| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,689,726 | A→T | 5.6% | P56P (CCT→CCA) | pilH ← | twitching motility protein PilH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,689,726 | 0 | A | T | 5.6% | 269.6 / 4.9 | 89 | P56P (CCT→CCA) | pilH | twitching motility protein PilH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/37); new base T (3/2); total (50/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.54e-01 | |||||||||||
CCGGTTTGGTCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGAGTCGTCGA > NC_002947/5689578‑5689874 | ccGGTTTGGTCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCa < 8:283161/149‑1 (MQ=255) cGGTTTGGTCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAg > 7:262469/1‑149 (MQ=255) gTTTGGTCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTAGCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTGCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGc < 3:238535/149‑1 (MQ=255) gTTTGGTCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAgg > 2:338135/1‑148 (MQ=255) gTCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGa < 3:353592/148‑1 (MQ=255) tCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAg < 1:127446/141‑1 (MQ=255) tCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAg > 2:127446/1‑141 (MQ=255) tCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGAc > 2:220142/1‑148 (MQ=255) aGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCTGGCATGaac > 5:166669/1‑145 (MQ=255) aGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCTGGCATGaac < 6:166669/147‑3 (MQ=255) aGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGAt > 3:126714/1‑149 (MQ=255) gAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCTGGCATGaacg < 6:289675/146‑4 (MQ=255) gAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCTGGCATGaacg > 5:289675/1‑143 (MQ=255) cccTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACcgc < 1:338135/149‑1 (MQ=255) gcgTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAAGCAAGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCggga > 4:38348/1‑148 (MQ=255) ggCCCAGATACCGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGt < 8:127577/149‑1 (MQ=255) gCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTc > 3:1306/1‑149 (MQ=255) ccAGATACGGTCGGTTTGCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGTAATAGAGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCt < 4:55310/149‑1 (MQ=255) ccAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCt > 2:246673/1‑149 (MQ=255) tcggtTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCgggccag < 5:43939/149‑1 (MQ=255) gtTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCgggccagggc > 6:9035/1‑149 (MQ=255) gtTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCgggccagggc > 4:82290/1‑149 (MQ=255) tttCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGATGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCgggccagggc > 3:81638/1‑148 (MQ=255) tttCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCgggccagcaac > 2:155850/1‑145 (MQ=255) tttCCTGGTCCTTGGTGGGTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCgggccagggcc < 6:98291/149‑1 (MQ=255) tCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCGATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCAc > 5:323700/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCAc > 4:287382/1‑149 (MQ=255) tCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCAc > 7:212431/1‑149 (MQ=255) cTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCAGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGACGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGc > 5:34049/1‑149 (MQ=255) tGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGc < 2:28766/93‑1 (MQ=255) tGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGc > 1:28766/1‑93 (MQ=255) ttGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCgg > 1:205675/1‑148 (MQ=255) tggtggTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCAt < 1:141244/100‑1 (MQ=255) tggtggTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCAt > 2:141244/1‑100 (MQ=255) ggtTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGAAGTCCATCAGCGCCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGt > 1:158462/1‑149 (MQ=255) gtTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGATGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGt < 4:209157/148‑1 (MQ=255) ccACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCt < 5:9035/148‑1 (MQ=255) ccACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTg < 2:38108/149‑1 (MQ=255) ccACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTg > 7:264148/1‑149 (MQ=255) ccACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTg > 4:50019/1‑149 (MQ=255) ccACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTAGGCACCGTTGCTg > 1:84163/1‑149 (MQ=255) cGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCg > 6:47703/1‑134 (MQ=255) cGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCg < 5:47703/134‑1 (MQ=255) gATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCt < 4:126714/149‑1 (MQ=255) tCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCtt > 5:176515/1‑148 (MQ=255) aCTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGa < 1:220142/148‑1 (MQ=255) tGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCa > 2:218004/1‑149 (MQ=255) gAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCAcc > 4:254984/1‑149 (MQ=255) aaTAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCg > 7:159964/1‑124 (MQ=255) aaTAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCg < 8:159964/124‑1 (MQ=255) aaTAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCt > 3:150510/1‑149 (MQ=255) aTAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTg > 5:177596/1‑149 (MQ=255) gcTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGGCGGCACCGTTGATGGCCTTGCGCAACTGGTAGc > 8:307260/1‑149 (MQ=255) tgtCCGTGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTTGCCTGGAAGCAGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGTCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGc < 1:240782/149‑1 (MQ=255) gtCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGc > 1:351721/1‑143 (MQ=255) gtCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGc < 2:351721/143‑1 (MQ=255) 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cTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGCGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTATCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACAtct < 4:1306/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTg > 2:216085/1‑149 (MQ=255) aaGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTa > 2:257996/1‑107 (MQ=255) aGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTc > 2:31662/1‑149 (MQ=255) gCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCg < 1:246673/149‑1 (MQ=255) ttgaTGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGa < 8:262469/146‑1 (MQ=255) ttCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGt < 2:171062/133‑1 (MQ=255) ttCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGt > 1:171062/1‑133 (MQ=255) ttCATGCCAGGCAGGACGATGTCCTTCAGCCCCGCTGCGGGCTTGTCCTGCCGGGCGAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCGAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGa < 2:158462/149‑1 (MQ=255) gtCATGCCTGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTACTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGc > 3:319977/2‑147 (MQ=255) aTGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGAgtc > 6:249033/1‑149 (MQ=255) cAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCATGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGAgtcgtc > 7:201887/1‑148 (MQ=255) cAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGAgtcgtc > 8:94570/1‑148 (MQ=255) cAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGAgtcgtc > 4:160647/1‑148 (MQ=255) aGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGAGTCGTCGa < 5:356204/149‑1 (MQ=255) | CCGGTTTGGTCAGGAAGTCACGGGCACCCTGGCGCGTGGCCCAGATACGGTCGGTTTCCTGGTCCTTGGTGGTTACCACGATCACTGGAATAGCGCTGGTGTCCGGGTCCTTGCTGAGCTGGCGGGTGGCCTGGAAGCCGTTCATGCCAGGCATGACGATGTCCATCAGCACCGCGTCGGGCTTGTCCTGCCGGGCCAGGGCCACGCCGTCGGCACCGTTGCTGGCCTTGAGCACCTGGTAGCCGTGCTTTTCCAGCCATTCGGTCAATCTGTACATCTCTGTCGGCGAGTCGTCGA > NC_002947/5689578‑5689874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |