Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,244,133 | T→A | 6.3% | M117L (ATG→TTG) | hmgA ← | homogentisate 1,2‑dioxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,244,133 | 0 | T | A | 6.3% | 212.4 / 3.0 | 74 | M117L (ATG→TTG) | hmgA | homogentisate 1,2‑dioxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/33); new base A (2/3); total (38/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.70e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.23e-01 |
GCTCGGTGGCGATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGC > NC_002947/5243986‑5244279 | gCTCGGTGGCGATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATg > 6:47751/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGc < 5:47751/148‑1 (MQ=255) cGATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCTGCCCATGGCTGCCaa < 3:24538/149‑1 (MQ=255) cGATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCTGCCCATGGCTGCCaa < 4:144368/149‑1 (MQ=255) gATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAAc > 8:26149/1‑149 (MQ=255) gATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAAc > 2:326719/1‑149 (MQ=255) gATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAAc > 6:372506/1‑149 (MQ=255) tACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCt > 8:52290/1‑149 (MQ=255) aCGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCtt < 7:282436/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGa < 1:207958/149‑1 (MQ=255) aGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAATAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGAt < 7:150592/149‑1 (MQ=255) aGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGAt < 6:269930/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCATGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAAtcg > 4:280685/1‑149 (MQ=255) gTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAAtcggtc > 1:325542/1‑149 (MQ=255) ccGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAAtcggtcgg < 6:255495/148‑1 (MQ=255) gCACCAGTATCAGCTCACCGGATGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGTACCTGTTGGCGCTGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGGGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATTAAATCGGTCTGTTca < 4:182892/149‑1 (MQ=255) gTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAgg > 2:256485/1‑148 (MQ=255) gcagcTCACAGTCTGAGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACAGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCAAGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCAGGCGTTGGCATCAATGGGCAGCAAACCTTCGATTAAATCGGTCTGTTAAGCAGGaa > 1:177988/1‑147 (MQ=255) aCCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCg > 7:198859/1‑149 (MQ=255) atGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTc > 1:207037/2‑149 (MQ=255) gTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAgc > 2:102229/1‑149 (MQ=255) agaaCACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAg < 6:312555/148‑1 (MQ=255) gaaCACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCATGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGc < 3:280685/149‑1 (MQ=255) gaaCACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGc > 3:91363/1‑149 (MQ=255) gaaCACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGc < 2:207037/149‑1 (MQ=255) aaCACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCg > 5:106981/1‑149 (MQ=255) cacCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGt > 1:138133/1‑149 (MQ=255) cccGTTCCATGGACCGGTTGGCGCTGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTg < 8:295533/149‑1 (MQ=255) cGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTggg > 2:354295/1‑149 (MQ=255) cGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTggg > 6:344210/1‑149 (MQ=255) gTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTgggg < 8:44124/149‑1 (MQ=255) cATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGa > 6:203875/1‑149 (MQ=255) aTGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGAt > 7:272494/1‑149 (MQ=255) aTGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGAt > 6:85417/1‑149 (MQ=255) aTGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGAt < 4:23969/149‑1 (MQ=255) aTGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGAt < 2:372545/149‑1 (MQ=255) ggACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGc > 8:152635/1‑149 (MQ=255) aCCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCa < 1:300151/149‑1 (MQ=255) cGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCAcc > 3:86443/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCa > 3:9567/1‑149 (MQ=255) ttGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCATGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTACAGCGCAGGCGGTTGTGGTTGATGCCACCCAg > 6:260355/1‑149 (MQ=255) gcgGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGcc > 6:247832/1‑149 (MQ=255) gtagatgtagatGCTCACGCCTGCCGGTTTTTCCGCGCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCccgc < 7:253803/149‑1 (MQ=255) gatgtagatgCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCccgcc > 4:73762/1‑147 (MQ=255) gatgCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCt > 7:272406/1‑149 (MQ=255) atgCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTGCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTg < 5:344210/149‑1 (MQ=255) gCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTgg < 7:52290/148‑1 (MQ=255) tCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCgg > 6:47514/1‑107 (MQ=255) tCACGACAGCCGGTTTTACCGCTCAGGCGTTGTAAGCCAAGGCCACCCAACCTACCATGAAAAAGGACGGTTCAGCACCAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCCGTTAGGGTTGATCACACCCATTGGCACGCCGCGCGGCTGgcgc > 8:122533/1‑149 (MQ=255) gcGCCAACCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGgcgcgc < 5:47009/148‑1 (MQ=255) aCGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGgcgcgc > 3:204767/1‑149 (MQ=255) aCGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGgcgcgc < 8:272494/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGgcgcgc > 5:250281/1‑148 (MQ=255) gCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGCTCAGCAGTAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCa < 5:52740/149‑1 (MQ=255) catgctgTTTTTCCGATCATGCGTTTGAATCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTAGGTTCAGAATGAAT‑CGTCTGCGGTCTCCATCTCAGGAGGTTGTGGTTGATGACACCCAGTGGCCCGCCGAGCTGCTTGCGCGCCAgg < 2:177988/143‑1 (MQ=255) gCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGgcg < 2:325542/149‑1 (MQ=255) cGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCt < 5:85417/149‑1 (MQ=255) cGGTTTTTCCGCGCCGGCGTTGGCAGCCCTGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTGCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCt < 6:288935/149‑1 (MQ=255) tttttCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCgg < 7:152635/149‑2 (MQ=255) tttCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGaa < 5:247832/148‑1 (MQ=255) tttCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGaa < 6:106981/148‑1 (MQ=255) cGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGgc > 4:358619/1‑132 (MQ=255) cGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGt < 8:272406/147‑1 (MQ=255) gCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGc > 5:310000/1‑147 (MQ=255) ggTTGGCTGCCCATGGCTGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCg > 6:154408/2‑134 (MQ=255) ggTTGGCTGCCCATGGCTGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCg < 5:154408/133‑1 (MQ=255) gTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAgg < 5:203875/149‑1 (MQ=255) gCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCGGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAg > 6:262544/1‑148 (MQ=255) gCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAg > 6:87970/1‑148 (MQ=255) cAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGaa < 7:26149/149‑1 (MQ=255) cAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGaa < 4:86443/149‑1 (MQ=255) gCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAgg < 1:326719/149‑1 (MQ=255) aTGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAATCCGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAACGGc > 1:265007/1‑149 (MQ=255) aTGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGc > 1:187852/1‑148 (MQ=255) | GCTCGGTGGCGATACGCAGGCGGCCCTGTTCCGGCACCAGTAGCAGCTCACCGTCTGCGTTGAAGAACACCCGTTCCATGGACCGGTTGGCGCGGTAGATGTAGATGCTCACGCCAGCCGGTTTTTCCGCTCCGGCGTTGGCAGCCATGGGCAGCCAACCTTCGATGAAATCGGTCGGTTCAGCAGGAAT‑CGGCTGCGGGCTCCAGCGCAGGCGGTTGGGGTTGATGCCACCCAGTGGCCCGCCGAGCGGCTGGCGCGCCAGGCGCTCGAAGCGTGGGTGCAAGGCAGAAGGGC > NC_002947/5243986‑5244279 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |