| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,587,695 | G→T | 12.3% | R40R (CGC→CGA) ‡ | PP_4063 ← | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,587,695 | 0 | G | T | 12.3% | 208.1 / 15.1 | 73 | R40R (CGC→CGA) ‡ | PP_4063 | long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/35); new base T (4/5); total (33/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.43e-01 | |||||||||||
CCAGCTGCAAGATGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGGGTGTCCCTTCTTGTGGTTGTTTT > NC_002947/4587550‑4587839 | ccAGCTGCAAGATGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCgg < 4:24324/149‑1 (MQ=255) tGCAAGATGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGacac > 4:332076/1‑149 (MQ=255) tGCAAGATGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGaca > 7:30124/1‑148 (MQ=255) cAAGATGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGacac > 7:2993/1‑147 (MQ=255) aGATGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGTCCCGCCACCAgg < 7:163415/149‑1 (MQ=255) aGATGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAgg < 7:190442/149‑1 (MQ=255) gtGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGc < 3:330932/148‑1 (MQ=255) aTGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTCCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGc > 5:34285/1‑149 (MQ=255) accacTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCg < 5:288176/149‑1 (MQ=255) accacTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCg > 7:118758/1‑149 (MQ=255) accacTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCg > 2:292650/1‑149 (MQ=255) ccacTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGc > 2:67997/1‑149 (MQ=255) cacTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGTCCCGCCACCAGGGCCtgcgt < 5:36541/149‑5 (MQ=255) cTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCtgcgtta < 5:147184/149‑7 (MQ=255) cAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACa < 1:171838/149‑1 (MQ=255) gACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGcccc > 8:235068/1‑147 (MQ=255) ccAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACgg > 1:297198/1‑149 (MQ=255) ccAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACgg < 8:2993/149‑1 (MQ=255) gATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTgg > 1:340915/1‑149 (MQ=255) cAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCgg > 4:173048/1‑104 (MQ=255) cAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATc > 6:22552/1‑148 (MQ=255) cAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATc > 6:47300/1‑148 (MQ=255) cAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATc > 7:13761/1‑148 (MQ=255) cGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGc < 1:151206/149‑1 (MQ=255) ggTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGcc > 2:279519/1‑149 (MQ=255) gTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCt < 5:47300/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCt < 7:296/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTg > 6:260200/1‑135 (MQ=255) tCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGATGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTg < 5:260200/135‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGc > 1:171797/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGc < 2:297198/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGc < 1:292650/149‑1 (MQ=255) cGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGcc > 8:55616/1‑148 (MQ=255) tgtTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATg < 2:24260/149‑1 (MQ=255) aCGCGCAGTGCGATCAGGGGGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCGCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGATGGCCTGGCCGATGGTCTg < 4:32914/149‑1 (MQ=255) cGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTgg < 5:5013/149‑1 (MQ=255) cGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTgg < 2:22767/149‑1 (MQ=255) cccAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGt < 7:62646/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGt > 2:349091/1‑148 (MQ=255) tGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCa < 1:349091/149‑1 (MQ=255) gATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAgg < 3:332076/149‑1 (MQ=255) aTCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGCTCAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAgg > 1:56236/1‑149 (MQ=255) gggCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGggt‑cgg > 5:224364/1‑149 (MQ=255) gggAGCGGGCGTATATTTCGCCCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGGAGGCCCTGGGGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCAACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGggt‑cgg < 3:280898/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGggt‑cggtc < 5:22552/149‑1 (MQ=255) cgcgGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTcc < 3:63723/149‑1 (MQ=255) cgGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTg < 1:67997/149‑1 (MQ=255) gTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGCTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGAc < 2:56236/149‑1 (MQ=255) ttCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGTCCCGCCACCAggg < 8:84857/62‑1 (MQ=25) ttCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGTCCCGCCACCAggg > 7:84857/1‑62 (MQ=25) cGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGtat > 3:278599/1‑141 (MQ=255) cGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGtat < 4:278599/141‑1 (MQ=255) cGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCgg < 1:103237/148‑1 (MQ=255) ggC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTg < 4:102853/126‑1 (MQ=255) ggC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTg > 3:102853/1‑126 (MQ=255) ggC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGt < 2:171797/148‑1 (MQ=255) cAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGAc < 6:34285/149‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTg > 8:229291/1‑119 (MQ=255) tGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTg < 7:229291/119‑1 (MQ=255) ccgccAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATgg < 8:118758/149‑1 (MQ=255) tGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGAGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGGGTGTGCct > 7:23309/1‑149 (MQ=255) agcgaGGCCCTGGTGTCCCGCCACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACcgc > 7:66128/5‑113 (MQ=38) agcgaGGCCCTGGTGTCCCGCCACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACcgc < 8:66128/109‑1 (MQ=38) 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cccTGGTGTCCCGCCACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGGGTGTccc < 7:101601/137‑1 (MQ=255) cccTGGTGTCCCGCCACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGGGTGTccc > 8:101601/1‑137 (MQ=255) ccTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGGGTGTCCCTTCTTGTGgttgt > 2:214759/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCAAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGGgt > 3:107778/1‑131 (MQ=255) ccTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCAAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGGgt < 4:107778/131‑1 (MQ=255) gtggCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGtt > 7:6090/1‑116 (MQ=255) gtggCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGtt < 8:6090/116‑1 (MQ=255) gtggCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGCGTGTCCCTTCTTGTGGTTGtttt < 7:235068/148‑1 (MQ=255) | CCAGCTGCAAGATGCACCACTGGGCGCAGTTGGGCGACCAGATGCCAACACGGTCGCCGGTGTTCACGCCCAGTGCGATCAGGGCGCGGGCGTATATTTCGACCTGTTCGGC‑CAACTGCCGCCAGCTGTAACGCAGGCCCTGGTGGCGGGACACCAGGGCCTCGCTGTCGCAACAGCGGGCCACGGTGGCATCGAAGGCCTGGCCGATGGTCTGGGTCAGCAAGGGT‑CGGTCCTGGCGACCGCGGGTATAGCTCGGTTGACTCATGGGTGTCCCTTCTTGTGGTTGTTTT > NC_002947/4587550‑4587839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |