| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,821,673 | G→A | 6.0% | Q3173* (CAA→TAA) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,821,673 | 0 | G | A | 6.0% | 200.9 / 2.3 | 66 | Q3173* (CAA→TAA) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/33); new base A (2/2); total (31/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
CCAGCGGGAAGTCCGATGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAG > NC_002947/4821526‑4821821 | ccAGCGGGAAGTCCGATGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGc < 5:225551/149‑1 (MQ=255) cAGCGGGAAGTCCGATGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTg > 3:321553/1‑147 (MQ=255) aGCGGGAAGTCCGATGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCag < 4:17295/149‑1 (MQ=255) ggAAGTCCGATGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCa > 7:60535/1‑149 (MQ=255) gAAGTCCGATGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCAc > 8:92405/1‑149 (MQ=255) gAAGTCCGATGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCAAGGCAATGAGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGACCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTACAGAGCAc > 5:240654/1‑149 (MQ=255) aTGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATa > 5:80278/1‑148 (MQ=255) ggggGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAAGGGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATacac < 1:233441/149‑1 (MQ=255) gTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTg < 3:364295/149‑1 (MQ=255) gTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTg > 8:16678/1‑149 (MQ=255) aaGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGcc < 7:183892/149‑1 (MQ=255) aGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGcc < 4:222556/148‑1 (MQ=255) atCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAAc > 6:30133/1‑148 (MQ=255) tCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCa < 8:60535/149‑1 (MQ=255) ccAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGCGCACCGCCATACACCTGGCCATCTACGCTCAACCAGTTg > 7:130962/1‑149 (MQ=255) ccAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTg < 1:124572/149‑1 (MQ=255) ccAGGCAATCCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCATAACATATCCCTCAGCCAGACGAGCCAAGGTATACTGGTCGTATCCCTCGGAGCTCAA‑CCTCCAGCGCAGTTGCACAGCACATACAAAAACCAGCCCATAGACCCTCAAACAGt > 4:148788/1‑147 (MQ=255) cAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCCGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATac > 7:243894/1‑121 (MQ=255) cAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCCGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATac < 8:243894/121‑1 (MQ=255) aGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTggg > 2:29185/1‑149 (MQ=255) aaTGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAAc > 1:247400/1‑149 (MQ=255) aCCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATc < 7:92405/149‑1 (MQ=255) aCCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATc < 5:30133/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATc > 8:309430/1‑147 (MQ=255) aGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAg < 3:148788/149‑1 (MQ=255) aGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAg < 4:337864/149‑1 (MQ=255) aGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAg < 3:192267/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAgg > 6:141197/1‑149 (MQ=255) cagcagGTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGTCGCGGGATCGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTACAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCTACGGCGCATCGAGGTCAt < 6:240654/149‑1 (MQ=255) cagcagCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCAt > 2:301274/1‑149 (MQ=255) cagcTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATgcg > 1:323342/1‑149 (MQ=255) tGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATgcgc < 6:110669/143‑1 (MQ=255) tGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATgcgc > 5:110669/1‑143 (MQ=255) cGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGc < 6:80278/149‑1 (MQ=255) tAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGa < 4:149805/149‑1 (MQ=255) cccTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTACAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGCCATGCGCCAACCCGGCCGAgg > 7:237662/1‑148 (MQ=255) ccTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAg < 4:218734/146‑1 (MQ=255) ccTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGc > 3:218734/1‑148 (MQ=255) cTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAAc < 8:163579/100‑1 (MQ=255) cTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAAc > 7:163579/1‑100 (MQ=255) aGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTc > 6:233799/1‑147 (MQ=255) gCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAg < 1:301274/149‑1 (MQ=255) ccAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGGATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAgg < 6:219205/149‑1 (MQ=255) ccAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAgg < 7:309430/149‑1 (MQ=255) ccAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAgg > 3:17430/1‑149 (MQ=255) gcgcgATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGTGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTg > 2:272436/1‑148 (MQ=255) gcgATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGaa < 3:297273/149‑1 (MQ=255) cgATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAAc < 2:323342/149‑1 (MQ=255) aTGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAAc > 7:250201/1‑147 (MQ=255) tCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGcc < 6:164692/149‑1 (MQ=255) tCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGcc > 3:197397/1‑149 (MQ=255) gTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTg < 8:250201/148‑1 (MQ=255) gTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCg > 3:89190/1‑148 (MQ=255) tAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGaa > 1:207027/1‑149 (MQ=255) tAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATAGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGaa > 2:313292/1‑149 (MQ=255) cgcTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCa < 3:197597/138‑1 (MQ=255) cgcTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCa > 4:197597/1‑138 (MQ=255) cgcTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCAACGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAActg > 8:133869/1‑149 (MQ=255) gcTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAActgc > 5:383913/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCATAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAActgct < 3:285669/149‑1 (MQ=255) a‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTgg < 4:197397/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAActgc > 7:205466/1‑136 (MQ=255) ggTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAActgc < 8:205466/136‑1 (MQ=255) tCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGccc < 4:17430/149‑1 (MQ=255) cAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAg < 8:303177/149‑1 (MQ=255) cgcAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTa < 2:247400/149‑1 (MQ=255) aGTTACAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGCCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGtt < 8:237662/149‑1 (MQ=255) gCATAGCACCGCCATACTCCTGGCCATCGTCGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCTTGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGaa < 4:321553/148‑1 (MQ=255) gCATAGCACCGCCATACACCTGGCCAGCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAg < 8:130962/149‑1 (MQ=255) gCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAg > 3:168592/1‑149 (MQ=255) gCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAg > 1:340788/1‑149 (MQ=255) | CCAGCGGGAAGTCCGATGGGGTGAAGCTGCCATTGCCATCGGCCAGGCAATGCGCGACCAGCGCCAGCAGCTCCTGACGATAGCCCTCAGCCAGACGCGCGATGGTCTGCTGGTCGTAGCGCTCGGCGCTGAA‑GGTCCAGCGCAGTTGCAGAGCACCGCCATACACCTGGCCATCGACGCTCAACCAGTTGGGCAACGGCGCATCGAGGTCATGCGCCAACCCGGCCGAGGCCTCCAGGGGCTGGAACAAGGCCGCACTGTCGAACTGCTGGTCGAACTGGCCCAGGTAGTTGAAG > NC_002947/4821526‑4821821 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |