| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,473,809 | T→A | 5.6% | N329I (AAC→ATC) ‡ | proA ← | gamma‑glutamyl phosphate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,473,809 | 0 | T | A | 5.6% | 209.4 / 2.5 | 71 | N329I (AAC→ATC) ‡ | proA | gamma‑glutamyl phosphate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/34); new base A (2/2); total (35/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
GAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGCC > NC_002947/5473661‑5473955 | gAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGGTGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGt > 3:228369/1‑149 (MQ=255)gAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGt > 8:282502/1‑149 (MQ=255)gAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGt > 2:313440/1‑149 (MQ=255)gAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGt > 6:175829/1‑149 (MQ=255) cATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAgg > 1:188952/1‑149 (MQ=255) aTCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGc > 3:102576/1‑149 (MQ=255) cAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCg > 6:305549/1‑149 (MQ=255) cAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGACATGAACTGACTGGCTTCAACCTCGTGTTCTATGATTATCTAGTCGGTGTGGTGAGAGCCATATTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGGTCATGACGTc > 6:349350/1‑148 (MQ=255) aaaGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGa < 6:36037/149‑1 (MQ=255) aaaGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGACGGCCTGAACCAGGCCATCGa < 8:92774/149‑1 (MQ=255) aaGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGGCAGAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGag > 4:264898/1‑148 (MQ=255) atcAGGTCGTGGTGTTTTTCATGAACGTCGCCTAATCGATCTCAGCCATTTACTTACGGTCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTTGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGACGGCCTGAACCAGGCCATCGagc < 8:231466/147‑3 (MQ=255) aGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGAcc < 4:340316/149‑1 (MQ=255) aGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGGGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGAcc < 7:331553/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCAcgc > 2:128583/1‑149 (MQ=255) ggTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCAcgc < 3:356891/149‑1 (MQ=255) ggggTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAAt < 5:305549/149‑1 (MQ=255) gtgtTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGa < 5:363851/149‑1 (MQ=255) gtgtTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTAGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGa > 1:293416/1‑149 (MQ=255) ttGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACa < 2:293416/148‑1 (MQ=255) ttGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACa < 3:263305/148‑1 (MQ=255) aGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGa < 5:175829/148‑1 (MQ=255) ccGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCg < 7:282502/149‑1 (MQ=255) cGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATc > 3:309056/1‑147 (MQ=255) gACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAg < 1:128583/149‑1 (MQ=255) gCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTa < 4:102576/149‑1 (MQ=255) gCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCGTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACACGATCGCATCGAGGTa < 4:44093/149‑1 (MQ=255) cGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTAtt > 1:47435/1‑149 (MQ=255) cAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAg > 3:10929/1‑149 (MQ=255) gCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATTGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTc < 1:243365/149‑1 (MQ=255) aaCTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGc > 1:95159/1‑138 (MQ=255) aaCTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGc < 2:95159/138‑1 (MQ=255) cTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGGTGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCgg < 4:228369/149‑1 (MQ=255) aCGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTg < 2:188952/148‑1 (MQ=255) cGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTTGGTGGc < 4:184104/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGgcg > 6:234529/1‑149 (MQ=255) gtgtTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCtga < 1:313440/149‑1 (MQ=255) gtgtTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCtga < 5:187714/149‑1 (MQ=255) tgtTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTTTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCtgat < 7:56976/149‑1 (MQ=255) ttCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCtgatga < 7:216944/149‑1 (MQ=255) ttCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCggatga > 5:227403/1‑149 (MQ=255) gCTGTTGATCGTTGCGGGGTGGTGCGAGGCATAGTTGTTGATTTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACATGATCTCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATa < 3:54140/148‑1 (MQ=255) cTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGc > 2:27769/1‑149 (MQ=255) gatgatCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCt > 2:28572/1‑149 (MQ=255) gatgatCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCt > 7:315015/1‑149 (MQ=255) gatCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTgg < 5:234529/148‑1 (MQ=255) tCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTAGGCGCTGATGATAGCCTGGGTa > 8:139330/1‑149 (MQ=255) gTCGGTGTTGTGCGCGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCTAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑Ct < 5:349350/149‑1 (MQ=255) tCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTc < 2:47435/149‑1 (MQ=255) ggTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGAGGATAGCCTGGGTACG‑CTCg > 4:218134/1‑148 (MQ=255) tgtgGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTCGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCaa < 7:139330/149‑1 (MQ=255) gtgCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACcgc > 2:47403/1‑149 (MQ=255) gAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAg > 8:339705/1‑149 (MQ=255) aTAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCa > 8:351975/1‑149 (MQ=255) aTAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATAGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCGGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGTTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCa > 8:76990/1‑149 (MQ=255) gTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACg < 4:10929/148‑1 (MQ=255) tGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTtc > 5:182765/1‑149 (MQ=255) aTGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTtctc > 3:335790/1‑149 (MQ=255) tgtgCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTtctc < 1:28572/149‑1 (MQ=255) gtgGTCGACGGCCTGAACCAGGCCATCGAGCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCa > 3:147398/1‑149 (MQ=255) gtgCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCa > 5:229853/1‑149 (MQ=255) tgCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCa < 5:126887/148‑1 (MQ=255) tgCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCAc > 3:297002/1‑149 (MQ=255) gCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTg > 6:76610/1‑83 (MQ=255) gCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTg < 5:76610/83‑1 (MQ=255) cTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCa > 1:143550/1‑128 (MQ=255) cTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCa < 2:143550/128‑1 (MQ=255) tCGACGGCCTGAACCAGGCCATCGAGCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACg > 5:154148/1‑147 (MQ=255) gATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAgc > 3:262012/1‑149 (MQ=255) gATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTAGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAgc > 7:1789/1‑149 (MQ=255) cTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCggg > 1:328811/1‑149 (MQ=255) tGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTgatgat > 7:271782/1‑92 (MQ=255) tGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTgatgat < 8:271782/92‑1 (MQ=255) tGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGc > 6:231933/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACTCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGcc < 4:297002/148‑1 (MQ=255) | GAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACG‑CTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGCC > NC_002947/5473661‑5473955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |