| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,427,288 | T→A | 8.6% | D272V (GAC→GTC) | rhlE‑I ← | ATP‑dependent RNA helicase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,427,288 | 0 | T | A | 8.6% | 186.5 / 6.7 | 69 | D272V (GAC→GTC) | rhlE‑I | ATP‑dependent RNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/33); new base A (3/3); total (32/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.66e-01 | |||||||||||
TCGAGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCAC > NC_002947/5427144‑5427433 | tCGAGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGc < 4:128649/149‑1 (MQ=255) ggTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTc < 2:242349/149‑1 (MQ=255) gacgacCAGCGGCAAGTCATCTATATCCAGTCCAAGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTTCACCTCACGGTCCTTGAAGCTGTACAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGGCACCGGGAATTCCGACGGCATACACg < 5:10661/148‑1 (MQ=255) gacgacCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGAATGCCGACGGCATCCACg < 8:114949/148‑1 (MQ=255) gaagacCAGCGGCAAGTCATCGAAATCCAGGCCACTTGCCGCCACATCTCTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTAGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGAATGCCGACGGCATCCACg < 5:10664/145‑1 (MQ=255) cgacCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCt < 2:233961/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCg < 7:169374/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCg < 7:143402/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCgg > 1:52140/1‑149 (MQ=255) cAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCCCCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAACCTGTCCAGCGCACGCTGCCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGc > 3:319776/1‑148 (MQ=255) aaGGCATCGATATCCAGGCCTCGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGGCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCaa < 7:208691/149‑1 (MQ=255) aTCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCt > 4:118584/1‑149 (MQ=255) cAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCt > 5:94268/1‑149 (MQ=255) aGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCt > 3:132844/1‑148 (MQ=255) gCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCt > 6:45080/1‑146 (MQ=255) gCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCt < 5:45080/146‑1 (MQ=255) gCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGAt < 3:118440/149‑1 (MQ=255) cGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGAc < 3:118584/149‑1 (MQ=255) gccgccACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGc > 8:151849/1‑148 (MQ=255) cgccACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCAt < 1:89633/149‑1 (MQ=255) gccACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCAtt < 3:4169/149‑1 (MQ=255) ccACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTg > 5:235751/1‑149 (MQ=255) cacaTCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGc < 4:132844/149‑1 (MQ=255) caTCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCgg < 6:371496/149‑1 (MQ=255) cGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCCCGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTgg < 5:360090/149‑1 (MQ=255) gCCACCAGCACTTGCTCCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCATCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGc < 4:319776/149‑1 (MQ=255) gCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGc > 7:71344/1‑149 (MQ=255) ccaccaGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCg < 2:52140/149‑1 (MQ=255) caccaGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCGCCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCg > 3:184552/1‑148 (MQ=255) accaGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGaa < 7:151849/149‑1 (MQ=255) gCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGaa < 5:234906/145‑1 (MQ=255) gCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGaa > 6:234906/1‑145 (MQ=255) ttGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCa > 1:18973/1‑149 (MQ=255) aCCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTg > 5:259103/1‑149 (MQ=255) ccTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGc > 4:351528/1‑149 (MQ=255) cTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCg > 4:128435/1‑123 (MQ=255) cTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCg < 3:128435/123‑1 (MQ=255) cTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCt < 4:65733/149‑1 (MQ=255) cTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCt > 3:92633/1‑149 (MQ=255) tCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCtt > 3:176098/1‑149 (MQ=255) tCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCtt > 6:341031/1‑149 (MQ=255) gCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAgcg > 5:192692/1‑149 (MQ=255) cTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCgct > 1:82107/1‑149 (MQ=255) tGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCgctgc > 2:149684/1‑149 (MQ=255) aaGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCtt < 6:94268/149‑1 (MQ=255) gCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCCTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTgc > 1:363060/1‑149 (MQ=255) tGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTgcgc < 4:176098/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCgca < 2:208025/148‑1 (MQ=255) gcACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTg < 6:235751/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCa < 8:71344/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGt < 1:149684/149‑1 (MQ=255) gTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGt > 1:184749/1‑148 (MQ=255) ttGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCGCCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCa < 4:184552/149‑1 (MQ=255) tgtgGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCgcagca > 6:131483/1‑127 (MQ=255) tgtgGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCgcagca < 5:131483/127‑1 (MQ=255) tgtgGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCtt > 3:338470/1‑149 (MQ=255) tgGGCGGTCTCCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCTGCAAGCGCTCCTCCAGGTGATCGTCGCGATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACGTGGTTGGAGCGCTGCTTGCGGAGCAGGTGGCAGAAGAGGTCTGGCTTg < 6:306227/148‑1 (MQ=255) cGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGctt < 4:92633/149‑1 (MQ=255) ggTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGcttc < 2:82107/149‑1 (MQ=255) ggTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGcttc < 5:341031/149‑1 (MQ=255) gTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGcttca > 7:148497/1‑148 (MQ=255) cGTGAATGCCGACGGCATCCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTc > 8:85589/1‑148 (MQ=255) gTGAATGCCGACGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCca > 4:229129/1‑149 (MQ=255) gTGAATGCCGACGGCATCCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCca > 3:229146/1‑149 (MQ=255) tGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGcagcag > 5:19925/1‑113 (MQ=255) tGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGcagcag < 6:19925/113‑1 (MQ=255) gTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAg > 5:225752/1‑117 (MQ=255) gTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAg < 6:225752/117‑1 (MQ=255) gTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCAc > 2:22956/1‑147 (MQ=255) | TCGAGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCAC > NC_002947/5427144‑5427433 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |