Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,373,861 | C→A | 9.1% | V147F (GTC→TTC) | dapB ← | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,373,861 | 0 | C | A | 9.1% | 198.3 / 9.6 | 66 | V147F (GTC→TTC) | dapB | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/27); new base A (3/3); total (36/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.63e-01 |
CGGTTTGCCCTTCACGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCTTCGACTGTAAAACCGGTCGTGCC > NC_002947/5373717‑5374008 | cGGTTTGCCCTTCACGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGAcatca > 2:232040/1‑149 (MQ=255) gCCCTTCACGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGcc < 5:249277/148‑1 (MQ=255) gCCCTTCACGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGcc > 4:154766/1‑148 (MQ=255) cccTTCACGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCa < 3:17227/149‑1 (MQ=255) cccTTCACGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCa < 3:154766/149‑1 (MQ=255) ccTTCACGTCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATTAGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAg > 2:309918/1‑149 (MQ=255) ccTTCACGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAg > 6:242282/1‑149 (MQ=255) aCGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCAccc < 1:232040/149‑1 (MQ=255) gCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCCCGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGCCCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCcgcg > 5:339840/1‑149 (MQ=255) tgCCAATTCCTTCAGATCACGGCCCAGCGCATTGTCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCTCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATGTCGATATCGAAATCATCgaggc < 4:252632/130‑5 (MQ=255) ggCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATGTCGATATCGAAATCATCgaggc > 3:252632/1‑127 (MQ=255) gCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATc < 1:73113/149‑1 (MQ=255) gCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATc < 3:106840/149‑1 (MQ=255) gCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATc > 2:182348/1‑149 (MQ=255) cACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATc > 1:246769/1‑147 (MQ=255) cTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCagcagc < 5:242282/148‑1 (MQ=255) tGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATGTCGATATCGAAatcatc < 2:216176/116‑1 (MQ=255) tGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATGTCGATATCGAAatcatc > 1:216176/1‑116 (MQ=255) cAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCtt > 3:253169/1‑147 (MQ=255) cAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTg < 2:27785/148‑1 (MQ=255) cAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGa < 2:365215/149‑1 (MQ=255) aGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAg < 4:253169/149‑1 (MQ=255) aTCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGc > 6:18283/1‑149 (MQ=255) ggCCCCGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAgg < 6:123342/149‑1 (MQ=255) cccAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGtt > 2:136238/1‑149 (MQ=255) cAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGa > 1:45427/1‑149 (MQ=255) aGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGAc > 7:249936/1‑149 (MQ=255) aTTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCa < 2:246769/149‑1 (MQ=255) gCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑Ct < 4:87032/149‑1 (MQ=255) acccACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTg > 4:233969/3‑148 (MQ=255) aCCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTg > 3:178887/1‑147 (MQ=255) aCTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGtt > 2:197352/1‑149 (MQ=255) ttCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGGCCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTgg > 4:131592/1‑149 (MQ=255) aCCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTggcgg > 6:209408/1‑149 (MQ=255) ccATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCGAGCACCCGCGCCGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTggcggc > 6:272851/1‑148 (MQ=255) ccATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTggcggc > 5:304434/1‑148 (MQ=255) aagagcagtgcagtACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGACGGTGGTGCGCCTCGATCATTTCGACAACCACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCCGCAGCTAGAGGCGAAGCTTGACCCCCAC‑‑C‑CTGCAGTTGGCGGC‑G‑aa > 7:355900/5‑149 (MQ=255) gtgcagtACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGAtt < 3:233969/149‑1 (MQ=255) gtACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAAt < 1:197352/149‑1 (MQ=255) ccGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAAt > 5:311577/1‑145 (MQ=255) ccGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAAt < 6:311577/145‑1 (MQ=255) gcgcATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCa < 1:182348/149‑1 (MQ=255) cgcATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACACGAGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAA‑‑G‑AAGAAGTAGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAg > 8:205431/1‑149 (MQ=255) aTCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGGGCAGCCATATCCAGCAGCTAGAGGCTAAGGTTGACACCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑ACCACGATTGGAATGTGCTTGCCAGCCt > 8:316821/1‑149 (MQ=255) cGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCt > 3:124506/1‑147 (MQ=255) gACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCa < 8:249936/148‑1 (MQ=255) gACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAg > 2:329451/1‑149 (MQ=255) aCCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGTCTCAGc < 2:76059/149‑1 (MQ=255) aCCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGc < 6:304434/149‑1 (MQ=255) gtgCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCcaa < 3:349714/147‑1 (MQ=255) gtgCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGCTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCcaac < 1:309918/148‑1 (MQ=255) gCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCaacaac > 7:64930/1‑149 (MQ=255) ccGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCaacaac < 1:329451/148‑1 (MQ=255) ccGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACt < 5:209408/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTg < 5:18283/149‑1 (MQ=255) gcgcCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTctct > 7:324353/1‑149 (MQ=255) gcGATGATGTCGATATCGAAATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCa < 3:156336/119‑1 (MQ=255) gcGATGATGTCGATATCGAAATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCa > 4:156336/2‑120 (MQ=255) cGATGATTTCGATATCGACATCATCGCACAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGAGGC‑G‑AACACTATTGGAATGTCCTTGACAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCTTCGaag > 6:343634/1‑147 (MQ=255) gatgatTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGACATATACAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACGCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGACAACAACTGCTTCTCTTCGACt > 7:292340/1‑148 (MQ=255) atgatTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCTTCGACTGt < 5:343634/149‑1 (MQ=255) ttCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGAATGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCTTCGACTGTAAAAc > 5:7501/1‑149 (MQ=255) tCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCACTGGAGTGAAGTTGGCGGCAGAAACACGATTGGTATGTACTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTAATCGACTGt > 1:303016/1‑148 (MQ=255) atatCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCTTCGACTGTAAAACCGGt > 7:7829/1‑149 (MQ=255) tCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCTTCGACTGTAAAACCGGTCGt < 1:136238/149‑1 (MQ=255) gACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCTTCGACTGTAAAACCGGTCGTGc > 3:192044/1‑149 (MQ=255) aCATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAACTTGGCGGC‑G‑AACACCATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCATCGACTGTAAAAACGCTCGTGcc > 7:292262/1‑149 (MQ=255) | CGGTTTGCCCTTCACGGCCATACACGGCCACTTCCTGCAGATCACGGCCCAGCGCATTGGCAACCACTTCACCCATGCGCAGTGCAGTACCCGACGGCGCATCGACCTTGTGCCGGTGGTGCGCCTCGATGATTTCGATATCGACATCATCGCCCAGCACCCGCGCAGCCATATCCAGCAGCTTGAGGCTAAGGTTGACCCCCAC‑‑G‑CTGAAGTTGGCGGC‑G‑AACACGATTGGAATGTCCTTGCCAGCCTCAGCCAACAACTGCTTCTCTTCGACTGTAAAACCGGTCGTGCC > NC_002947/5373717‑5374008 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |