Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,241,709 | A→G | 8.3% | L55L (TTG→CTG) | hmgC ← | maleylacetoacetate isomerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,241,709 | 0 | A | G | 8.3% | 203.9 / 7.3 | 72 | L55L (TTG→CTG) | hmgC | maleylacetoacetate isomerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/33); new base G (2/4); total (35/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.53e-01 |
GCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTAATA > NC_002947/5241566‑5241856 | gCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCg > 4:96087/1‑149 (MQ=255) aaCCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCg‑g > 4:29955/1‑148 (MQ=255) aaTGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTAcgc > 5:62417/1‑149 (MQ=255) atgacgGCCGCCACCCCCCCAACCCTGG‑CCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCgg < 4:224567/149‑1 (MQ=255) tgatgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCGTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACAAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTAcgcg > 1:55473/1‑149 (MQ=255) gatgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGc < 4:263056/138‑1 (MQ=255) gatgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGc > 3:263056/1‑138 (MQ=255) ccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGc > 1:173001/1‑149 (MQ=255) ccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGc < 6:47825/149‑1 (MQ=255) ccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGc > 4:130997/1‑149 (MQ=255) ccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGc < 6:291407/149‑1 (MQ=255) ccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGc < 3:271638/149‑1 (MQ=255) cgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCg > 6:187190/1‑149 (MQ=255) gccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCgg > 1:366546/1‑149 (MQ=255) ccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGCgca < 1:150709/149‑3 (MQ=255) ccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGCgca < 2:173001/149‑3 (MQ=255) cACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGt < 2:268718/149‑1 (MQ=255) cACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGt > 2:93934/1‑149 (MQ=255) aCCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGCgcacc < 3:34764/149‑5 (MQ=255) ccccccGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTg < 6:88083/149‑1 (MQ=255) ccGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACgg < 5:187190/149‑1 (MQ=255) ccGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCAGCGACTGCCCCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGACG‑GTACGCCGCCCTGCGGGTTGACgg > 8:142485/1‑149 (MQ=255) gAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCt < 3:130997/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAg > 6:77258/1‑149 (MQ=255) cGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTc > 2:232708/1‑149 (MQ=255) c‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCAc > 2:287436/1‑149 (MQ=255) cggcggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAG‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgc > 2:90122/1‑149 (MQ=255) ggcggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgct < 2:366546/149‑1 (MQ=255) gcggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgctg < 1:248202/149‑1 (MQ=255) gTGGCCGGCAGCAACGCGGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTc < 5:68110/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCa > 1:216389/1‑149 (MQ=255) gCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCAc < 5:327970/148‑1 (MQ=255) gCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCAc < 5:77258/148‑1 (MQ=255) ccGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCg > 6:329083/1‑111 (MQ=255) ccGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCg < 5:329083/111‑1 (MQ=255) ccGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCAccc > 5:54161/1‑149 (MQ=255) cagcaACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTgca < 7:155087/149‑1 (MQ=255) aaCGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGcagcag > 5:156270/1‑149 (MQ=255) aaCGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGcagcag > 4:63465/1‑149 (MQ=255) aGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGa > 7:344352/1‑149 (MQ=255) ggCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGAc < 2:55473/149‑1 (MQ=255) tgtgGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCgg > 4:119089/1‑149 (MQ=255) aaCCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGAc < 3:29955/148‑1 (MQ=255) aaCCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGAc < 2:216389/148‑1 (MQ=255) aCCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTg > 7:336332/1‑149 (MQ=255) aCCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTg < 1:93934/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTgg < 1:232708/149‑1 (MQ=255) ccAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagc > 3:177979/1‑148 (MQ=255) ccAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagc > 6:343167/1‑148 (MQ=255) ccAGGTACTCGATGATCGCCAGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGTTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTaa < 7:142485/146‑1 (MQ=255) aCTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGcccc > 3:28406/1‑149 (MQ=255) cGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGCCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGAACGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCtt > 7:100638/1‑148 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCtt > 7:300099/1‑147 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTc < 5:219053/148‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCa < 3:63465/149‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGCTAGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCtt > 8:109615/1‑147 (MQ=255) atgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACTCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCtt > 1:50507/1‑147 (MQ=255) tgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGt < 8:336332/149‑1 (MQ=255) tgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGt < 3:96087/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGCGACTGCACCAACACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCa > 4:303494/1‑144 (MQ=255) tCGCCGGCGACTGCACCAACACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCa < 3:303494/144‑1 (MQ=255) cGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAggg < 5:343167/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCAcc < 6:54161/149‑1 (MQ=255) gCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCgg < 1:287436/149‑1 (MQ=255) gCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCGTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCgg < 1:201730/149‑1 (MQ=255) cACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGt < 3:119089/149‑1 (MQ=255) accac‑cGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGa < 8:100638/147‑1 (MQ=255) accac‑cGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGAc > 3:96718/1‑148 (MQ=255) cac‑cGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAg < 6:62417/149‑1 (MQ=255) cccgcAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACgg > 4:36836/3‑149 (MQ=255) gcAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTaa > 5:174231/1‑149 (MQ=255) gcAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTaa > 3:69600/1‑149 (MQ=255) aaGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTaa > 5:82900/1‑147 (MQ=255) aaGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTAATa < 1:90122/149‑1 (MQ=255) | GCAACCAATGATGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCC‑TCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCAC‑CGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCTGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTAATA > NC_002947/5241566‑5241856 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |