Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,791,128 | A→T | 6.0% | I197N (ATC→AAC) ‡ | hemE ← | uroporphyrinogen decarboxylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,791,128 | 0 | A | T | 6.0% | 208.7 / 2.5 | 67 | I197N (ATC→AAC) ‡ | hemE | uroporphyrinogen decarboxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/33); new base T (2/2); total (32/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.95e-01 |
GATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTC > NC_002947/5790980‑5791271 | gATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGa > 1:149786/1‑149 (MQ=255) aCCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTg < 7:26880/149‑1 (MQ=255) cGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGc < 4:312069/149‑1 (MQ=255) gCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGATCCTGGCCg < 8:192855/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAgg < 7:104657/148‑1 (MQ=255) cgcCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGt < 7:348617/148‑1 (MQ=255) ccTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTg < 2:181039/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGTCCAGGGATAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCTCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTg < 8:39622/148‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGt < 3:58232/147‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCAGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGt < 5:67177/147‑1 (MQ=255) tGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGAc < 3:117323/149‑1 (MQ=255) tCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCAGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCAGGCCGTTTAGGTAGCGGGTGACCGa > 8:276075/1‑149 (MQ=255) cgcgGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGAc > 7:348295/1‑149 (MQ=255) cgcgGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGATCCTGGCCgg < 2:23661/129‑2 (MQ=255) cgcgGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGATCCTGGCCgg > 1:23661/1‑128 (MQ=255) gcgGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGa < 8:167045/147‑1 (MQ=255) gcgGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGAc < 5:146847/148‑1 (MQ=255) aGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCGTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAg < 6:303028/149‑1 (MQ=255) cGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTg < 8:184306/149‑1 (MQ=255) cGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTg > 8:142591/1‑149 (MQ=255) gCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGt > 8:167795/1‑149 (MQ=255) cTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTgg > 4:129223/1‑138 (MQ=255) cTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTgg < 3:129223/138‑1 (MQ=255) tGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTgg > 7:101635/1‑126 (MQ=255) tGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTgg < 8:101635/126‑1 (MQ=255) gATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcag > 6:182402/1‑147 (MQ=255) gcgcATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcagcagcag < 8:324665/147‑1 (MQ=255) gcgcATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAgg < 8:348295/148‑1 (MQ=255) cgcATGGAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGTATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTg < 8:120442/149‑1 (MQ=255) gTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCca < 5:139962/134‑1 (MQ=255) gTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCca > 6:139962/1‑134 (MQ=255) ccAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGc > 6:144446/1‑149 (MQ=255) aGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCgg > 6:384678/1‑149 (MQ=255) ggAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCtt < 8:198693/143‑1 (MQ=255) ggAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCtt > 7:198693/1‑143 (MQ=255) gagaACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGtt < 2:176282/149‑1 (MQ=255) tCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGAGCGACTGGGCCAGCTTGTGCTGGTGGTGGTGGTGGGGTTGGGGGTTGTGGtt > 2:149816/1‑148 (MQ=255) tCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCggg < 3:258587/141‑1 (MQ=255) tCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCggg > 4:258587/1‑141 (MQ=255) cTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAgg > 4:177549/1‑149 (MQ=255) cTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCAGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGATAAGGTAGCTGGTGACCGACTCGGCCAGCTTGTCCAGCAGCCGGTGCACGGCTTGCGGGTTGTCGTAgg > 7:62898/1‑149 (MQ=255) tGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGc > 3:123879/1‑149 (MQ=255) ggCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATgg < 7:167795/149‑1 (MQ=255) ccgccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGcc > 5:100256/1‑149 (MQ=255) gccgccgACAGGTTGCCGCTCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCa < 1:146043/142‑1 (MQ=255) gccgccgACAGGTTGCCGCTCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCa > 2:146043/1‑142 (MQ=255) ccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTg < 7:211112/149‑1 (MQ=255) aCAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTg > 1:338496/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGc < 7:132911/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCgg > 5:105545/1‑148 (MQ=255) ttGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGGTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTTCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGaa < 2:340315/149‑1 (MQ=255) gccCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCggg > 3:245491/1‑112 (MQ=255) gccCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCggg < 4:245491/112‑1 (MQ=255) cccTGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTACGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGTTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTc < 3:222954/149‑1 (MQ=255) cccAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTc < 7:276075/149‑1 (MQ=255) cAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTcga < 4:123879/149‑1 (MQ=255) gAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCCGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTAGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGAGGAAGTCCTTCGACGAgccgc > 4:49448/1‑149 (MQ=255) gAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAgccgc > 5:100162/1‑149 (MQ=255) gAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAgccgc > 7:13809/1‑149 (MQ=255) cTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGa > 3:20795/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgta < 5:144446/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtag > 6:356398/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtag < 6:105545/149‑1 (MQ=255) tGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtagg > 2:359629/1‑148 (MQ=255) acGGCCAGATCCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAg > 7:105568/2‑149 (MQ=255) ggCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTAGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAggg > 2:145944/1‑149 (MQ=255) cAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGCCCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTc > 8:185038/1‑148 (MQ=255) gATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTcg > 6:321007/1‑110 (MQ=255) | GATCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTC > NC_002947/5790980‑5791271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |