCAGGAGGCCGGTCATCGt > 8:311464/1‑149 (MQ=38) ccTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGtg < 3:124428/149‑1 (MQ=255) aCTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGtgctg > 1:277639/1‑149 (MQ=255) cTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGt > 5:159963/1‑137 (MQ=255) cTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGt < 6:159963/137‑1 (MQ=255) cTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGtgctgc < 2:198558/149‑1 (MQ=255) cTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGtgctgc > 4:30674/1‑149 (MQ=255) tCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTATATCATGATCCCGTTCATCGtgctgc > 8:353390/1‑148 (MQ=255) gCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTg < 3:304789/148‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATc < 8:191637/134‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATc > 7:191637/1‑134 (MQ=255) gTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAgg < 8:148754/148‑1 (MQ=255) tgctgctgcAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCg > 4:259883/1‑149 (MQ=255) ctgctgcAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGa < 7:34058/148‑1 (MQ=255) ctgcAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCAt < 2:277639/149‑1 (MQ=255) gcAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACACCCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTAcatc > 6:348468/1‑109 (MQ=255) gcAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTAcatc < 5:348468/109‑1 (MQ=255) c‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATc > 2:321088/1‑149 (MQ=255) c‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATc > 2:326304/1‑149 (MQ=255) gggCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCg < 7:53277/149‑1 (MQ=255) gCGAGATCAACAAGGCGTTGAACGCCATGGGCATCATCGATGCCCCCCTGCAAATCGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCACCTAAATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACAATGCACCCAAACGAc > 8:305971/1‑149 (MQ=255) acaaGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGGTGGAAATGGTGCACAACATCACCGGCGTGGTATTCGGCATGAGCTCCATCATGATCCCGTTCTTCGTGCTGCCACTGCAGGCGCCCATGCACGCCATCGACCCGATGTtg > 2:116678/1‑149 (MQ=255) acaaGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGt > 7:71191/1‑148 (MQ=255) caaGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGtgc > 8:105343/1‑149 (MQ=255) caaGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGtgc > 8:258319/1‑149 (MQ=255) aTGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTgcaggcag < 1:321088/148‑1 (MQ=255) aTGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTgcaggcag < 3:308742/148‑1 (MQ=255) aTGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTgcaggcag < 1:326304/148‑1 (MQ=255) gCCATGGGCATCATCGATGCCCAGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGtt < 7:311464/148‑1 (MQ=255) cagcggggCATCGATGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTc > 2:17774/6‑149 (MQ=255) aTGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGAt < 1:287047/149‑1 (MQ=255) aTGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACAACATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCCCGCCATCGCCCCGATGGTGCAGCAGGCACGTTCGAt > 6:185949/1‑149 (MQ=255) ggggCATCGATGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATc > 4:107911/2‑149 (MQ=255) gCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATCtgt < 3:204894/149‑1 (MQ=255) catcatCGATGCCCCGCTGGAAATCGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCGACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATCtgtg < 2:322416/149‑1 (MQ=255) catcGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATCTGTGgcg > 8:139334/1‑149 (MQ=255) atcGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTACGATCTGTGgcgc > 8:322667/1‑149 (MQ=255) | CCTGGTGCCCAAGGGCTGGGGCCGTTGGCTGCTGAACATCGTGCTGCTGTCGATGTGGACCAGCCTGCTGGCGCGCACCTACTCGTGGCTGGTGCTGCTGCAGAGCTC‑GGGCGTGATCAACAAGGCGTTGATGGCCATGGGCATCATCGATGCCCCGCTGGAAATGGTGCACAACCTCACCGGCGTGGTAATCGGCATGAGCTACATCATGATCCCGTTCATCGTGCTGCCACTGCAGGCGACCATGCACGCCATCGACCCGATGGTGCTGCAGGCAGGTTCGATCTGTGGCGC > NC_002947/4341703‑4341996 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |