| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,293,713 | G→A | 12.3% | T225I (ACC→ATC) | mmsA‑II ← | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,293,713 | 0 | G | A | 12.3% | 168.2 / 12.6 | 65 | T225I (ACC→ATC) | mmsA‑II | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/26); new base A (4/4); total (35/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.49e-01 | |||||||||||
GTGCGGTTGGCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCC > NC_002947/5293566‑5293855 | gtgcgGTTGGCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTggtgggt < 7:306060/149‑1 (MQ=255) gTTGGCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGTTAACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGccat < 1:307130/149‑4 (MQ=255) ggCATCAGGCAGCACCACCTGGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGGTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATg < 5:120461/148‑1 (MQ=255) ggCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATg < 2:139752/148‑1 (MQ=255) gCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGccatttg > 3:243565/1‑142 (MQ=255) cATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCa > 3:253033/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGCGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCAt > 8:272236/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCAt < 3:258037/149‑1 (MQ=255) tCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATc < 8:72011/149‑1 (MQ=255) cAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATc > 8:274583/1‑148 (MQ=255) ggCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATccac < 4:253033/149‑1 (MQ=255) cagcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGCCATTTGCACccacca < 4:243565/149‑1 (MQ=255) gcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCGAGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGAGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCaccacc > 1:279242/1‑149 (MQ=255) caccacCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCt > 4:242393/1‑149 (MQ=255) accaccGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGCCATTTGCACccacca < 4:50694/145‑1 (MQ=255) accaccGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGCCATTTGCACccacca > 3:50694/1‑145 (MQ=255) tGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTgccgcc > 5:94497/1‑149 (MQ=255) cccccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACg < 7:272236/149‑1 (MQ=255) cccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGtt > 6:21831/1‑149 (MQ=255) ccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTc < 4:318918/149‑1 (MQ=255) tGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACgccggc > 5:168788/1‑149 (MQ=255) tGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACgccggc > 8:240707/1‑149 (MQ=255) tGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGAGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACgccggc > 4:326354/1‑149 (MQ=255) cacaCGCTTGCCATGCTGGCTGCCGATGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCGAATGGCATCCACCACCTGCTTgccgc < 2:35278/122‑1 (MQ=255) cacaCGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACgccggccg > 6:73795/1‑149 (MQ=255) cacGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGCCTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGGTCAGCACGccggccgg > 8:283297/1‑148 (MQ=255) cacGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGAGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGt < 2:279242/149‑1 (MQ=255) acGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTa > 1:26755/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACg > 8:43108/1‑149 (MQ=255) cATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAG‑CCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCtt > 5:87595/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATccac > 4:149563/1‑96 (MQ=255) aTGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATccac < 3:149563/96‑1 (MQ=255) tGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTc > 2:46584/1‑149 (MQ=255) ctggctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGCCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTc > 1:3233/1‑147 (MQ=255) ctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAgcgc < 5:73795/149‑1 (MQ=255) tGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACTACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGa > 5:335820/1‑147 (MQ=255) tGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACTACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGa < 6:335820/147‑1 (MQ=255) gTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCATATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGAc > 4:34454/1‑147 (MQ=255) gTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCTGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGcc > 6:99787/1‑126 (MQ=255) gTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCTGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGcc < 5:99787/126‑1 (MQ=255) gTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGAcc < 5:21831/148‑1 (MQ=255) gTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGAcc < 7:297854/148‑1 (MQ=255) aCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAG‑CCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGc < 6:87595/149‑1 (MQ=255) cGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACgcc < 8:329207/100‑1 (MQ=255) cGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACgcc > 7:329207/1‑100 (MQ=255) gACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACa < 7:274583/149‑1 (MQ=255) gACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACa < 7:240707/149‑1 (MQ=255) ttCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCg > 1:213672/1‑149 (MQ=255) cAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGccggccgg > 6:45215/1‑100 (MQ=255) cAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGccggccgg < 5:45215/100‑1 (MQ=255) gTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATc < 3:242393/149‑1 (MQ=255) gagCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCa > 8:342835/1‑130 (MQ=255) gagCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCa < 7:342835/130‑1 (MQ=255) gagCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTg < 2:26755/149‑1 (MQ=255) ccACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCg > 2:251232/1‑149 (MQ=255) gAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATg > 7:274731/1‑149 (MQ=255) gAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGttt > 6:374411/1‑149 (MQ=255) gAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGttt > 3:98392/1‑149 (MQ=255) aaTCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa < 1:46584/149‑1 (MQ=255) tCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGc < 6:168788/149‑1 (MQ=255) cTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACg > 3:102738/1‑148 (MQ=255) caggtggtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGgtgt > 6:58516/5‑149 (MQ=39) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGc < 2:3233/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGc > 5:242953/1‑149 (MQ=255) tggtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCg > 8:20209/1‑90 (MQ=25) tggtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCg < 7:20209/90‑1 (MQ=38) gagggtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGcc < 3:326354/145‑1 (MQ=255) | GTGCGGTTGGCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCC > NC_002947/5293566‑5293855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |