Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,608,994 | G→C | 5.2% | R202G (CGC→GGC) | waaA ← | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic acid transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,608,994 | 0 | G | C | 5.2% | 313.0 / 5.4 | 96 | R202G (CGC→GGC) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic acid transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/46); new base C (3/2); total (48/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.33e-01 |
GCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTG > NC_002947/5608852‑5609139 | gCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGACTCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAg < 1:206860/149‑1 (MQ=255) aTCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGc > 4:52462/1‑149 (MQ=255) aTCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGc < 2:166353/149‑1 (MQ=255) cTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTAACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGt > 2:159007/1‑149 (MQ=255) cACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCa > 2:194857/1‑149 (MQ=255) aCCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCCCTGAGCGCGTGCaa < 1:164360/149‑2 (MQ=255) ccGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGc < 5:19389/142‑1 (MQ=255) ccGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGc > 6:19389/1‑142 (MQ=255) ccGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCAcc > 6:235375/1‑149 (MQ=255) cgtcgtGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCAccc < 4:196892/149‑1 (MQ=255) tcgtGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAg < 1:194857/149‑1 (MQ=255) gtGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGt > 3:362676/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCTCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACg > 5:116182/1‑149 (MQ=255) tGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGGCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACgg < 8:65152/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGGCAATCCACACACGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGa < 5:38220/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACgg > 7:197146/1‑147 (MQ=255) cTGGCGGCAATCCACACAGGCCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATCCTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACTCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGa < 5:43624/148‑1 (MQ=255) tGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTc > 3:361780/1‑142 (MQ=255) tGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTc < 4:361780/142‑1 (MQ=255) gcggcAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAgc < 3:362520/148‑1 (MQ=255) cAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTgg < 2:196635/149‑1 (MQ=255) cacacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCCCTGAGCGCGTGCaa > 3:84808/1‑123 (MQ=255) cacacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCCCTGAGCGCGTGCaa < 4:84808/124‑2 (MQ=255) cacacaGGGCGCTGGCCGCCCCCAAACTCTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTTTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTc < 6:116182/149‑1 (MQ=255) acacaGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCg > 7:179982/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg < 6:258054/149‑1 (MQ=255) cgcTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGt < 8:179982/149‑1 (MQ=255) gcTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCCGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTc > 6:173408/1‑149 (MQ=255) tGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑g > 1:40442/1‑149 (MQ=255) cgccCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACg > 5:302927/1‑149 (MQ=255) gccCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACgg < 5:235375/149‑1 (MQ=255) gccCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACgg < 8:197146/149‑1 (MQ=255) gccCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACgg > 3:304931/1‑149 (MQ=255) cgcccccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACgg < 4:253383/147‑1 (MQ=255) ccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg < 2:31399/134‑1 (MQ=255) ccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑Tc < 3:52462/149‑1 (MQ=255) ccAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGCCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCg > 1:31399/1‑134 (MQ=255) aCTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAgg < 2:40442/149‑1 (MQ=255) aCTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAgg > 2:273654/1‑149 (MQ=255) tCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAgg > 1:179054/1‑86 (MQ=255) tCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAgg < 2:179054/86‑1 (MQ=255) aCGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCAtct > 4:217587/1‑149 (MQ=255) aCGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCAtct > 2:291113/1‑149 (MQ=255) aCGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCAtc < 5:316450/148‑1 (MQ=255) gCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCg > 5:264545/1‑149 (MQ=255) gCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCg > 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cAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACgg < 5:199094/92‑1 (MQ=255) cAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACgg > 6:199094/1‑92 (MQ=255) aGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGc > 1:13459/1‑148 (MQ=255) gTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCATGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCAc > 5:295248/1‑149 (MQ=255) gTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCAc > 2:97847/1‑149 (MQ=255) gTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCAc < 3:217587/149‑1 (MQ=255) gTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCAc > 3:211053/1‑149 (MQ=255) cGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACgg > 5:10073/1‑149 (MQ=255) ttGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGcc > 2:183367/1‑147 (MQ=255) gAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCAGCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCt < 3:83094/148‑1 (MQ=255) gCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGTTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCt > 8:289870/1‑146 (MQ=255) ctgggtGCACGCCCTGAGCGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAg > 8:224134/6‑149 (MQ=255) gACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAgc > 4:82020/1‑149 (MQ=255) ttGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAgcgcg > 8:139123/1‑149 (MQ=255) ttGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAgcgcg > 1:236866/1‑149 (MQ=255) gCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAgcgcg < 7:139123/147‑1 (MQ=255) gCACGCCCTGAGCGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGAAAGGCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAgcgc > 1:111202/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCAtt < 3:82020/149‑1 (MQ=255) cgcgCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTg < 4:362676/149‑1 (MQ=255) cgcgCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTg < 4:115594/149‑1 (MQ=255) gcgcTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACggg < 7:314367/122‑1 (MQ=255) gcgcTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACggg > 8:314367/1‑122 (MQ=255) | GCATCTTCACCGTCGTGGGTGCTGGCGGCAATCCACACAGGGCGCTGGCCGCCCCCCAACTGTTCACGCAATGCCCTCGCGCGTGGCAGCAGCTGTTCGTCGATGGTCAGGTCGAACTTGA‑TCGAGCCGGTGACTTGCACGCGCTCAGGGCGTGCACCCAGGTCACGGAAGCGCTGGGCCTCGGTTTCGGTCT‑GCACGGCGA‑‑‑TCAGGCTCATCTCGGCCAGCATCGGCCGGGTCAGCCTGGCAAAGCGCCCATAGCCACGGGCCGAGCGCTCAGACAAGCGCGCATTG > NC_002947/5608852‑5609139 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |